Identification and characterization of microRNAs involved in ascidian larval metamorphosis

BMC Genomics

Table 1 KEGG pathway analysis of transport and catabolism

Pathway	Target Gene	KO ID	cDNA ID	miRNA
Endoplasmic	STT3	K07151	ENSCSAVG00000004164	csa-miR-4000f
Reticulum	CALR	K08057	ENSCSAVG00000000885	csa-miR-217
	MBTPS1	K08653	ENSCSAVG00000005178	csa-miR-4000f
	HYOU1	K09486	ENSCSAVG00000003312	csa-miR-92c
	HSP90B	K09487	ENSCSAVG00000010760	csa-miR-217
	PDIA6	K09584	ENSCSAVG00000010980	csa-miR-92c
	EDEM1	K10084	ENSCSAVG00000000652	csa-miR-92c
	SEC23	K14006	ENSCSAVG00000011363	csa-miR-92c
Phagosome	ATPeV1H	K02144	ENSCSAVG00000000896	csa-miR-92c
	ATPeV1A	K02145	ENSCSAVG00000005752	csa-miR-92c
	ATPeV0D	K02146	ENSCSAVG00000001895	csa-miR-92c
	ATPeV1F	K02151	ENSCSAVG00000011191	csa-miR-92c
	CALR	K08057	ENSCSAVG00000000885	csa-miR-217
	SEC61B	K09481	ENSCSAVG00000002561	csa-miR-92c
Endocytosis	SH3G	K11247	ENSCSAVG00000002074	csa-miR-216a
	ARFGAP2/3	K12493	ENSCSAVG00000001512	csa-miR-92c
	CCDC53	K18463	ENSCSAVG00000005922	csa-miR-92c
	VPS29	K18467	ENSCSAVG00000005941	csa-miR-92c
Lysosome	GALC	K01202	ENSCSAVG00000002286	csa-miR-92c
	ATPeV1H	K02144	ENSCSAVG00000000896	csa-miR-92c
	ATPeV0D	K02146	ENSCSAVG00000001895	csa-miR-92c
	AP1M	K12393	ENSCSAVG00000004175	csa-miR-92c
	LGMN	K01369	ENSCSAVG00000006624	csa-miR-4018a
	GGA	K12404	ENSCSAVG00000004489	csa-miR-92c
Autophagy	ULK1/2/3	K08269	ENSCSAVG00000003676	csa-miR-92c
Autophagy	ATG13	K08331	ENSCSAVG00000003971	csa-miR-92c

ISSN: 1471-2164