From: Comparative structural analysis of Bru1 region homeologs in Saccharum spontaneum and S. officinarum
Species | NO | BAC ID | Length (Kb) | GC content | Transposable elements | Gene number | ||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
LTR | Non-LTR | Transposons | ||||||
S. officinarum (LA Purple) | 1 | 146H19 | 77.5 | 44.7Â % | 16.91Â % | 1.92Â % | 29.47Â % | 8 |
2 | 99P01 | 74.4 | 44.2Â % | 35.94Â % | 2.46Â % | 28.97Â % | 7 | |
3 | 96B11 | 101.3 | 46.8Â % | 35.12Â % | 0.05Â % | 24.55Â % | 8 | |
4 | 57E04 | 95.3 | 45.0Â % | 34.90Â % | 3.57Â % | 16.42Â % | 8 | |
S. spontaneum (AP85-441) | 5 | 75D04 | 72.0 | 44.7Â % | 11.13Â % | 6.57Â % | 36.23Â % | 10 |
6 | 23Â K06 | 127.7 | 45.3Â % | 26.66Â % | 4.70Â % | 25.31Â % | 11 | |
Average | 91.5 | 45.2Â % | 27.48Â % | 3.20Â % | 26.16Â % | 8.7 | ||
Average (LA) | Â | Â | 31.19Â % | 1.94Â % | 24.36Â % | Â | ||
Average (SES) | Â | Â | 21.02Â % | 6.14Â % | 29.27Â % | Â | ||
Total | 549 | - | Â | Â | Â | 52 |