Skip to main content

Advertisement

Table 1 Mitochondrial genome lengths and intron presence. The strains of clades 2 and 3 are ordered based on the corrected mitochondrial genome length

From: Mitochondrial genomes reveal recombination in the presumed asexual Fusarium oxysporum species complex

Strain Species forma specialis Clade Introns LV mt length Correcteda
     nad5 cob(1) cob(2) atp6 variant (bp) (bp)
Foc011 F. oxysporum f.sp. cucumerinum 1 yes yes - - 1 46476 33615
Foc013 F. oxysporum f.sp. cucumerinum 1 yes yes - - 1 46476 33615
Fov24500 F. oxysporum f.sp. vasinfectum 1 yes yes yes yes 1 48054 33727
B2 F. oxysporum f.sp. cubense 1 yes yes yes yes 1 49697 33419
II5 F. oxysporum f.sp. cubense 1 yes yes yes yes 1 49692 33414
Foc021 F. oxysporum f.sp. cucumerinum 2 yes - - - 2 50783 33449
Foc018 F. oxysporum f.sp. cucumerinum 2 yes - - - 2 50783 33449
Foc030 F. oxysporum f.sp. cucumerinum 2 yes - - - 2 50783 33449
NRRL25433 F. oxysporum f.sp. vasinfectum 2 yes - - - 1 44941 33458
N2 F. oxysporum f.sp. cubense 2 yes - - - 1 45639 33465
Foc035 F. oxysporum f.sp. cucumerinum 2 yes - - - 1 45706 33477
Fon002 F. oxysporum f.sp. niveum 2 yes - - - 1 45677 33477
Foc037 F. oxysporum f.sp. cucumerinum 2 yes - - - 1 45705 33479
Foc015 F. oxysporum f.sp. cucumerinum 2 yes - - - 1 45712 33486
Fom016 F. oxysporum f.sp. melonis 2 yes - - - 1 45538 33487
Fom013 F. oxysporum f.sp. melonis 2 yes - - - 1 45538 33487
Fom005 F. oxysporum f.sp. melonis 2 yes - - - 1 45538 33487
Fom012 F. oxysporum f.sp. melonis 2 yes - - - 1 45538 33487
NRRL54005 F. oxysporum f.sp. raphani 2 yes - - - 1 45536 33487
Fom004 F. oxysporum f.sp. melonis 2 yes - - - 1 45538 33487
Fom006 F. oxysporum f.sp. melonis 2 yes - - - 1 45538 33487
NRRL37622 F. oxysporum f.sp. pisi 2 yes - - - 3 39941 33490
Fom009 F. oxysporum f.sp. melonis 2 yes - - - 3 38736 33492
Fom011 F. oxysporum f.sp. melonis 2 yes - - - 3 38736 33492
Fom010 F. oxysporum f.sp. melonis 2 yes - - - 3 38736 33492
Fod008 F. oxysporum f.sp. dianthi 2 yes - - - 1 45694 33498
Fod001 F. oxysporum f.sp. dianthi 2 yes - - - 1 44947 33498
Foc001 F. oxysporum f.sp. cucumerinum 2 yes - - - 1 45741 33509
Fon015 F. oxysporum f.sp. niveum 2 yes - - - 1 45708 33514
Fon019 F. oxysporum f.sp. niveum 2 yes - - - 2 50087 33514
Fon020 F. oxysporum f.sp. niveum 2 yes - - - 1 45752 33526
Fon005 F. oxysporum f.sp. niveum 2 yes - - - 1 45752 33526
Fon010 F. oxysporum f.sp. niveum 2 yes - - - 1 45752 33526
Fon021 F. oxysporum f.sp. niveum 2 yes - - - 1 45752 33526
Fon013 F. oxysporum f.sp. niveum 2 yes - - - 2 50795 33527
NRRL54008 F. oxysporum f.sp. conglutinans 2 yes - - - 2 50023 33534
Forc031 F. oxysporum f.sp. radicis-cucumerinum 3 yes yes - - 1 47541 33667
DF023 F. oxysporum f.sp. lycopersici 3 yes yes - - 2 52324 33667
Fo47 F. oxysporum   3 yes yes - - 1 47547 33667
Forc024 F. oxysporum f.sp. radicis-cucumerinum 3 yes yes - - 1 47541 33667
Forc016 F. oxysporum f.sp. radicis-cucumerinum 3 yes yes - - 1 47541 33667
NRRL54003 F. oxysporum f.sp. lycopersici 3 yes yes - - 1 47588 33674
UASWS AC1 F. oxysporum   3 yes yes - - 1 47598 33682
DF038 F. oxysporum f.sp. lycopersici 3 yes yes - - 1 47562 33688
DF062 F. oxysporum f.sp. lycopersici 3 yes yes - - 1 47562 33688
Fol016 F. oxysporum f.sp. lycopersici 3 yes yes - - 1 47562 33688
NRRL26406 F. oxysporum f.sp. melonis 3 yes yes - - 1 47444 33688
Fol004 F. oxysporum f.sp. lycopersici 3 yes yes - - 2 52352 33694
Fol014 F. oxysporum f.sp. lycopersici 3 yes yes - - 2 52352 33694
Fol4287 F. oxysporum f.sp. lycopersici 3 yes yes - - 2 52352 33694
Fol038 F. oxysporum f.sp. lycopersici 3 yes yes - - 2 52352 33694
DF041 F. oxysporum f.sp. lycopersici 3 yes yes - - 2 52352 33694
Fol018 F. oxysporum f.sp. lycopersici 3 yes yes - - 2 52352 33694
Fol002 F. oxysporum f.sp. lycopersici 3 yes yes - - 2 52352 33694
Fol026 F. oxysporum f.sp. lycopersici 3 yes yes - - 2 52352 33694
DF040 F. oxysporum f.sp. lycopersici 3 yes yes - - 2 52352 33694
Fol029 F. oxysporum f.sp. lycopersici 3 yes yes - - 2 52352 33694
MN14 F. oxysporum   3 yes yes - - 1 47573 33696
F11 F. oxysporum f.sp. cumini 3 yes yes - - 1 47409 33704
NRRL26381 F. oxysporum f.sp. radicis-lycopersici 3 yes yes - - 1 47263 33707
FOSC3-a F. oxysporum   3 yes yes yes - 2 53639 33727
JCM11502 F. commune   - yes - - - 1 47526 33565
ITEM2287 F. proliferatum   - - - - - 1 46555 33558
ITEM2400 F. proliferatum   - - - - - 1 46549 33549
  1. aThe length of the conserved part of the mitogenome after excluding the introns of protein coding genes