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Table 6 Annotation of differentially expressed genes encoding secreted proteins

From: A Colletotrichum graminicola mutant deficient in the establishment of biotrophy reveals early transcriptional events in the maize anthracnose disease interaction

  Total (Annotated + Non-annotated) Non-annotated
  Total Secreted SSP SSP-CR Membrane Total Secreted SSP SSP-CR Membrane
TOTAL GENOME 12,006 1650
13.7 %a
687
5.7 %a
251
2.1 %a
1689
14.1 %a
NA NA NA NA NA
WTAP_WTBT_up 293 84
28.7 %a
43
14.7 %a
18
6.1 %a
70
23.9 %a
129
44 %b
43
51.2 %b
30
69.8 %b
13
72.2 %b
30
42.9 %b
WTAP_WTBT_dn 467 189
40.1 %
62
13.3 %
21
4.5 %
103
22.1 %
140
30 %
55
29.1 %
33
53.2 %
14
66.7 %
28
27.2 %
WTBT_WTNT_up 312 121
38.8 %
62
19.9 %
31
9.9 %
64
20.5 %
161
51.6 %
67
55.4 %
48
77.4 %
25
80.6 %
32
50 %
WTBT_WTNT_dn 680 208
30.6 %
74
10.9 %
23
3.4 %
127
18.7 %
241
35.4 %
53
25.5 %
32
43.2 %
14
60.9 %
36
28.3 %
MTAP_MTBT_dn 20 10
50 %
4
20 %
1
5 %
1
5 %
5
25 %
0 0 0 1
100 %
WTAP_MTAP_up 74 28
37.8 %
17
23 %
9
12.2 %
10
13.5 %
43
58.1 %
16
57.1 %
13
76.5 %
7
77.8 %
5
50 %
WTAP_MTAP_dn 144 27
18.8 %
7
4.9 %
1
0.7 %
17
11.8 %
58
40.3 %
11
40.7 %
6
85.7 %
1
100 %
5
29.4 %
WTBT_MTBT_up 192 98
51 %
29
15.1 %
12
6.3 %
44
22.9 %
64
33.3 %
32
32.7 %
18
62.1 %
9
75 %
7
15.9 %
WTBT_MTBT_dn 522 116
22.2 %
43
8.2 %
12
2.3 %
111
21.3 %
290
55.6 %
62
53.4 %
33
76.7 %
11
91.7 %
64
57.7 %
TOTAL 2704 881
32.6 %
341
12.6 %
128
4.7 %
547
20.2 %
1131
41.8 %
339
38.5 %
213
62.5 %
94
73.4 %
208
38 %
  1. aPercentage of total genes within the same comparison or dataset
  2. bPercentage of total differentially expressed genes in the same category within the comparison