Skip to main content

Advertisement

Table 3 Genotypes and their corresponding frequencies where the lack of phasing information leads to alternative outcomes (Group A or B). The relative likelihood of A vs. B is estimated based on allele frequencies

From: ABO allele-level frequency estimation based on population-scale genotyping by next generation sequencing

Case # Case Allele group 1a Allele group 2a Allele group 1b Allele group 2b Relative likelihood Subgroup relevance
  Frequency Identifier Frequency Identifier Frequency Identifier Frequency Identifier Frequency a/b  
1 12.545 % O.01.01 31.772 % O.02.01* 18.479 % O.01.11* 0.014 % O.02.02* 0.137 % 298,326 No
2 8.092 % A1.01.01* 20.286 % O.02.01* 18.479 % Ax.02.02 0.015 % O.02.02* 0.137 % 187,949 Yes
3 4.511 % A2.01.01* 6.588 % O.01.01 31.772 % A1.01.01* 20.286 % O.01.06 0.017 % 617 Yes
4 3.250 % B1.01.01* 8.420 % O.02.01* 18.479 % Ax.02.01 0.006 % O.02.14 0.008 % 3,313,940 Yes
5 2.868 % A1.01.01* 20.286 % A2.01.01* 6.588 % A1.02.01 0.101 % A2.06.01 0.204 % 6,501 No
6 1.095 % O.01.01 31.772 % O.02.15* 1.610 % O.01.14 0.033 % O.02.05 0.008 % 193,859 No
7 0.113 % O.01.01 31.772 % O.09.01 0.163 % O.01.05 0.033 % O.09.03 0.005 % 30,220 No
8 0.071 % A1.02.01 0.101 % O.01.01 31.772 % A1.01.01* 20.286 % O.01.05 0.033 % 5 No
9 0.068 % A1.01.01* 20.286 % O.09.01 0.163 % A1.02.01 0.101 % O.09.03 0.005 % 6,284 No
10 0.027 % A2.01.01* 6.588 % O.01.05 0.033 % A1.02.01 0.101 % O.01.06 0.017 % 128 Yes
11 0.026 % B1.01.01* 8.420 % O.02.02* 0.137 % A1.01.02 0.023 % O.02.14 0.008 % 6,271 Yes
12 0.016 % O.01.01 31.772 % O.02.06 0.023 % O.01.10 0.006 % O.02.02* 0.137 % 853 No
13 0.010 % A1.01.02 0.023 % O.02.01* 18.479 % Ax.02.01 0.006 % O.02.02* 0.137 % 528 Yes
14 0.007 % Ax.02.02 0.015 % O.01.01 31.772 % A1.01.01* 20.286 % O.01.11* 0.014 % 2 Yes
15 0.005 % A1.02.01 0.101 % O.02.15* 1.610 % A2.20.01 0.013 % O.02.05 0.008 % 1,515 Yes
16 0.003 % O.01.10 0.006 % O.02.01* 18.479 % O.01.11* 0.014 % O.02.06 0.023 % 350 No
17 0.002 % A1.01.01* 20.286 % Ax.02.01 0.006 % A1.01.02 0.023 % Ax.02.02 0.015 % 356 No
18 0.002 % A1.01.01* 20.286 % Aw.25.01 0.005 % A1.02.01 0.101 % A3.02.01 0.454 % 2 Yes
19 0.002 % A1.01.01* 20.286 % B1.01.02 0.008 % A1.01.02 0.023 % B1.01.05 0.924 % 8 No
20 0.002 % Aw.25.01 0.005 % O.01.01 31.772 % A3.02.01 0.454 % O.01.05 0.033 % 10 Yes
21 0.001 % A1.01.02 0.023 % A2.01.01* 6.588 % A1.02.03 0.228 % A2.06.01 0.204 % 3 No
22 0.001 % A2.01.01* 6.588 % O.01.11* 0.014 % Ax.02.02 0.015 % O.01.06 0.017 % 389 Yes
23 0.001 % A1.01.01* 20.286 % Aw.01.01 0.004 % A2.06.01 0.204 % A2.17.01 0.005 % 78 Yes
24 0.001 % A2.01.01* 6.588 % O.09.03 0.005 % A2.06.01 0.204 % O.09.01 0.163 % 1 No
  1. *Allele groups as defined here are marked by an asterisk throughout the text