Table 8 Performance comparision on DIP and HPRD+BioGRID datasets

DIP

MCODE

89

0.2585

0.0722

0.1129

0.2671

0.0546

0.0907

MCL

624

0.1725

0.1736

0.1731

0.1834

0.1356

0.1559

CFinder

992 ^2nd

0.3448 ^2nd

0.1883

0.2435 ^3rd

0.3269

0.1288

0.1848

DPClus

747

0.2275

0.1966

0.2109

0.2305

0.1418 ^3rd

0.1756

IPCA

904 ^3rd

0.3488 ^{1 st}

0.2005 ^3rd

0.2546 ^2nd

0.3455 ^{1 st}

0.1401

0.1994 ^2nd

CMC

358

0.3448 ^2nd

0.1881

0.2434

0.3383 ^2nd

0.1347

0.1926 ^3rd

COACH

389

0.2402

0.171

0.1998

0.2394

0.1234

0.1628

HC-PIN

229

0.0902

0.0571

0.07

0.1015

0.0478

0.065

SPICi

369

0.2364

0.1652

0.1945

0.246

0.1208

0.1621

ClusterONE

363

0.2696

0.135

0.1799

0.2694

0.1029

0.1489

WPNCA

535

0.2713

0.177

0.2143

0.2697

0.1306

0.176

CALM

1591 ^{1 st}

0.1665

0.2057 ^2nd

0.1841

0.1756

0.1569 ^2nd

0.1657

ClusterEPs

N/A

N/A

N/A

N/A

N/A

N/A

N/A

SE-DMTG

604

0.3383 ^3rd

0.2207 ^{1 st}

0.2672 ^{1 st}

0.3290 ^3rd

0.1584 ^{1 st}

0.2139 ^{1 st}

HPRD + BioGRID

MCODE

86

0.0969

0.0603

0.0743

0.1027

0.0587

0.0747

MCL

1094

0.0853

0.1806

0.1158

0.1032

0.1582

0.1249

CFinder

N/A

N/A

N/A

N/A

N/A

N/A

N/A

DPClus

1881

0.1943

0.2918

0.2332

0.2123

0.2442

0.2272

IPCA

9989 ^{1 st}

0.2463 ^2nd

0.3139 ^2nd

0.276 ^3rd

0.2548 ^2nd

0.2614

0.2581 ^3rd

CMC

N/A

N/A

N/A

N/A

N/A

N/A

N/A

COACH

4296 ^3rd

0.183

0.3114 ^3rd

0.2305

0.1933

0.2641 ^3rd

0.2232

HC-PIN

N/A

N/A

N/A

N/A

N/A

N/A

N/A

SPICi

1100

0.171

0.2119

0.1893

0.1944

0.1829

0.1885

ClusterONE

1763

0.145

0.2166

0.1737

0.1811

0.1932

0.1869

WPNCA

2750

0.2251 ^3rd

0.3120

0.2615 ^2nd

0.2462 ^3rd

0.2687 ^2nd

0.2570 ^3rd

CALM

7810 ^2nd

0.0283

0.2456

0.0507

0.0348

0.2001

0.0593

ClusterEPs

N/A

N/A

N/A

N/A

N/A

N/A

N/A

SE-DMTG

2773

0.4409 ^{1 st}

0.4046 ^{1 st}

0.422 ^{1 st}

0.467 ^{1 st}

0.3258 ^{1 st}

0.3838 ^{1 st}