| % Isolates that carry virulence genesa | |||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Species | cry | cya + lef + pag | capA | capB | capC | capD | capE | cesA | cesB | cesC | cesD | cytK | entFM | hblA | hblB | hblC | hblD | nheABC |
B. anthracis (n = 5) |  | 60 | 80 | 80 | 80 | 80 | 80 |  |  |  |  |  | 100 |  |  |  |  | 100 |
B. cereus (n = 20) |  | 15 | 15 | 5 | 15 | 15 | 10 | 5 | 5 | 5 | 5 | 70 | 95 | 50 | 45 | 45 | 50 | 100 |
B. cytotoxicus (n = 1) |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  | 100 | 100 |  |  |  |  | 100 |
B. mycoides (n = 3) |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  | 33 | 100 | 100 | 67 | 100 | 100 | 100 |
B. pseudomycoides (n = 1) |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  | 100 | 100 | 100 |  |  | 100 |
B. thuringiensis (n = 14) | 71 |  | 7 |  | 7 | 7 |  |  |  |  |  | 79 | 100 | 86 | 86 | 86 | 86 | 100 |
B. toyonensis (n = 1) |  |  |  |  |  |  | 100 |  |  | 100 |  |  | 100 | 100 | 100 | 100 | 100 | 100 |
B. weihenstephanensis (n = 2) | 50 |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  | 100 | 100 | 50 | 100 | 100 | 100 |
Dairy-associated isolates (n = 22) | 9 |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  | 68 | 100 | 59 | 50 | 59 | 59 | 100 |
WGS clade | ||||||||||||||||||
Clade I (n = 4) |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  | 100 | 100 | 75 | 75 | 75 | 100 |
Clade II (n = 2) |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  | 100 | 100 | 50 | 50 | 50 | 50 | 100 |
Clade III-a (n = 19) | 16 | 26 | 37 | 26 | 37 | 37 | 32 |  |  |  |  | 47 | 100 | 26 | 26 | 26 | 26 | 100 |
Clade III-b (n = 6) | 33 | 17 |  |  |  |  |  |  |  |  |  | 83 | 83 | 67 | 67 | 67 | 67 | 100 |
Clade III-c (n = 10) | 10 |  |  |  |  |  |  | 10 | 10 | 10 | 10 | 50 | 100 | 10 | 10 | 10 | 10 | 100 |
Clade IV (n = 20) | 40 |  | 5 |  | 5 | 5 |  |  |  |  |  | 95 | 100 | 100 | 95 | 95 | 100 | 100 |
Clade V (n = 3) | 33 |  |  |  |  |  | 33 |  |  | 33 |  |  | 100 | 100 | 100 | 100 | 100 | 100 |
Clade VI (n = 4) | 25 |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  | 100 | 100 | 25 | 100 | 100 | 100 |
Clade VII (n = 1) |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  | 100 | 100 |  |  |  |  | 100 |