Table 1 Analysis of small RNA sequences and degradome sequences from NJCMS1A and NJCMS1B
Type | small RNA-Seq | Degradome-Seq | ||||
|---|---|---|---|---|---|---|
NJCMS 1A | NJCMS 1B | NJCMS 1A | NJCMS 1B | |||
Statistical Information | Total tags | 12104688 (100.00Â %) | 12096551 (100.00Â %) | 12351703 (100.00Â %) | 12671179 (100.00Â %) | |
Clean tags | 11974839 (98.93Â %) | 12058427 (99.68Â %) | 12288476 (99.49Â %) | 12613736 (99.55Â %) | ||
Genome Mapping Statistics | Total Count of Clean Tags | Total tags | 11974839 (100.00Â %) | 12058427 (100.00Â %) | 12288476 (100.00Â %) | 12613736 (100.00Â %) |
Mapping to genome | 9824678 (82.04Â %) | 9758494 (80.93Â %) | 10954689 (89.15Â %) | 11289967 (89.51Â %) | ||
Unique Count of Clean Tags | Total tags | 3668753 (100.00Â %) | 4122100 (100.00Â %) | 6332697 (100.00Â %) | 5445882 (100.00Â %) | |
Mapping to genome | 2687857 (73.26Â %) | 3142047 (76.22Â %) | 5500905 (86.87Â %) | 4663560 (85.63Â %) | ||