Table 2 sRNA comparison
R. bellii OSU | R. bellii RML | R. canadensis | R. prowazekii Madrid | R. prowazekii Breinl | R. typhi | R. felis | R. akari | R. rickettsii SS | R. rickettsii IA | R. conorii | R. africae | R. heilongjiangensis | R. japonica | R. massiliae | R. peacocki | |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Ancestral | ||||||||||||||||
R. bellii OSU | ---------- | 86 | 5 | 4 | 4 | 4 | 58 | 6 | 20 | 24 | 26 | 19 | 23 | 22 | 14 | 32 |
R. bellii RML | ---------- | 4 | 4 | 4 | 4 | 60 | 7 | 21 | 24 | 33 | 21 | 28 | 25 | 15 | 37 | |
R. canadensis | ---------- | 3 | 3 | 3 | 11 | 8 | 6 | 5 | 6 | 6 | 5 | 7 | 8 | 3 | ||
Typhus | ||||||||||||||||
R. prowazekii Madrid E | ---------- | 31 | 7 | 5 | 4 | 5 | 3 | 5 | 5 | 3 | 2 | 4 | 2 | |||
R. prowazekii Breinl | ---------- | 7 | 5 | 4 | 5 | 3 | 5 | 5 | 3 | 2 | 4 | 2 | ||||
R. typhi | ---------- | 3 | 3 | 3 | 4 | 3 | 3 | 1 | 1 | 3 | 1 | |||||
Transitional | ||||||||||||||||
R. felis | ---------- | 67 | 85 | 65 | 86 | 90 | 78 | 84 | 86 | 91 | ||||||
R. akari | ---------- | 37 | 34 | 42 | 41 | 41 | 36 | 39 | 38 | |||||||
Spotted fever | ||||||||||||||||
R. rickettsii SS | ---------- | 120 | 98 | 103 | 88 | 98 | 87 | 98 | ||||||||
R. rickettsii IA | ---------- | 103 | 106 | 96 | 107 | 94 | 105 | |||||||||
R. conorii | ---------- | 126 | 93 | 102 | 94 | 111 | ||||||||||
R. africae | ---------- | 100 | 118 | 104 | 121 | |||||||||||
R. heilongjiangensis | ---------- | 136 | 82 | 98 | ||||||||||||
R. japonica | ---------- | 93 | 109 | |||||||||||||
R. massiliae | ---------- | 92 | ||||||||||||||
R. peacocki | ---------- |