Skip to main content

Table 3 The proportion of genes that were shared between the DESeq2 and edgeR analyses (Table 2) within GO biological processes

From: Sea lampreys elicit strong transcriptomic responses in the lake trout liver during parasitism

Biological process

Leans up

Leans down

Siscowets up

Siscowets down

Cellular component organization or biogenesis (GO:0071840)

6.10 %

1.30 %

4.60 %

2.00 %

Cellular process (GO:0009987)

17.60 %

16.90 %

18.40 %

18.20 %

Localization (GO:0051179)

9.20 %

8.10 %

10.70 %

9.30 %

Apoptotic process (GO:0006915)

3.10 %

3.80 %

1.50 %

2.00 %

Reproduction (GO:0000003)

1.50 %

1.90 %

2.10 %

1.10 %

Biological regulation (GO:0065007)

9.20 %

8.10 %

10.10 %

9.50 %

Response to stimulus (GO:0050896)

6.90 %

10.00 %

6.30 %

8.60 %

Developmental process (GO:0032502)

6.10 %

7.50 %

6.90 %

5.60 %

Multicellular organismal process (GO:0032501)

3.10 %

4.40 %

5.40 %

4.10 %

Metabolic process (GO:0008152)

31.30 %

29.40 %

28.50 %

32.70 %

Immune system process (GO:0002376)

6.10 %

6.30 %

4.00 %

4.30 %

Locomotion (GO:0040011)

0 %

0.60 %

0.20 %

0.40 %

Biological adhesion (GO:0022610)

0 %

1.90 %

1.30 %

2.20 %