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Table 6 miRNAs levels in PDXs tissues

From: Novel method to detect microRNAs using chip-based QuantStudio 3D digital PCR

Sample

Assay

cel-mir-39

CI- cel-mir-39

Target miRNA

CI- miRNA

Data points above threshold (0.5)

PDX 1

16–39

430,6

418 -- 443,5

968,4

946,9 -- 990,4

14,289 of 18,775

PDX1

486-39

682,8

666,8 -- 699,1

45,2

41,8 -- 48,9

15,843 of 18,068

PDX 1

660-39

521,2

507,9 -- 534,9

18,8

16,7 -- 21,2

16,106 of 18,346

PDX 1 1:10

16–39

122,4

105,8 -- 141,7

162,29

155,7 -- 169,2

18,068 of 19,395

PDX1 1:10

486-39

58,0

54,3 -- 62,1

2,93

2,2 -- 3,9

17,381 of 19,135

PDX1 1:10

660-39

52,7

47,5 -- 58,4

1,72

0,9 -- 3,0

17,868 of 18,826

PDX 2

16–39

601,9

586,6 -- 617,7

937,7

916,8 -- 958,9

14,472 of 16,749

PDX 2

486-39

532,9

520,1 -- 546,1

23,8

21,5 -- 26,4

17,831 of 19,264

PDX 2

660-39

441,6

426,6 -- 457,2

23,2

20,2 -- 26,5

10,233 of 15,163

PDX 2 1:10

16–39

59,7

55,9 -- 63,8

134,7

128,8 -- 140,9

17,341 of 19,135

PDX 2 1:10

486-39

57,5

53,2 -- 62,2

1,5

0,9 -- 2,4

13,040 of 18,311

PDX 2 1:10

660-39

62,3

58,3 -- 66,4

2,8

2,1 -- 3,8

17,358 of 19,226

PDX3

16–39

83,5

78,9 -- 88,4

798,1

781,0 -- 815,5

17,174 of 19,355

PDX3

486-39

104,7

98,6 -- 111,2

9,9

8,2 -- 12,0

12,183 of 18,035

PDX3

660-39

86,1

81,5 -- 91,1

9,0

7,6 -- 10,7

17,004 of 18,146

PDX3 1:10

16–39

12,9

11,2 -- 14,8

90,5

85,6 -- 95,5

17,089 of 18,817

PDX3 1:10

486-39

7,3

6,7-- 8,7

0,5

0,3 -- 1,0

17,966 of 19,844

PDX3 1:10

660-39

7,7

6,4 -- 9,2

0,5

0,3-- 1,1

17,509 of 19,282