Table 5 The feature of syntenic genes on Saccharum and sorghum bacterial artificial chromosome (BAC) clones

Gene1

DNA

810

813

-

-

813

-

-

-

-

-

-

996

-

561

Exons

1

1

-

-

1

-

-

-

-

-

-

2

-

1

cDNA

810

813

-

-

813

-

-

-

-

-

-

741

-

561

Amino acids

269

270

-

-

270

-

-

-

-

-

-

246

-

186

Gene2

DNA

1180

1195

-

-

1195

1195

1192

-

-

-

-

1195

-

1192

Exons

2

2

-

-

2

2

2

-

-

-

-

2

-

2

cDNA

1086

1101

-

-

1101

1101

1098

-

-

-

-

1101

-

1098

Amino acids

361

366

-

-

366

366

365

-

-

-

-

366

-

365

Gene3

DNA

3216

3214

-

-

3223^a

3356

3449

-

-

-

-

3203

-

3193

Exons

7

7

-

-

7

7

7

-

-

-

-

7

-

7

cDNA

948

948

-

-

953^a

948

975

-

-

-

-

948

-

975

Amino acids

315

315

-

-

-^a

315

324

-

-

-

-

315

-

324

Gene4

DNA

3894

8712

-

-

3910

3516

3888

-

-

-

-

3515

-

3330

Exons

10

10

-

-

10

10

10

-

-

-

-

10

-

10

cDNA

1002

1002

-

-

1002

993

960

-

-

-

-

1002

-

1032

Amino acids

333

333

-

-

333

330

319

-

-

-

-

333

-

343

Gene5

DNA

6972^a

6954^a

-

-

12770

7312

7912

-

-

-

7328

7300

-

6964

Exons

14^a

14^a

-

-

14

14

14

-

-

-

14

14

-

14

cDNA

2706^a

2671^a

-

-

2667

2676

2676

-

-

-

2586

2670

-

2529

Amino acids

-^a

-^a

-

-

888

891

891

-

-

-

861

889

-

842

Gene6

DNA

3986

4542

3996

3987

3999

4007

3958

-

-

-

3990

3988

4294

4144

Exons

8

8

8

8

8

8

8

-

-

-

8

8

8

7

cDNA

876

873

873

873

873

873

882

-

-

-

882

882

882

891

Amino acids

291

290

290

290

290

290

293

-

-

-

293

293

293

296

Gene7

DNA

3829

3779

3782

3805

3781

3775

3977

3298#

1876#

-

3814

3812

3962

3717

Exons

8

8

8

8

8

8

8

7#

6#

-

8

8

8

8

cDNA

1092

1092

1092

1092

1092

1092

1092

1023#

966#

-

1092

1092

1092

1086

Amino acids

363

363

363

363

363

363

363

340#

321#

-

363

363

363

361

Gene8

DNA

2988

2982

2974

2991

2993^a

2991

2976

2982

2993

-

2991

2991

3003

3003

Exons

5

5

5

5

5^a

5

5

5

6

-

5

5

5

5

cDNA

2412

2421

2376

2415

2417^a

2415

2406

2421

2367

-

2415

2415

2427

2421

Amino acids

803

806

791

804

-^a

804

801

806

788

-

804

804

808

806

Gene9

DNA

1632

1638

1632

1626

-

-

1632

1413

1632

-

1629

-

1575

X

Exons

1

1

1

1

-

-

1

1

1

-

1

-

1

X

cDNA

1632

1638

1632

1626

-

-

1632

1413

1632

-

1629

-

1575

X

Amino acids

543

545

543

541

-

-

543

470

543

-

542

-

524

X

Gene10

DNA

X

X

17423^a

22357^a

-

-

X

X

620^a

744^a

1057^a

-

1066

X

Exons

X

X

6^a

6^a

-

-

X

X

3^a

5^a

4^a

-

6

X

cDNA

X

X

490^a

436^a

-

-

X

X

427^a

393^a

501^a

-

534

X

Amino acids

X

X

N/A ^a

N/A ^a

-

-

X

X

N/A^a

N/A ^a

166^a

-

177

X

Gene11a

DNA

X

X

4273

4059

-

-

X

X

4043

4060

4062

-

1566#/33480

X

Exons

X

X

7

6

-

-

X

X

6

6

6

-

4#/6

X

cDNA

X

X

1029

1029

-

-

X

X

1029

1029

1029

-

645#/993

X

Amino acids

X

X

342

342

-

-

X

X

342

342

342

-

214#/330

X

Gene11b

DNA

3293

3832

3671

3678

-

-

9988

3271

5684

9146

3674

-

6477

4616

Exons

6

6

6

6

-

-

6

6

7

6

6

-

7

6

cDNA

948

948

948

948

-

-

948

948

927

948

948

-

954

957

Amino acids

315

315

315

315

-

-

315

315

308

315

315

-

317

318

Gene12

DNA

-

1836

-

1841

-

-

2053

1840

1877

1877/1881/1881¹

1841

-

-

1846

Exons

-

3

-

3

-

-

3

3

3

3/3/3

3

-

-

3

cDNA

-

1536

-

1539

-

-

1146

1536

1539

1671/1611/1611

1539

-

-

1545

Amino acids

-

511

-

512

-

-

381

511

512

556/536/536

512

-

-

514