TY - JOUR AU - Scallan, E. AU - Hoekstra, R. M. AU - Angulo, F. J. AU - Tauxe, R. V. AU - Widdowson, M. -. A. AU - Roy, S. L. AU - Jones, J. L. AU - Griffin, P. M. PY - 2011 DA - 2011// TI - Foodborne illness acquired in the United States—major pathogens JO - Emerg Infect Dis VL - 17 UR - https://doi.org/10.3201/eid1701.P11101 DO - 10.3201/eid1701.P11101 ID - Scallan2011 ER - TY - JOUR AU - Mead, P. S. AU - Slutsker, L. AU - Dietz, V. AU - McCaig, L. F. AU - Bresee, J. S. AU - Shapiro, C. AU - Griffin, P. M. AU - Tauxe, R. V. PY - 1999 DA - 1999// TI - Food-related deaths and illness in the United States JO - Emerg Infact Dis VL - 5 UR - https://doi.org/10.3201/eid0505.990502 DO - 10.3201/eid0505.990502 ID - Mead1999 ER - TY - JOUR AU - Allberger, F. AU - Wagner, M. PY - 2010 DA - 2010// TI - Listeriosis: a resurgent foodborne infection JO - Clin Microbiol Infect VL - 6 UR - https://doi.org/10.1111/j.1469-0691.2009.03109.x DO - 10.1111/j.1469-0691.2009.03109.x ID - Allberger2010 ER - TY - JOUR AU - Greenwood, M. e. l. o. d. y. H. AU - Roberts, D. i. a. n. e. AU - Burden, P. a. t. r. i. c. i. a. PY - 1991 DA - 1991// TI - The occurrence of Listeria species in milk and dairy products: a national survey in England and Wales JO - International Journal of Food Microbiology VL - 12 UR - https://doi.org/10.1016/0168-1605(91)90070-6 DO - 10.1016/0168-1605(91)90070-6 ID - Greenwood1991 ER - TY - JOUR AU - SHABALA, L. A. N. A. AU - LEE, S. H. I. H. H. U. I. AU - CANNESSON, P. A. U. L. I. N. E. AU - ROSS, T. O. M. PY - 2008 DA - 2008// TI - Acid and NaCl Limits to Growth of Listeria monocytogenes and Influence of Sequence of Inimical Acid and NaCl Levels on Inactivation Kinetics JO - Journal of Food Protection VL - 71 UR - https://doi.org/10.4315/0362-028X-71.6.1169 DO - 10.4315/0362-028X-71.6.1169 ID - SHABALA2008 ER - TY - JOUR AU - Bergholz, T. e. r. e. s. a. M. AU - den Bakker, H. e. n. k. C. AU - Fortes, E. s. t. h. e. r. D. AU - Boor, K. a. t. h. r. y. n. J. AU - Wiedmann, M. a. r. t. i. n. PY - 2010 DA - 2010// TI - Salt Stress Phenotypes in Listeria monocytogenes Vary by Genetic Lineage and Temperature JO - Foodborne Pathogens and Disease VL - 7 UR - https://doi.org/10.1089/fpd.2010.0624 DO - 10.1089/fpd.2010.0624 ID - Bergholz2010 ER - TY - JOUR AU - Shank, F. r. e. d. R. AU - Elliot, E. l. i. s. a. L. AU - Wachsmuth, I. K. a. y. e. AU - Losikoff, M. a. r. y. E. PY - 1996 DA - 1996// TI - US position on Listeria monocytogenes in foods JO - Food Control VL - 7 UR - https://doi.org/10.1016/S0956-7135(96)00041-2 DO - 10.1016/S0956-7135(96)00041-2 ID - Shank1996 ER - TY - JOUR AU - Rasmussen, O. F. AU - Skouboe, P. AU - Dons, L. PY - 1995 DA - 1995// TI - Listeria monocytogenes exists in at least three evolutionary lines: evidence from flagellin, invasive associated protein and listeriolysin 0 genes JO - Microbiology VL - 141 UR - https://doi.org/10.1099/13500872-141-9-2053 DO - 10.1099/13500872-141-9-2053 ID - Rasmussen1995 ER - TY - JOUR AU - Piffaretti, J. C. AU - Kressebuch, H. AU - Aeschbacher, M. AU - Bille, J. AU - Bannerman, E. AU - Musser, J. M. AU - Selander, R. K. AU - Rocourt, J. PY - 1989 DA - 1989// TI - Genetic characterization of clones of the bacterium Listeria monocytogenes causing epidemic disease JO - Proc Natl Acad Sci U S A VL - 86 UR - https://doi.org/10.1073/pnas.86.10.3818 DO - 10.1073/pnas.86.10.3818 ID - Piffaretti1989 ER - TY - JOUR AU - Ward, T. J. AU - Ducey, T. F. AU - Usgaard, T. AU - Dunn, K. A. AU - Bielawski, J. P. PY - 2008 DA - 2008// TI - Multilocus Genotyping Assays for Single Nucleotide Polymorphism-Based Subtyping of Listeria monocytogenes Isolates JO - Applied and Environmental Microbiology VL - 74 UR - https://doi.org/10.1128/AEM.01127-08 DO - 10.1128/AEM.01127-08 ID - Ward2008 ER - TY - JOUR AU - Ragon, M. a. r. i. e. AU - Wirth, T. h. i. e. r. r. y. AU - Hollandt, F. l. o. r. i. a. n. AU - Lavenir, R. a. c. h. e. l. AU - Lecuit, M. a. r. c. AU - Le Monnier, A. l. b. a. n. AU - Brisse, S. y. l. v. a. i. n. PY - 2008 DA - 2008// TI - A New Perspective on Listeria monocytogenes Evolution JO - PLoS Pathogens VL - 4 UR - https://doi.org/10.1371/journal.ppat.1000146 DO - 10.1371/journal.ppat.1000146 ID - Ragon2008 ER - TY - JOUR AU - Hof, H. AU - Rocourt, J. PY - 1992 DA - 1992// TI - Is any strain of Listeria monocytogenes detected in food a health risk? JO - International Journal of Food Microbiology VL - 16 UR - https://doi.org/10.1016/0168-1605(92)90078-H DO - 10.1016/0168-1605(92)90078-H ID - Hof1992 ER - TY - JOUR AU - Orsi, R. e. n. a. t. o. H. AU - Bakker, H. e. n. k. C. d. e. n. AU - Wiedmann, M. a. r. t. i. n. PY - 2011 DA - 2011// TI - Listeria monocytogenes lineages: Genomics, evolution, ecology, and phenotypic characteristics JO - International Journal of Medical Microbiology VL - 301 UR - https://doi.org/10.1016/j.ijmm.2010.05.002 DO - 10.1016/j.ijmm.2010.05.002 ID - Orsi2011 ER - TY - JOUR AU - Maury, M. y. l. è. n. e. M. AU - Tsai, Y. u. -. H. u. a. n. AU - Charlier, C. a. r. o. l. i. n. e. AU - Touchon, M. a. r. i. e. AU - Chenal-Francisque, V. i. v. i. a. n. e. AU - Leclercq, A. l. e. x. a. n. d. r. e. AU - Criscuolo, A. l. e. x. i. s. AU - Gaultier, C. h. a. r. l. o. t. t. e. AU - Roussel, S. o. p. h. i. e. AU - Brisabois, A. n. n. e. AU - Disson, O. l. i. v. i. e. r. AU - Rocha, E. d. u. a. r. d. o. P. C. AU - Brisse, S. y. l. v. a. i. n. AU - Lecuit, M. a. r. c. PY - 2016 DA - 2016// TI - Uncovering Listeria monocytogenes hypervirulence by harnessing its biodiversity JO - Nature Genetics VL - 48 UR - https://doi.org/10.1038/ng.3501 DO - 10.1038/ng.3501 ID - Maury2016 ER - TY - STD TI - den Bakker HC, Fortes ED, Wiedmann M. Multilocus sequence typing of outbreak-associated Listeria monocytogenes isolates to identify epidemic clones. Foodborne Pathog Dis. 2010;7:257–65. ID - ref15 ER - TY - JOUR AU - Lomonaco, S. a. r. a. AU - Nucera, D. a. n. i. e. l. e. AU - Filipello, V. i. r. g. i. n. i. a. PY - 2015 DA - 2015// TI - The evolution and epidemiology of Listeria monocytogenes in Europe and the United States JO - Infection, Genetics and Evolution VL - 35 UR - https://doi.org/10.1016/j.meegid.2015.08.008 DO - 10.1016/j.meegid.2015.08.008 ID - Lomonaco2015 ER - TY - JOUR AU - Nightingale, K. K. AU - Windham, K. AU - Martin, K. E. AU - Yeung, M. AU - Wiedmann, M. PY - 2005 DA - 2005// TI - Select Listeria monocytogenes Subtypes Commonly Found in Foods Carry Distinct Nonsense Mutations in inlA, Leading to Expression of Truncated and Secreted Internalin A, and Are Associated with a Reduced Invasion Phenotype for Human Intestinal Epithelial Cells JO - Applied and Environmental Microbiology VL - 71 UR - https://doi.org/10.1128/AEM.71.12.8764-8772.2005 DO - 10.1128/AEM.71.12.8764-8772.2005 ID - Nightingale2005 ER - TY - JOUR AU - den Bakker, H. e. n. k. C. AU - Didelot, X. a. v. i. e. r. AU - Fortes, E. s. t. h. e. r. D. AU - Nightingale, K. e. n. d. r. a. AU - Wiedmann, M. a. r. t. i. n. PY - 2008 DA - 2008// TI - Lineage specific recombination rates and microevolution in Listeria monocytogenes JO - BMC Evolutionary Biology VL - 8 UR - https://doi.org/10.1186/1471-2148-8-277 DO - 10.1186/1471-2148-8-277 ID - den Bakker2008 ER - TY - JOUR AU - Ward, T. J. AU - Gorski, L. AU - Borucki, M. K. AU - Mandrell, R. E. AU - Hutchins, J. AU - Pupedis, K. PY - 2004 DA - 2004// TI - Intraspecific Phylogeny and Lineage Group Identification Based on the prfA Virulence Gene Cluster of Listeria monocytogenes  JO - Journal of Bacteriology VL - 186 UR - https://doi.org/10.1128/JB.186.15.4994-5002.2004 DO - 10.1128/JB.186.15.4994-5002.2004 ID - Ward2004 ER - TY - JOUR AU - Gray, M. J. AU - Zadoks, R. N. AU - Fortes, E. D. AU - Dogan, B. AU - Cai, S. AU - Chen, Y. AU - Scott, V. N. AU - Gombas, D. E. AU - Boor, K. J. AU - Wiedmann, M. PY - 2004 DA - 2004// TI - Listeria monocytogenes Isolates from Foods and Humans Form Distinct but Overlapping Populations JO - Applied and Environmental Microbiology VL - 70 UR - https://doi.org/10.1128/AEM.70.10.5833-5841.2004 DO - 10.1128/AEM.70.10.5833-5841.2004 ID - Gray2004 ER - TY - JOUR AU - Jeffers, G. r. e. g. o. r. y. T. AU - McDonough, P. a. t. r. i. c. k. L. AU - Bruce, J. a. m. e. s. L. AU - Wiedmann, M. a. r. t. i. n. AU - Boor, K. a. t. h. r. y. n. J. AU - Scarlett, J. a. n. e. t. PY - 2001 DA - 2001// TI - Comparative genetic characterization of Listeria monocytogenes isolates from human and animal listeriosis cases JO - Microbiology VL - 147 UR - https://doi.org/10.1099/00221287-147-5-1095 DO - 10.1099/00221287-147-5-1095 ID - Jeffers2001 ER - TY - JOUR AU - Kuenne, C. a. r. s. t. e. n. AU - Billion, A. n. d. r. é. AU - Mraheil, M. o. b. a. r. a. k. A. b. u. AU - Strittmatter, A. x. e. l. AU - Daniel, R. o. l. f. AU - Goesmann, A. l. e. x. a. n. d. e. r. AU - Barbuddhe, S. u. k. h. a. d. e. o. AU - Hain, T. o. r. s. t. e. n. AU - Chakraborty, T. r. i. n. a. d. PY - 2013 DA - 2013// TI - Reassessment of the Listeria monocytogenes pan-genome reveals dynamic integration hotspots and mobile genetic elements as major components of the accessory genome JO - BMC Genomics VL - 14 UR - https://doi.org/10.1186/1471-2164-14-47 DO - 10.1186/1471-2164-14-47 ID - Kuenne2013 ER - TY - STD TI - Seeliger H, Höhne K. Chapter II serotyping of Listeria monocytogenes and related species. Methods Microbiol. 1979;13:31–49. ID - ref23 ER - TY - JOUR AU - Cantinelli, T. h. o. m. a. s. AU - Chenal-Francisque, V. i. v. i. a. n. e. AU - Diancourt, L. a. u. r. e. AU - Frezal, L. i. s. e. AU - Leclercq, A. l. e. x. a. n. d. r. e. AU - Wirth, T. h. i. e. r. r. y. AU - Lecuit, M. a. r. c. AU - Brisse, S. y. l. v. a. i. n. PY - 2013 DA - 2013// TI - “Epidemic Clones” of Listeria monocytogenes Are Widespread and Ancient Clonal Groups JO - Journal of Clinical Microbiology VL - 51 UR - https://doi.org/10.1128/JCM.01874-13 DO - 10.1128/JCM.01874-13 ID - Cantinelli2013 ER - TY - JOUR AU - Haase, J. a. n. a. K. AU - Didelot, X. a. v. i. e. r. AU - Lecuit, M. a. r. c. AU - Korkeala, H. a. n. n. u. AU - Achtman, M. a. r. k. PY - 2013 DA - 2013// TI - The ubiquitous nature ofListeria monocytogenesclones: a large-scale Multilocus Sequence Typing study JO - Environmental Microbiology VL - 16 UR - https://doi.org/10.1111/1462-2920.12342 DO - 10.1111/1462-2920.12342 ID - Haase2013 ER - TY - JOUR AU - KATHARIOU, S. O. P. H. I. A. PY - 2002 DA - 2002// TI - Listeria monocytogenes Virulence and Pathogenicity, a Food Safety Perspective JO - Journal of Food Protection VL - 65 UR - https://doi.org/10.4315/0362-028X-65.11.1811 DO - 10.4315/0362-028X-65.11.1811 ID - KATHARIOU2002 ER - TY - JOUR AU - Chen, Y. i. AU - Gonzalez-Escalona, N. a. r. j. o. l. AU - Hammack, T. h. o. m. a. s. S. AU - Allard, M. a. r. c. W. AU - Strain, E. r. r. o. l. A. AU - Brown, E. r. i. c. W. PY - 2016 DA - 2016// TI - Core Genome Multilocus Sequence Typing for Identification of Globally Distributed Clonal Groups and Differentiation of Outbreak Strains of Listeria monocytogenes JO - Applied and Environmental Microbiology VL - 82 UR - https://doi.org/10.1128/AEM.01532-16 DO - 10.1128/AEM.01532-16 ID - Chen2016 ER - TY - JOUR AU - Buncic, S. a. v. a. AU - Avery, S. h. e. r. y. l. M. AU - Rocourt, J. o. c. e. l. y. n. e. AU - Dimitrijevic, M. i. r. j. a. n. a. PY - 2001 DA - 2001// TI - Can food-related environmental factors induce different behaviour in two key serovars, 4b and 1/2a, of Listeria monocytogenes? JO - International Journal of Food Microbiology VL - 65 UR - https://doi.org/10.1016/S0168-1605(00)00524-9 DO - 10.1016/S0168-1605(00)00524-9 ID - Buncic2001 ER - TY - JOUR AU - Vazquez-Boland, J. A. AU - Kuhn, M. AU - Berche, P. AU - Chakraborty, T. AU - Dominguez-Bernal, G. AU - Goebel, W. AU - Gonzalez-Zorn, B. AU - Wehland, J. AU - Kreft, J. PY - 2001 DA - 2001// TI - Listeria Pathogenesis and Molecular Virulence Determinants JO - Clinical Microbiology Reviews VL - 14 UR - https://doi.org/10.1128/CMR.14.3.584-640.2001 DO - 10.1128/CMR.14.3.584-640.2001 ID - Vazquez-Boland2001 ER - TY - JOUR AU - Hain, T. o. r. s. t. e. n. AU - Chatterjee, S. o. m. S. AU - Ghai, R. o. h. i. t. AU - Kuenne, C. a. r. s. t. e. n. T. o. b. i. a. s. AU - Billion, A. n. d. r. é. AU - Steinweg, C. h. r. i. s. t. i. a. n. e. AU - Domann, E. u. g. e. n. AU - Kärst, U. w. e. AU - Jänsch, L. o. t. h. a. r. AU - Wehland, J. ü. r. g. e. n. AU - Eisenreich, W. o. l. f. g. a. n. g. AU - Bacher, A. d. e. l. b. e. r. t. AU - Joseph, B. i. j. u. AU - Schär, J. e. n. n. i. f. e. r. AU - Kreft, J. ü. r. g. e. n. AU - Klumpp, J. o. c. h. e. n. AU - Loessner, M. a. r. t. i. n. J. AU - Dorscht, J. u. l. i. a. AU - Neuhaus, K. l. a. u. s. AU - Fuchs, T. h. i. l. o. M. AU - Scherer, S. i. e. g. f. r. i. e. d. AU - Doumith, M. i. c. h. e. l. AU - Jacquet, C. h. r. i. s. t. i. n. e. AU - Martin, P. a. u. l. AU - Cossart, P. a. s. c. a. l. e. AU - Rusniock, C. h. r. i. s. t. o. p. h. e. AU - Glaser, P. h. i. l. i. p. p. e. AU - Buchrieser, C. a. r. m. e. n. AU - Goebel, W. e. r. n. e. r. AU - Chakraborty, T. r. i. n. a. d. PY - 2007 DA - 2007// TI - Pathogenomics of Listeria spp JO - International Journal of Medical Microbiology VL - 297 UR - https://doi.org/10.1016/j.ijmm.2007.03.016 DO - 10.1016/j.ijmm.2007.03.016 ID - Hain2007 ER - TY - JOUR AU - Camejo, A. n. a. AU - Carvalho, F. i. l. i. p. e. AU - Reis, O. l. g. a. AU - Leitão, E. l. s. a. AU - Sousa, S. a. n. d. r. a. AU - Cabanes, D. i. d. i. e. r. PY - 2011 DA - 2011// TI - The arsenal of virulence factors deployed byListeria monocytogenesto promote its cell infection cycle JO - Virulence VL - 2 UR - https://doi.org/10.4161/viru.2.5.17703 DO - 10.4161/viru.2.5.17703 ID - Camejo2011 ER - TY - JOUR AU - Cossart, P. PY - 2011 DA - 2011// TI - Illuminating the landscape of host-pathogen interactions with the bacterium Listeria monocytogenes JO - Proceedings of the National Academy of Sciences VL - 108 UR - https://doi.org/10.1073/pnas.1112371108 DO - 10.1073/pnas.1112371108 ID - Cossart2011 ER - TY - JOUR AU - Chaturongakul, S. o. r. a. y. a. AU - Raengpradub, S. a. r. i. t. a. AU - Wiedmann, M. a. r. t. i. n. AU - Boor, K. a. t. h. r. y. n. J. PY - 2008 DA - 2008// TI - Modulation of stress and virulence in Listeria monocytogenes JO - Trends in Microbiology VL - 16 UR - https://doi.org/10.1016/j.tim.2008.05.006 DO - 10.1016/j.tim.2008.05.006 ID - Chaturongakul2008 ER - TY - JOUR AU - Hill, C. o. l. i. n. AU - Cotter, P. a. u. l. D. AU - Sleator, R. o. y. D. AU - Gahan, C. o. r. m. a. c. G. M. PY - 2002 DA - 2002// TI - Bacterial stress response in Listeria monocytogenes: jumping the hurdles imposed by minimal processing JO - International Dairy Journal VL - 12 UR - https://doi.org/10.1016/S0958-6946(01)00125-X DO - 10.1016/S0958-6946(01)00125-X ID - Hill2002 ER - TY - JOUR AU - Oliver, H. a. l. e. y. F. AU - Orsi, R. e. n. a. t. o. H. AU - Ponnala, L. a. l. i. t. AU - Keich, U. r. i. AU - Wang, W. e. i. AU - Sun, Q. i. AU - Cartinhour, S. a. m. u. e. l. W. AU - Filiatrault, M. e. l. a. n. i. e. J. AU - Wiedmann, M. a. r. t. i. n. AU - Boor, K. a. t. h. r. y. n. J. PY - 2009 DA - 2009// TI - Deep RNA sequencing of L. monocytogenes reveals overlapping and extensive stationary phase and sigma B-dependent transcriptomes, including multiple highly transcribed noncoding RNAs JO - BMC Genomics VL - 10 UR - https://doi.org/10.1186/1471-2164-10-641 DO - 10.1186/1471-2164-10-641 ID - Oliver2009 ER - TY - JOUR AU - Chen, Y. u. h. u. a. n. AU - Ross, W. i. l. l. i. a. m. H. AU - Whiting, R. i. c. h. a. r. d. C. AU - Van Stelten, A. n. n. a. AU - Nightingale, K. e. n. d. r. a. K. AU - Wiedmann, M. a. r. t. i. n. AU - Scott, V. i. r. g. i. n. i. a. N. PY - 2010 DA - 2010// TI - Variation inListeria monocytogenesDose Responses in Relation to Subtypes Encoding a Full-Length or Truncated Internalin A JO - Applied and Environmental Microbiology VL - 77 UR - https://doi.org/10.1128/AEM.01564-10 DO - 10.1128/AEM.01564-10 ID - Chen2010 ER - TY - JOUR AU - Nightingale, K. K. AU - Ivy, R. A. AU - Ho, A. J. AU - Fortes, E. D. AU - Njaa, B. L. AU - Peters, R. M. AU - Wiedmann, M. PY - 2008 DA - 2008// TI - inlA Premature Stop Codons Are Common among Listeria monocytogenes Isolates from Foods and Yield Virulence-Attenuated Strains That Confer Protection against Fully Virulent Strains JO - Applied and Environmental Microbiology VL - 74 UR - https://doi.org/10.1128/AEM.00997-08 DO - 10.1128/AEM.00997-08 ID - Nightingale2008 ER - TY - STD TI - Moura A, Criscuolo A, Pouseele H, Maury MM, Leclercq A, Tarr C, Bjorkman JT, Dallman T, Reimer A, Enouf V, et al. Whole genome-based population biology and epidemiological surveillance of Listeria monocytogenes. Nat Microbiol. 2016;2:16185. ID - ref38 ER - TY - JOUR AU - Norrung, B. AU - Andersen, J. K. PY - 2000 DA - 2000// TI - Variations in virulence between different electrophoretic types of Listeria monocytogenes JO - Letters in Applied Microbiology VL - 30 UR - https://doi.org/10.1046/j.1472-765x.2000.00704.x DO - 10.1046/j.1472-765x.2000.00704.x ID - Norrung2000 ER - TY - JOUR AU - Norton, D. M. AU - Scarlett, J. M. AU - Horton, K. AU - Sue, D. AU - Thimothe, J. AU - Boor, K. J. AU - Wiedmann, M. PY - 2001 DA - 2001// TI - Characterization and Pathogenic Potential of Listeria monocytogenes Isolates from the Smoked Fish Industry JO - Applied and Environmental Microbiology VL - 67 UR - https://doi.org/10.1128/AEM.67.2.646-653.2001 DO - 10.1128/AEM.67.2.646-653.2001 ID - Norton2001 ER - TY - JOUR AU - Rakic Martinez, M. i. r. a. AU - Wiedmann, M. a. r. t. i. n. AU - Ferguson, M. a. r. t. i. n. e. AU - Datta, A. t. i. n. R. PY - 2017 DA - 2017// TI - Assessment of Listeria monocytogenes virulence in the Galleria mellonella insect larvae model JO - PLOS ONE VL - 12 UR - https://doi.org/10.1371/journal.pone.0184557 DO - 10.1371/journal.pone.0184557 ID - Rakic Martinez2017 ER - TY - STD TI - Buchanan RL, Gorris LGM, Hayman MM, Jackson TC, Whiting RC. A review of Listeria monocytogenes: an update on outbreaks, virulence, dose-response, ecology, and risk assessments. Food Control. 2017;75:1–13. ID - ref42 ER - TY - JOUR AU - Leinonen, R. AU - Sugawara, H. AU - Shumway, M. PY - 2011 DA - 2011// TI - on behalf of the international nucleotide sequence database C: the sequence read archive JO - Nucleic Acids Res VL - 39 UR - https://doi.org/10.1093/nar/gkq1019 DO - 10.1093/nar/gkq1019 ID - Leinonen2011 ER - TY - JOUR AU - den Bakker, H. e. n. k. C. AU - Desjardins, C. h. r. i. s. t. o. p. h. e. r. A. AU - Griggs, A. l. l. i. s. o. n. D. AU - Peters, J. o. s. e. p. h. E. AU - Zeng, Q. i. a. n. d. o. n. g. AU - Young, S. a. r. a. h. K. AU - Kodira, C. h. i. n. n. a. p. p. a. D. AU - Yandava, C. h. a. n. d. r. i. AU - Hepburn, T. h. e. r. e. s. a. A. AU - Haas, B. r. i. a. n. J. AU - Birren, B. r. u. c. e. W. AU - Wiedmann, M. a. r. t. i. n. PY - 2013 DA - 2013// TI - Evolutionary Dynamics of the Accessory Genome of Listeria monocytogenes JO - PLoS ONE VL - 8 UR - https://doi.org/10.1371/journal.pone.0067511 DO - 10.1371/journal.pone.0067511 ID - den Bakker2013 ER - TY - STD TI - Glaser P, Frangeul L, Buchrieser C, Rusniok C, Amend A, Baquero F, Berche P, Bloecker H, Brandt P, Chakraborty T, et al. Comparative genomics of Listeria species. Science. 2001;294:849–52. ID - ref45 ER - TY - STD TI - Becavin C, Bouchier C, Lechat P, Archambaud C, Creno S, Gouin E, Wu Z, Kuhbacher A, Brisse S, Pucciarelli MG, et al. Comparison of widely used Listeria monocytogenes strains EGD, 10403S, and EGD-e highlights genomic variations underlying differences in pathogenicity. MBio. 2014;5:e00969–14. ID - ref46 ER - TY - JOUR AU - Clark, K. AU - Karsch-Mizrachi, I. AU - Lipman, D. J. AU - Ostell, J. AU - Sayers, E. W. PY - 2016 DA - 2016// TI - GenBank JO - Nucleic Acids Res VL - 44 UR - https://doi.org/10.1093/nar/gkv1276 DO - 10.1093/nar/gkv1276 ID - Clark2016 ER - TY - JOUR AU - Doumith, M. AU - Buchrieser, C. AU - Glaser, P. AU - Jacquet, C. AU - Martin, P. PY - 2004 DA - 2004// TI - Differentiation of the Major Listeria monocytogenes Serovars by Multiplex PCR JO - Journal of Clinical Microbiology VL - 42 UR - https://doi.org/10.1128/JCM.42.8.3819-3822.2004 DO - 10.1128/JCM.42.8.3819-3822.2004 ID - Doumith2004 ER - TY - JOUR AU - Seemann, T. PY - 2014 DA - 2014// TI - Prokka: rapid prokaryotic genome annotation JO - Bioinformatics VL - 30 UR - https://doi.org/10.1093/bioinformatics/btu153 DO - 10.1093/bioinformatics/btu153 ID - Seemann2014 ER - TY - JOUR AU - Chin, C. S. AU - Alexander, D. H. AU - Marks, P. AU - Klammer, A. A. AU - Drake, J. AU - Heiner, C. AU - Clum, A. AU - Copeland, A. AU - Huddleston, J. AU - Eichler, E. E. PY - 2013 DA - 2013// TI - Nonhybrid, finished microbial genome assemblies from long-read SMRT sequencing data JO - Nat Methods VL - 10 UR - https://doi.org/10.1038/nmeth.2474 DO - 10.1038/nmeth.2474 ID - Chin2013 ER - TY - JOUR AU - Gardner, S. N. AU - Hall, B. G. PY - 2013 DA - 2013// TI - When whole-genome alignments just won't work: kSNP v2 software for alignment-free SNP discovery and phylogenetics of hundreds of microbial genomes JO - PLoS One VL - 8 UR - https://doi.org/10.1371/journal.pone.0081760 DO - 10.1371/journal.pone.0081760 ID - Gardner2013 ER - TY - JOUR AU - Li, L. PY - 2003 DA - 2003// TI - OrthoMCL: Identification of Ortholog Groups for Eukaryotic Genomes JO - Genome Research VL - 13 UR - https://doi.org/10.1101/gr.1224503 DO - 10.1101/gr.1224503 ID - Li2003 ER - TY - JOUR AU - Begley, M. AU - Hill, C. PY - 2015 DA - 2015// TI - Stress adaptation in foodborne pathogens JO - Annu Rev Food Sci Technol VL - 6 UR - https://doi.org/10.1146/annurev-food-030713-092350 DO - 10.1146/annurev-food-030713-092350 ID - Begley2015 ER - TY - JOUR AU - Fraser, K. R. AU - Sue, D. AU - Wiedmann, M. AU - Boor, K. AU - O'Byrne, C. P. PY - 2003 DA - 2003// TI - Role of  B in Regulating the Compatible Solute Uptake Systems of Listeria monocytogenes: Osmotic Induction of opuC Is  B Dependent JO - Applied and Environmental Microbiology VL - 69 UR - https://doi.org/10.1128/AEM.69.4.2015-2022.2003 DO - 10.1128/AEM.69.4.2015-2022.2003 ID - Fraser2003 ER - TY - JOUR AU - Borezee, E. AU - Pellegrini, E. AU - Berche, P. PY - 2000 DA - 2000// TI - OppA of Listeria monocytogenes, an Oligopeptide-Binding Protein Required for Bacterial Growth at Low Temperature and Involved in Intracellular Survival JO - Infection and Immunity VL - 68 UR - https://doi.org/10.1128/IAI.68.12.7069-7077.2000 DO - 10.1128/IAI.68.12.7069-7077.2000 ID - Borezee2000 ER - TY - STD TI - Gahan CG, Hill C. Listeria monocytogenes: survival and adaptation in the gastrointestinal tract. Front Cell Infect Microbiol. 2014;4:9. ID - ref56 ER - TY - JOUR AU - Seifart Gomes, C. h. r. i. s. t. a. AU - Izar, B. e. n. j. a. m. i. n. AU - Pazan, F. a. r. h. a. d. AU - Mohamed, W. a. l. i. d. AU - Mraheil, M. o. b. a. r. a. k. A. b. u. AU - Mukherjee, K. r. i. s. h. n. e. n. d. u. AU - Billion, A. n. d. r. é. AU - Aharonowitz, Y. a. i. r. AU - Chakraborty, T. r. i. n. a. d. AU - Hain, T. o. r. s. t. e. n. PY - 2011 DA - 2011// TI - Universal Stress Proteins Are Important for Oxidative and Acid Stress Resistance and Growth of Listeria monocytogenes EGD-e In Vitro and In Vivo JO - PLoS ONE VL - 6 UR - https://doi.org/10.1371/journal.pone.0024965 DO - 10.1371/journal.pone.0024965 ID - Seifart Gomes2011 ER - TY - STD TI - Okada Y, Okada N, Makino S, Asakura H, Yamamoto S, Igimi S. The sigma factor RpoN (sigma54) is involved in osmotolerance in Listeria monocytogenes. FEMS Microbiol Lett. 2006;263:54–60. ID - ref58 ER - TY - STD TI - Raimann E, Schmid B, Stephan R, Tasara T. The alternative sigma factor sigma(L) of L. monocytogenes promotes growth under diverse environmental stresses. Foodborne Pathog Dis. 2009;6:583–91. ID - ref59 ER - TY - JOUR AU - TASARA, T. AU - STEPHAN, R. PY - 2006 DA - 2006// TI - Cold Stress Tolerance of Listeria monocytogenes: A Review of Molecular Adaptive Mechanisms and Food Safety Implications JO - Journal of Food Protection VL - 69 UR - https://doi.org/10.4315/0362-028X-69.6.1473 DO - 10.4315/0362-028X-69.6.1473 ID - TASARA2006 ER - TY - JOUR AU - Azizoglu, R. O. AU - Kathariou, S. PY - 2010 DA - 2010// TI - Temperature-Dependent Requirement for Catalase in Aerobic Growth of Listeria monocytogenes F2365 JO - Applied and Environmental Microbiology VL - 76 UR - https://doi.org/10.1128/AEM.01223-10 DO - 10.1128/AEM.01223-10 ID - Azizoglu2010 ER - TY - JOUR AU - Edgar, R. C. PY - 2004 DA - 2004// TI - MUSCLE: a multiple sequence alignment method with reduced time and space complexity JO - BMC Bioinform VL - 5 UR - https://doi.org/10.1186/1471-2105-5-113 DO - 10.1186/1471-2105-5-113 ID - Edgar2004 ER - TY - JOUR AU - Hall, B. G. PY - 2014 DA - 2014// TI - SNP-associations and phenotype predictions from hundreds of microbial genomes without genome alignments JO - PLoS One VL - 9 UR - https://doi.org/10.1371/journal.pone.0090490 DO - 10.1371/journal.pone.0090490 ID - Hall2014 ER - TY - JOUR AU - Clayton, E. v. e. l. y. n. M. AU - Daly, K. a. r. e. n. M. AU - Guinane, C. a. i. t. r. i. o. n. a. M. AU - Hill, C. o. l. i. n. AU - Cotter, P. a. u. l. D. AU - Ross, P. a. u. l. R. PY - 2014 DA - 2014// TI - Atypical Listeria innocua strains possess an intact LIPI-3 JO - BMC Microbiology VL - 14 UR - https://doi.org/10.1186/1471-2180-14-58 DO - 10.1186/1471-2180-14-58 ID - Clayton2014 ER - TY - JOUR AU - Camejo, A. n. a. AU - Buchrieser, C. a. r. m. e. n. AU - Couvé, E. l. i. s. a. b. e. t. h. AU - Carvalho, F. i. l. i. p. e. AU - Reis, O. l. g. a. AU - Ferreira, P. i. e. r. r. e. AU - Sousa, S. a. n. d. r. a. AU - Cossart, P. a. s. c. a. l. e. AU - Cabanes, D. i. d. i. e. r. PY - 2009 DA - 2009// TI - In Vivo Transcriptional Profiling of Listeria monocytogenes and Mutagenesis Identify New Virulence Factors Involved in Infection JO - PLoS Pathogens VL - 5 UR - https://doi.org/10.1371/journal.ppat.1000449 DO - 10.1371/journal.ppat.1000449 ID - Camejo2009 ER - TY - JOUR AU - Cabanes, D. i. d. i. e. r. AU - Sousa, S. a. n. d. r. a. AU - Cebriá, A. n. t. o. n. i. o. AU - Lecuit, M. a. r. c. AU - García-del Portillo, F. r. a. n. c. i. s. c. o. AU - Cossart, P. a. s. c. a. l. e. PY - 2005 DA - 2005// TI - Gp96 is a receptor for a novel Listeria monocytogenes virulence factor, Vip, a surface protein JO - The EMBO Journal VL - 24 UR - https://doi.org/10.1038/sj.emboj.7600750 DO - 10.1038/sj.emboj.7600750 ID - Cabanes2005 ER - TY - JOUR AU - Jacquet, C. h. r. i. s. t. i. n. e. AU - Doumith, M. i. c. h. e. l. AU - Gordon, J. e. f. f. r. e. y.  . I. AU - Martin, P. a. u. l.  . M.  . V. AU - Cossart, P. a. s. c. a. l. e. AU - Lecuit, M. a. r. c. PY - 2004 DA - 2004// TI - A Molecular Marker for Evaluating the Pathogenic Potential of FoodborneListeria monocytogenes JO - The Journal of Infectious Diseases VL - 189 UR - https://doi.org/10.1086/420853 DO - 10.1086/420853 ID - Jacquet2004 ER - TY - JOUR AU - Ratani, S. h. a. k. i. r. S. AU - Siletzky, R. o. b. i. n. M. AU - Dutta, V. i. k. r. a. n. t. AU - Yildirim, S. u. l. e. y. m. a. n. AU - Osborne, J. a. s. o. n. A. AU - Lin, W. e. n. AU - Hitchins, A. n. t. h. o. n. y. D. AU - Ward, T. o. d. d. J. AU - Kathariou, S. o. p. h. i. a. PY - 2012 DA - 2012// TI - Heavy Metal and Disinfectant Resistance of Listeria monocytogenes from Foods and Food Processing Plants JO - Applied and Environmental Microbiology VL - 78 UR - https://doi.org/10.1128/AEM.01553-12 DO - 10.1128/AEM.01553-12 ID - Ratani2012 ER - TY - STD TI - Parsons C, Lee S, Jayeola V, Kathariou S. Characterization of a novel cadmium resistance determinant in Listeria monocytogenes. Appl Environ Microbiol. 2016. ID - ref69 ER - TY - STD TI - Lebrun M, Audurier A, Cossart P. Plasmid-borne cadmium resistance genes are similar to cadA and cadC of Staphylococcus aureus and are induced by cadmium. J Bacteriol. 1994;176:3040–8. ID - ref70 ER - TY - JOUR AU - Bay, D. C. AU - Rommens, K. L. AU - Turner, R. J. PY - 2008 DA - 2008// TI - Small multidrug resistance proteins: a multidrug transporter family that continues to grow JO - Biochim Biophys Acta VL - 1778 UR - https://doi.org/10.1016/j.bbamem.2007.08.015 DO - 10.1016/j.bbamem.2007.08.015 ID - Bay2008 ER - TY - JOUR AU - Beceiro, A. AU - Tomas, M. AU - Bou, G. PY - 2013 DA - 2013// TI - Antimicrobial resistance and virulence: a successful or deleterious association in the bacterial world? JO - Clin Microbiol Rev VL - 26 UR - https://doi.org/10.1128/CMR.00059-12 DO - 10.1128/CMR.00059-12 ID - Beceiro2013 ER - TY - STD TI - Pombinho R, Camejo A, Vieira A, Reis O, Carvalho F, Almeida MT, Pinheiro JC, Sousa S, Cabanes D. Listeria monocytogenes CadC regulates cadmium efflux and fine-tunes lipoprotein localization to escape the host immune response and promote infection. J Infect Dis. 2017;215:1468–79. ID - ref73 ER - TY - STD TI - Lebrun M, Loulergue J, Chaslus-Dancla E, Audurier A. Plasmids in Listeria monocytogenes in relation to cadmium resistance. Appl Environ Microbiol. 1989;58:3183–6. ID - ref74 ER - TY - JOUR AU - McLauchlin, J. AU - Hampton, M. D. AU - Shah, S. AU - Threlfall, E. J. AU - Wieneke, A. A. AU - Curtis, G. D. W. PY - 1997 DA - 1997// TI - Subtyping of Listeria monocytogenes on the basis of plasmid profiles and arsenic and cadmium susceptibility JO - J Appl Microbiol VL - 83 UR - https://doi.org/10.1046/j.1365-2672.1997.00238.x DO - 10.1046/j.1365-2672.1997.00238.x ID - McLauchlin1997 ER - TY - JOUR AU - Chattopadhyay, S. AU - Weissman, S. J. AU - Minin, V. N. AU - Russo, T. A. AU - Dykhuizen, D. E. AU - Sokurenko, E. V. PY - 2009 DA - 2009// TI - High frequency of hotspot mutations in core genes of Escherichia coli due to short-term positive selection JO - Proceedings of the National Academy of Sciences VL - 106 UR - https://doi.org/10.1073/pnas.0906217106 DO - 10.1073/pnas.0906217106 ID - Chattopadhyay2009 ER - TY - STD TI - Camprubí-Font C, Lopez-Siles M, Ferrer-Guixeras M, Niubó-Carulla L, Abellà-Ametller C, Garcia-Gil LJ, Martinez-Medina M. Comparative genomics reveals new single-nucleotide polymorphisms that can assist in identification of adherent-invasive Escherichia coli. Sci Rep. 2018;8:2695. ID - ref77 ER -