Skip to main content

Table 1 Prevalence and proportions of FGIs and FMIs for each of the sampled genera of the Enterobacteriaceae

From: Flashy flagella: flagellin modification is relatively common and highly versatile among the Enterobacteriaceae

Genus Clade Strains Species FGI FGI types FMI
Arsenophonus S 3 1 0 (0 %) - 0 (0 %)
Brenneria L 2 2 1 (50 %) 1 0 (0 %)
Buchnera T 15 1 0 (0 %) - 0 (0 %)
Budvicia Q 1 1 0 (0 %) - 0 (0 %)
Buttiauxella I 2 1 0 (0 %) - 0 (0 %)
Cedecea I 6 3 6 (100 %) 2 0 (0 %)
Citrobacter C/D 43 10 2 (5 %) 1 8 (19 %)
Cronobacter I 60 6 60 (100 %) 3 0 (0 %)
Dickeya L 44 9 44 (100 %) 4 0 (0 %)
Edwardsiella M 20 5 0 (0 %) - 0 (0 %)
Enterobacter F 252 14 66 (26 %) 10 35 (14 %)
Erwinia K 32 11 8 (25 %) 4 1 (3 %)
Escherichia A 136 7 0 (0 %) - 0 (0 %)
Ewingella O 1 1 0 (0 %) - 1 (100 %)
Franconibacter I 8 2 0 (0 %) - 8 (100 %)
Hafnia M 8 2 0 (0 %) - 0 (0 %)
Klebsiella E 279 5 0 (0 %) - 0 (0 %)
Kluyvera E 2 2 0 (0 %) - 0 (0 %)
Kosakonia H 11 8 11 (100 %) 5 0 (0 %)
Leclercia F 2 1 1 (50 %) 1 0 (0 %)
Lelliottia F 1 1 1 (100 %) 1 0 (0 %)
Leminorella Q 1 1 0 (0 %) - 0 (0 %)
Lonsdalea L 4 2 4 (100 %) 2 0 (0 %)
Mangrovibacter J 1 1 1 (100 %) 1 0 (0 %)
Moellerella S 1 1 0 (0 %) - 0 (0 %)
Morganella S 14 1 0 (0 %) - 0 (0 %)
Pantoea K 56 16 37 (66 %) 8 12 (21 %)
Pectobacterium L 52 5 45 (87 %) 11 6 (12 %)
Phaseolibacter K 1 1 0 (0 %) - 0 (0 %)
Photorhabdus S 14 4 0 (0 %) - 0 (0 %)
Plesiomonas R 3 1 3 (100 %) 3 0 (0 %)
Pluralibacter F 10 1 0 (0 %) - 0 (0 %)
Pragia Q 1 1 0 (0 %) - 0 (0 %)
Proteus S 43 4 0 (0 %) - 0 (0 %)
Providencia S 22 6 0 (0 %) - 0 (0 %)
Rahnella O 4 1 0 (0 %) - 0 (0 %)
Raoultella E 11 2 0 (0 %) - 0 (0 %)
Rouxiella O 1 1 0 (0 %) - 0 (0 %)
Salmonella B 103 2 0 (0 %) - 103 (100 %)
Serratia N 111 12 0 (0 %) - 0 (0 %)
Shigella A 243 4 0 (0 %) - 0 (0 %)
Shimwellia J 1 1 0 (0 %) - 0 (0 %)
Siccibacter I 4 2 4 (100 %) 1 0 (0 %)
Sodalis L 3 3 0 (0 %) - 0 (0 %)
Tatumella K 4 3 1 (25 %) 1 0 (0 %)
Trabulsiella G 8 2 8 (100 %) 1 0 (0 %)
Wigglesworthia T 4 2 0 (0 %) - 0 (0 %)
Xenorhabdus S 25 8 0 (0 %) - 0 (0 %)
Yersinia P 324 19 1 (0.3 %) 1 128 (40 %)
Yokenella F 3 2 3 (100 %) 2 0 (0 %)
  1. The clade in the family-wide phylogeny (Fig. 1) in which they occur is indicated, as well as the number of different FGI types for each FGI+ genus
  2. The number of strains and % of the total strains analysed for each genus containing FGIs and FMIs are indicated in bold