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Table 6 Annotation of differentially expressed genes encoding secreted proteins

From: A Colletotrichum graminicola mutant deficient in the establishment of biotrophy reveals early transcriptional events in the maize anthracnose disease interaction

  Total (Annotated + Non-annotated) Non-annotated
  Total Secreted SSP SSP-CR Membrane Total Secreted SSP SSP-CR Membrane
TOTAL GENOME 12,006 1650 13.7 %a 687 5.7 %a 251 2.1 %a 1689 14.1 %a NA NA NA NA NA
WTAP_WTBT_up 293 84 28.7 %a 43 14.7 %a 18 6.1 %a 70 23.9 %a 129 44 %b 43 51.2 %b 30 69.8 %b 13 72.2 %b 30 42.9 %b
WTAP_WTBT_dn 467 189 40.1 % 62 13.3 % 21 4.5 % 103 22.1 % 140 30 % 55 29.1 % 33 53.2 % 14 66.7 % 28 27.2 %
WTBT_WTNT_up 312 121 38.8 % 62 19.9 % 31 9.9 % 64 20.5 % 161 51.6 % 67 55.4 % 48 77.4 % 25 80.6 % 32 50 %
WTBT_WTNT_dn 680 208 30.6 % 74 10.9 % 23 3.4 % 127 18.7 % 241 35.4 % 53 25.5 % 32 43.2 % 14 60.9 % 36 28.3 %
MTAP_MTBT_dn 20 10 50 % 4 20 % 1 5 % 1 5 % 5 25 % 0 0 0 1 100 %
WTAP_MTAP_up 74 28 37.8 % 17 23 % 9 12.2 % 10 13.5 % 43 58.1 % 16 57.1 % 13 76.5 % 7 77.8 % 5 50 %
WTAP_MTAP_dn 144 27 18.8 % 7 4.9 % 1 0.7 % 17 11.8 % 58 40.3 % 11 40.7 % 6 85.7 % 1 100 % 5 29.4 %
WTBT_MTBT_up 192 98 51 % 29 15.1 % 12 6.3 % 44 22.9 % 64 33.3 % 32 32.7 % 18 62.1 % 9 75 % 7 15.9 %
WTBT_MTBT_dn 522 116 22.2 % 43 8.2 % 12 2.3 % 111 21.3 % 290 55.6 % 62 53.4 % 33 76.7 % 11 91.7 % 64 57.7 %
TOTAL 2704 881 32.6 % 341 12.6 % 128 4.7 % 547 20.2 % 1131 41.8 % 339 38.5 % 213 62.5 % 94 73.4 % 208 38 %
  1. aPercentage of total genes within the same comparison or dataset
  2. bPercentage of total differentially expressed genes in the same category within the comparison