Skip to main content

Table 4 The proportion of genes that were shared between the DESeq2 and edgeR analyses (Table 2) within GO molecular functions

From: Sea lampreys elicit strong transcriptomic responses in the lake trout liver during parasitism

Molecular function Leans up Leans down Siscowets up Siscowets down
Translation regulator activity (GO:0045182) 5.60 % 3.70 % 2.50 % 1.00 %
Nucleic acid binding transcription factor activity (GO:0001071) 2.80 % 2.40 % 4.30 % 4.80 %
Binding (GO:0005488) 25.00 % 25.60 % 27.70 % 24.70 %
Receptor activity (GO:0004872) 5.60 % 12.20 % 6.00 % 9.30 %
Enzyme regulator activity (GO:0030234) 4.20 % 2.40 % 7.10 % 4.20 %
Structural molecule activity (GO:0005198) 5.60 % 2.40 % 4.60 % 3.20 %
Catalytic activity (GO:0003824) 41.70 % 45.10 % 37.60 % 43.90 %
Transporter activity (GO:0005215) 9.70 % 6.10 % 9.90 % 8.00 %
Protein binding transcription factor activity (GO:0000988) 0.00 % 0.00 % 0.40 % 0.30 %
Antioxidant activity (GO:0016209) 0.00 % 0.00 % 0.00 % 0.60 %