Skip to main content

Advertisement

Table 2 Summary statistics for rat WES reads

From: Whole exome sequencing in the rat

Sample Total Reads Aligned Reads Aligned Reads (%) Reads in Target Exons Reads on Target (%) Duplicate Reads (%)
C6 171M 170 M 98.9 135 M 79.5 32.3
DSL-6A/C1 179 M 178 M 99.1 141 M 79.1 27.5
FAT7 185 M 183 M 99.1 146 M 79.6 29.6
NBTII 176 M 174 M 99.1 139 M 79.9 27.6
FF1 187 M 185 M 99.2 146 M 79.0 22.7
FF2 181 M 180 M 99.1 141 M 78.4 21.8
FF3 189 M 187 M 99.0 150 M 79.8 24.9
FF4 189 M 187 M 99.0 149 M 79.9 23.0
FFPE1 172 M 159 M 92.0 118 M 74.4 46.9
FFPE2 174 M 165 M 95.0 128 M 77.3 42.7
FFPE3 160 M 134 M 84.0 81 M 60.3 49.1
FFPE4 170 M 150 M 88.2 105 M 70.4 44.1
  1. Read length was 101 bp for all samples
  2. M Million