Skip to main content

Table 1 Summary of the sequence length, GC content, transposable element content, and gene number

From: Comparative structural analysis of Bru1 region homeologs in Saccharum spontaneum and S. officinarum

Species

NO

BAC ID

Length (Kb)

GC content

Transposable elements

Gene number

LTR

Non-LTR

Transposons

S. officinarum (LA Purple)

1

146H19

77.5

44.7 %

16.91 %

1.92 %

29.47 %

8

2

99P01

74.4

44.2 %

35.94 %

2.46 %

28.97 %

7

3

96B11

101.3

46.8 %

35.12 %

0.05 %

24.55 %

8

4

57E04

95.3

45.0 %

34.90 %

3.57 %

16.42 %

8

S. spontaneum (AP85-441)

5

75D04

72.0

44.7 %

11.13 %

6.57 %

36.23 %

10

6

23 K06

127.7

45.3 %

26.66 %

4.70 %

25.31 %

11

Average

91.5

45.2 %

27.48 %

3.20 %

26.16 %

8.7

Average (LA)

  

31.19 %

1.94 %

24.36 %

 

Average (SES)

  

21.02 %

6.14 %

29.27 %

 

Total

549

-

   

52