DNA methylation of the promoter region of bnip3 and bnip3l genes induced by metabolic programming

BMC Genomics

Table 2 Primers used for target gene DNA methylation study

Gene	Location from ATG	Primers (5′ to 3′)	Tm in °C
bnip3a	− 1085 / -762	F: TGATGGAATATTTAGTTTTTAGTAGGATAA	57
	− 1085 / -762	R: TCCAAACCATCCAAAACTATTTAA	57
	− 717 / -498	F: TTTTATGGATGGAGGAAATATTTGT	57
	− 717 / -498	R: TAAACAACTCTCTAAACTATTAAC	57
	−513 / -283	F: TAGAGAGTTGTTTTATATAGGAAAA	57
	−513 / -283	R: ATCACTCACTAATATATTCATTAATC	57
	− 383 / -120	F: TTTGAATTTGTTTAATAGAAATTTT	54
	− 383 / -120	R: ATATTATTCTAATACCTCTAAATTA	54
	−202 / + 43	F: TGTTTTGGTAGTTTAGTGTT	58
	−202 / + 43	R: CCTGCAAATTTTCCT	58
bnip3lb1	− 1735 / -1358	F: AAAGAGATAGATATTTTGAGATTTGTTATA	57
	− 1735 / -1358	R: TAATAAATAAATTCCACTTCACTCC	57
	− 1435 / -1038	F: TGAAGAATTGTTATGAAAGAGGTAATGT	57
	− 1435 / -1038	R: TCTCCAAAACCTATATTTACCATAAAC	57
	− 867 / -590	F: GGGTATTTTAAAATTTTATTAATTTTTTATT	57
	− 867 / -590	R: ACACTTATTTAACAATTTAACACTTATTTA	57
	− 594 / -222	F: GTGTGAGGTGAATTTAAGTTGT	59
	− 594 / -222	R: AATAATCCAATTCTTTAATAACAAAAACA	59
	−252 / + 26	F: TGTTTTTGTTATTAAAGAATTGGATTATTT	58
	−252 / + 26	R: TCAACTACAACAACAACTTCAAAC	58

ISSN: 1471-2164