| + amoxicillin | + enrofloxacin | + kanamycin | + tetracycline | ||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
WT | ENROR | KANR | TETR | WT | AMXR | KANR | TETR | WT | AMXR | ENROR | TETR | WT | AMXR | ENROR | KANR | |
Amplifications | ||||||||||||||||
 ampC | 2/2 | 4/4 | 4/4 | 4/4 |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |
Deletions | ||||||||||||||||
 clpS-clpA |  |  |  |  |  |  |  | 1/4 |  |  | 1/3 | 1/4 |  |  |  |  |
 yaiT-yaiW |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  | 1/3 |  |  |  |  |  |
 slyA-nemA |  |  |  | 1/4 |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |
 prophage e14 |  | 2/4 | 2/4 | 1/4 |  | 1/4 | 2/4 | 1/3 |  |  |  | 1/4 |  | 4/4 | 3/4 |  |
Insertions | ||||||||||||||||
 fimA | 2/2 | 4/4 | 3/4 | 1/4 |  | 1/4 |  |  |  | 2/3 |  |  |  | 3/4 |  |  |
 yeaR |  |  |  |  |  | 4/4 | 1/4 | 2/4 |  |  | 3/3 |  |  |  | 4/4 |  |
 dcuC/pagP |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  | 3/3 | 2/4 |  |  |  | 1/1 |
 mgrB/yobH |  |  |  | 3/4 |  |  |  |  |  |  |  | 3/4 |  |  |  | 1/1 |
 oppB |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  | 1/3 | 1/4 |  |  |  |  |
 clpX/lon |  |  |  |  |  | 2/4 |  | 1/3 |  |  |  |  |  |  | 1/3 |  |
 cyoA |  |  | 1/4 |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |