Table 4 Loci detected for eating and cooking qualities in indica and japonica panels

AAC

6

1529682

2.15 × 10⁻⁷

0.331

0.079

6

1765761

1.69 × 10⁻¹³

0.146

0.279

PRO

2

3118861

1.87 × 10⁻⁵

0.098

0.076

4

6536977

1.37 × 10⁻⁵

0.055

0.079

5

6814906

3.10 × 10⁻⁵

0.122

0.072

6

2576841

2.23 × 10⁻⁵

0.458

-

7

1631971

9.32 × 10⁻⁷

0.073

0.102

8

2755270

4.39 × 10⁻⁵

0.280

-

10

9032827

4.38 × 10⁻⁶

0.207

0.089

11

22240707

3.60 × 10⁻⁵

0.093

-

11

22563596

2.89 × 10⁻⁵

0.064

0.073

PV

6

1665483

2.96 × 10⁻⁵

0.322

0.127

6

1765761

6.42 × 10⁻⁶

0.145

0.110

8

2885700

6.78 × 10⁻⁵

0.087

0.085

11

5061851

1.46 × 10⁻⁵

0.084

0.101

HPV

3

26688241

7.17 × 10⁻⁵

0.449

0.625

5

7944999

6.99 × 10⁻⁵

0.096

0.089

6

1750498

1.50 × 10⁻⁶

0.280

0.387

9

18431810

6.09 × 10⁻⁵

0.142

0.090

9

18729438

6.47 × 10⁻⁵

0.203

0.250

11

3161548

2.46 × 10⁻⁵

0.078

0.101

11

27792076

3.84 × 10⁻⁵

0.229

0.096

CPV

6

1750498

1.24 × 10⁻⁶

0.280

0.402

9

18443016

1.28 × 10⁻⁶

0.054

0.133

BD

6

1721792

9.99 × 10⁻⁵

0.339

0.097

7

1118122

1.51 × 10⁻⁵

0.054

0.111

7

26540950

6.68 × 10⁻⁵

0.339

0.103

11

3735389

4.38 × 10⁻⁵

0.398

0.109

11

20805844

1.84 × 10-⁵

0.160

0.109

SB

1

31774927

4.37 × 10⁻⁵

0.205

0.092

3

8987316

2.53 × 10⁻⁵

0.075

0.098

6

1617418

6.01 × 10⁻⁶

0.339

0.133

6

1765761

1.82 × 10⁻⁸

0.145

0.183

7

25312126

9.18 × 10⁻⁵

0.297

0.095

11

3781133

9.23 × 10⁻⁵

0.356

0.095

CS

1

31668474

5.17 × 10⁻⁶

0.202

0.085

6

1759451

6.46 × 10⁻⁷

0.120

0.102

PeT

1

23829740

5.22 × 10⁻⁵

0.322

0.323

2

4054094

1.84 × 10⁻⁶

0.111

0.093

3

33737410

3.27 × 10⁻⁷

0.060

0.107

5

7996572

1.96 × 10⁻⁵

0.057

0.073

PTemp

1

2609442

2.80 × 10⁻⁶

0.084

0.055

4

33873772

5.72 × 10⁻⁶

0.051

0.052

6

6722646

1.29 × 10⁻⁷

0.356

0.295

6

6747298

3.71 × 10⁻⁶

0.482

0.054

9

8085354

1.09 × 10⁻⁵

0.090

0.049