Skip to main content

Table 2 Novel miRNAs harbouring both 5p and 3p sequences

From: MicroRNAs and their targets in cucumber shoot apices in response to temperature and photoperiod

miRNA mfe seq(5p) count(5p) seq(3p) Count(3p)
csa-novel-mir3 − 24.2 ATCAAGTCAGGATGGCCGAGT 44 TCAAGTTCTGGTCTTCGTGA 16
csa-novel-mir7 − 93.1 TTCGACTGCCTATATCTTTCCTT 5 GGAATGATGTAGCATGAAAG 3
csa-novel-mir12 − 56.9 TTTTTAACAGATTAATTGGACA 2207 ACCAAATTGATTTAAGAGGC 8
csa-novel-mir13 − 18.27 TCGAACATAAAGGAACATGAGTT 22 CCATCATGGTTCTTTTGTTTGGAC 2
csa-novel-mir29 − 41.29 AACTACTATTCATTTCAAAAT 1 TTGGAAATGAATAGTAGTTTA 14
csa-novel-mir33 − 47.8 TACAAGTTATGACTTATGAGT 3 TCATAACTTGTAACTTGTCCG 8
csa-novel-mir36 −29.62 TTTTTGTGATTCGTGGATTTTTC 51 AATATCCACGTATTGATGGAAATT 1
csa-novel-mir42 − 58.2 TGAAGTATGAACTGAAAGGAA 29 CCTTTCAATTCATACTTATTT 9
csa-novel-mir54 − 45.1 TCGGTGGTCGTGTGGTTTCAG 22 AATCACACAACCATCGATC 1
csa-novel-mir62 − 60.5 CATGACCAAAATGCGAACTTA 38 AGTTTGTTTTTTGGTCATGTC 1
csa-novel-mir63 − 31.7 TCTTTAATCAACTCAACCAAA 1 TGGTTGAGCTGATTTAAGGAT 9
csa-novel-mir68 − 40.3 TTTAAAAACCATACCAGAATT 6 TTTTGGCATGGTTTTTAAACC 1
csa-novel-mir75 − 43.8 CGGTGGAGCGATGTTCTTGGACT 1 TTCGAGAAGGGCTTGATTGGT 14
csa-novel-mir89 −42.51 TTGCTGCTCATTCGTTAGTTC 37 TCTAACGATGTAGGAGCAATC 238
csa-novel-mir104 − 46.9 TCGGACATCGGCGACTTGGAA 51,816 TTCCAAGTCCACCCATGCCCGC 15,481
csa-novel-mir106 − 149.6 TAGCTGTTAAATATGAAGACGA 32,337 GTCTTCATATTTAACAGCTAAT 37
csa-novel-mir113 −41.1 TCGCAGAAGAGATGGTGCCGT 4628 GGCATCATATCCTCTGCGCAA 322
csa-novel-mir136 − 66.54 AGTCTACTGTTTCATTCTTGA 3 AAGAATGAAACAGTAGACTCA 147
csa-novel-mir141 − 21.9 TTTGACACGAGCACCTGAAAAAT 4188 TTTTCGGTTTCTCGAGTTACGAAC 3