Skip to main content

Table 1 Summary of the sequence length, GC content, transposable element content, and gene number

From: Comparative structural analysis of Bru1 region homeologs in Saccharum spontaneum and S. officinarum

Species NO BAC ID Length (Kb) GC content Transposable elements Gene number
LTR Non-LTR Transposons
S. officinarum (LA Purple) 1 146H19 77.5 44.7 % 16.91 % 1.92 % 29.47 % 8
2 99P01 74.4 44.2 % 35.94 % 2.46 % 28.97 % 7
3 96B11 101.3 46.8 % 35.12 % 0.05 % 24.55 % 8
4 57E04 95.3 45.0 % 34.90 % 3.57 % 16.42 % 8
S. spontaneum (AP85-441) 5 75D04 72.0 44.7 % 11.13 % 6.57 % 36.23 % 10
6 23 K06 127.7 45.3 % 26.66 % 4.70 % 25.31 % 11
Average 91.5 45.2 % 27.48 % 3.20 % 26.16 % 8.7
Average (LA)    31.19 % 1.94 % 24.36 %  
Average (SES)    21.02 % 6.14 % 29.27 %  
Total 549 -     52