Sample name | PdE3_MI | PdE3_NI | PdF6_MI | PdF6_NI |
---|---|---|---|---|
Total reads | 40462740 | 44233860 | 43540794 | 47325648 |
Total mapped | 37182159 (91.89Â %) | 40670207 (91.94Â %) | 40389548 (92.76Â %) | 44003316 (92.98Â %) |
Multiple mapped | 268916 (0.66Â %) | 284883 (0.64Â %) | 517276 (1.19Â %) | 437468 (0.92Â %) |
Uniquely mapped | 36913243 (91.23Â %) | 40385324 (91.3Â %) | 39872272 (91.57Â %) | 43565848 (92.06Â %) |
Read-1 | 18514101 (45.76Â %) | 20278703 (45.84Â %) | 19998128 (45.93Â %) | 21861625 (46.19Â %) |
Read-2 | 18399142 (45.47Â %) | 20106621 (45.46Â %) | 19874144 (45.64Â %) | 21704223 (45.86Â %) |
Reads map to ‘ + ’ | 18438317(45.57 %) | 20164702 (45.59 %) | 19923475 (45.76 %) | 21777326 (46.02 %) |
Reads map to ‘-’ | 18474926 (45.66 %) | 20220622 (45.71 %) | 19948797 (45.82 %) | 21788522 (46.04 %) |
Non-splice reads | 30579359 (75.57Â %) | 33256246 (75.18Â %) | 33435379 (76.79Â %) | 36873244 (77.91Â %) |
Splice reads | 6333884 (15.65Â %) | 7129078 (16.12Â %) | 6436893 (14.78Â %) | 6692604 (14.14Â %) |