| Day4 Healthy | Day4 NL1-I | Day4 BCMV-S2 | Day8 Healthy | Day8 NL1-I | Day8 BCMV-S2 |
---|---|---|---|---|---|---|
Total Number of Reads | 100384228 | 85580983 | 95822434 | 100826142 | 101771895 | 97866045 |
Average Number of Reads | 33461409 | 28526994 | 31940811 | 33608714 | 33923965 | 32622015 |
Cleaned Reads | 33424094 | 28496111 | 31900317 | 33566283 | 33881828 | 32580889 |
Mapped | 32016716 (95.8Â %) | 27359710 (96.0Â %) | 30558211 (95.8Â %) | 32359045 (96.4Â %) | 31295370 (92.4Â %) | 28489996 (87.4Â %) |
Unique Alignment | 28953972 (86.6Â %) | 25106389 (88.1Â %) | 27610543 (86.5Â %) | 29033850 (86.5Â %) | 28563040 (84.3Â %) | 25955587 (80.0Â %) |
Multiple Alignment | 3062744 (9.6Â %) | 2253321 (8.2Â %) | 2947668 (9.6Â %) | 3325195 (10.3Â %) | 2732330 (8.7Â %) | 2534409 (8.9Â %) |
Reads Unmapped | 1407378 (4.2Â %) | 1136400 (4.0Â %) | 1342105 (4.2Â %) | 1207238 (3.6Â %) | 2586458 (7.6Â %) | 4090893 (12.5Â %) |
Intragenic Mapping | 29974232 (93.6Â %) | 25976900 (94.9Â %) | 28844743 (94.4Â %) | 31105962 (96.1Â %) | 29702292 (94.9Â %) | 26984179 (94.7Â %) |
Exon Mapping | 28665015 (89.5Â %) | 24837853 (90.7Â %) | 27654993 (90.5Â %) | 29549785 (91.3Â %) | 28357718 (90.6Â %) | 25632321 (90.0Â %) |
Intron Mapping | 1309218 (4.1Â %) | 1139048 (4.2Â %) | 1189751 (3.9Â %) | 1556179 (4.8Â %) | 1344572 (4.3Â %) | 1351857 (4.7Â %) |
Intergenic Mapping | 2019225 (6.3Â %) | 1369481 (5.0Â %) | 1692646 (5.5Â %) | 1244967 (3.8Â %) | 1582672 (5.0Â %) | 1496416 (5.2Â %) |
Genes Detected | 21377 | 21179 | 21365 | 21432 | 21667 | 21400 |