Skip to main content

Table 4 The proportion of genes that were shared between the DESeq2 and edgeR analyses (Table 2) within GO molecular functions

From: Sea lampreys elicit strong transcriptomic responses in the lake trout liver during parasitism

Molecular function

Leans up

Leans down

Siscowets up

Siscowets down

Translation regulator activity (GO:0045182)

5.60 %

3.70 %

2.50 %

1.00 %

Nucleic acid binding transcription factor activity (GO:0001071)

2.80 %

2.40 %

4.30 %

4.80 %

Binding (GO:0005488)

25.00 %

25.60 %

27.70 %

24.70 %

Receptor activity (GO:0004872)

5.60 %

12.20 %

6.00 %

9.30 %

Enzyme regulator activity (GO:0030234)

4.20 %

2.40 %

7.10 %

4.20 %

Structural molecule activity (GO:0005198)

5.60 %

2.40 %

4.60 %

3.20 %

Catalytic activity (GO:0003824)

41.70 %

45.10 %

37.60 %

43.90 %

Transporter activity (GO:0005215)

9.70 %

6.10 %

9.90 %

8.00 %

Protein binding transcription factor activity (GO:0000988)

0.00 %

0.00 %

0.40 %

0.30 %

Antioxidant activity (GO:0016209)

0.00 %

0.00 %

0.00 %

0.60 %