TY - JOUR AU - Traoré, A. AU - Notter, D. R. AU - Soudre, A. AU - Kaboré, A. AU - Álvarez, I. AU - Fernández, I. AU - Sanou, M. AU - Shamshuddin, M. AU - Periasamy, K. AU - Tamboura, H. H. PY - 2017 DA - 2017// TI - Resistance to gastrointestinal parasite infection in Djallonké sheep JO - Animal VL - 11 ID - Traoré2017 ER - TY - JOUR AU - Goossens, B. AU - Osaer, S. AU - Ndao, M. AU - Winghem, J. AU - Geerts, S. PY - 1999 DA - 1999// TI - The susceptibility of Djallonke and Djallonke-Sahelian crossbred sheep to Trypanosoma congolense and helminth infection under different diet levels JO - Vet Parasitol VL - 85 UR - https://doi.org/10.1016/S0304-4017(99)00087-4 DO - 10.1016/S0304-4017(99)00087-4 ID - Goossens1999 ER - TY - JOUR AU - Dolan, R. B. PY - 1987 DA - 1987// TI - Genetics and trypanotolerance JO - Parasitol Today VL - 3 UR - https://doi.org/10.1016/0169-4758(87)90197-9 DO - 10.1016/0169-4758(87)90197-9 ID - Dolan1987 ER - TY - JOUR AU - Naessens, J. PY - 2006 DA - 2006// TI - Bovine trypanotolerance: a natural ability to prevent severe anaemia and haemophagocytic syndrome? JO - Int J Parasitol VL - 36 UR - https://doi.org/10.1016/j.ijpara.2006.02.012 DO - 10.1016/j.ijpara.2006.02.012 ID - Naessens2006 ER - TY - JOUR AU - Muigai, A. W. T. AU - Hanotte, O. PY - 2013 DA - 2013// TI - The origin of African sheep: archaeological and genetic perspectives JO - Afr Archaeol Rev VL - 30 UR - https://doi.org/10.1007/s10437-013-9129-0 DO - 10.1007/s10437-013-9129-0 ID - Muigai2013 ER - TY - JOUR AU - Peripolli, E. AU - Munari, D. P. AU - Silva, M. V. G. B. AU - Lima, A. L. F. AU - Irgang, R. AU - Baldi, F. PY - 2016 DA - 2016// TI - Runs of homozygosity: current knowledge and applications in livestock JO - Anim Genet VL - 48 UR - https://doi.org/10.1111/age.12526 DO - 10.1111/age.12526 ID - Peripolli2016 ER - TY - JOUR AU - Marshall, K. AU - Mugambi, J. M. AU - Nagda, S. AU - Sonstegard, T. S. AU - Tassell, C. P. AU - Baker, R. L. AU - Gibson, J. P. PY - 2013 DA - 2013// TI - Quantitative trait loci for resistance to Haemonchus contortus artificial challenge in red Maasai and Dorper sheep of East Africa JO - Anim Genet VL - 44 UR - https://doi.org/10.1111/j.1365-2052.2012.02401.x DO - 10.1111/j.1365-2052.2012.02401.x ID - Marshall2013 ER - TY - JOUR AU - Benavides, M. V. AU - Sonstegard, T. S. AU - Tassell, C. PY - 2016 DA - 2016// TI - Genomic regions associated with sheep resistance to gastrointestinal nematodes JO - Trends Parasitol VL - 32 UR - https://doi.org/10.1016/j.pt.2016.03.007 DO - 10.1016/j.pt.2016.03.007 ID - Benavides2016 ER - TY - JOUR AU - Goossens, B. AU - Osaer, S. AU - Kora, S. AU - Jaitner, J. AU - Ndao, M. AU - Geerts, S. PY - 1997 DA - 1997// TI - The interaction of Trypanosoma congolense and Haemonchus contortus in Djallonke sheep JO - Int J Parasitol VL - 27 UR - https://doi.org/10.1016/S0020-7519(97)00094-5 DO - 10.1016/S0020-7519(97)00094-5 ID - Goossens1997 ER - TY - JOUR AU - Osaer, S. AU - Goossens, B. AU - Kora, S. AU - Gaye, M. AU - Darboe, L. PY - 1999 DA - 1999// TI - Health and productivity of traditionally managed Djallonke sheep and west African dwarf goats under high and moderate trypanosomosis risk JO - Vet Parasitol VL - 82 UR - https://doi.org/10.1016/S0304-4017(99)00011-4 DO - 10.1016/S0304-4017(99)00011-4 ID - Osaer1999 ER - TY - JOUR AU - Murray, M. AU - Trail, J. C. M. PY - 1984 DA - 1984// TI - Genetic resistance to animal trypanosomiasis in Africa JO - Prev Vet Med VL - 2 UR - https://doi.org/10.1016/0167-5877(84)90100-4 DO - 10.1016/0167-5877(84)90100-4 ID - Murray1984 ER - TY - JOUR AU - Sanni, M. T. AU - Gbolabo, O. O. AU - Mufliat, A. A. AU - Abdulmojeed, Y. AU - Christian, O. N. I. AU - Olufunmilayo, A. A. AU - Adewale, O. T. AU - Michael, O. O. AU - Mathew, W. AU - Michael, I. T. PY - 2013 DA - 2013// TI - Molecular diagnosis of subclinical African Trypanosoma vivax infection and association with physiological indices and serum metabolites in extensively managed goats in the tropics JO - Open J Vet Med VL - 03 UR - https://doi.org/10.4236/ojvm.2013.31007 DO - 10.4236/ojvm.2013.31007 ID - Sanni2013 ER - TY - JOUR AU - Stijlemans, B. AU - Baetselier, P. AU - Magez, S. AU - Ginderachter, J. A. AU - Trez, C. PY - 2018 DA - 2018// TI - African trypanosomiasis-associated anemia: the contribution of the interplay between parasites and the mononuclear phagocyte system JO - Front Immunol VL - 9 UR - https://doi.org/10.3389/fimmu.2018.00218 DO - 10.3389/fimmu.2018.00218 ID - Stijlemans2018 ER - TY - JOUR AU - Geerts, S. AU - Osaer, S. AU - Goossens, B. AU - Faye, D. PY - 2009 DA - 2009// TI - Trypanotolerance in small ruminants of sub-Saharan Africa JO - Trends Parasitol VL - 25 UR - https://doi.org/10.1016/j.pt.2008.12.004 DO - 10.1016/j.pt.2008.12.004 ID - Geerts2009 ER - TY - JOUR AU - Namangala, B. PY - 2012 DA - 2012// TI - Contribution of innate immune responses towards resistance to African trypanosome infections JO - Scand J Immunol VL - 75 UR - https://doi.org/10.1111/j.1365-3083.2011.02619.x DO - 10.1111/j.1365-3083.2011.02619.x ID - Namangala2012 ER - TY - JOUR AU - Yaro, M. AU - Munyard, K. A. AU - Stear, M. J. AU - Groth, D. M. PY - 2016 DA - 2016// TI - Combatting African animal Trypanosomiasis (AAT) in livestock: the potential role of trypanotolerance JO - Vet Parasitol VL - 225 UR - https://doi.org/10.1016/j.vetpar.2016.05.003 DO - 10.1016/j.vetpar.2016.05.003 ID - Yaro2016 ER - TY - JOUR AU - Brahi, O. H. D. AU - Xiang, H. AU - Chen, X. AU - Farougou, S. AU - Zhao, X. PY - 2015 DA - 2015// TI - Mitogenome revealed multiple postdomestication genetic mixtures of west African sheep JO - J Anim Breed Genet VL - 132 UR - https://doi.org/10.1111/jbg.12144 DO - 10.1111/jbg.12144 ID - Brahi2015 ER - TY - JOUR AU - Yaro, M. AU - Munyard, K. A. AU - Morgan, E. AU - Allcock, R. J. AU - Stear, M. J. AU - Groth, D. M. PY - 2016 DA - 2016// TI - P4041 Pooled whole-genome sequencing reveals molecular signatures of natural adaptive selection in Djallonke sheep of Ghana JO - J Anim Sci VL - 94 UR - https://doi.org/10.2527/jas2016.94supplement498a DO - 10.2527/jas2016.94supplement498a ID - Yaro2016 ER - TY - JOUR AU - Yuan, Y. AU - Xu, H. AU - Leung, R. K. -. K. PY - 2016 DA - 2016// TI - An optimized protocol for generation and analysis of ion proton sequencing reads for RNA-Seq JO - BMC Genomics VL - 17 UR - https://doi.org/10.1186/s12864-016-2745-8 DO - 10.1186/s12864-016-2745-8 ID - Yuan2016 ER - TY - JOUR AU - Li, H. AU - Handsaker, B. AU - Wysoker, A. AU - Fennell, T. AU - Ruan, J. AU - Homer, N. AU - Marth, G. AU - Abecasis, G. AU - Durbin, R. PY - 2009 DA - 2009// TI - Genome project data processing S: the sequence alignment/map format and SAMtools JO - Bioinformatics VL - 25 UR - https://doi.org/10.1093/bioinformatics/btp352 DO - 10.1093/bioinformatics/btp352 ID - Li2009 ER - TY - JOUR AU - Danecek, P. AU - Auton, A. AU - Abecasis, G. AU - Albers, C. A. AU - Banks, E. AU - DePristo, M. A. AU - Handsaker, R. E. AU - Lunter, G. AU - Marth, G. T. AU - Sherry, S. T. PY - 2011 DA - 2011// TI - The variant call format and VCFtools JO - Bioinformatics VL - 27 UR - https://doi.org/10.1093/bioinformatics/btr330 DO - 10.1093/bioinformatics/btr330 ID - Danecek2011 ER - TY - JOUR AU - Yang, J. AU - Lee, S. H. AU - Goddard, M. E. AU - Visscher, P. M. PY - 2011 DA - 2011// TI - GCTA: a tool for genome-wide complex trait analysis JO - Am J Hum Genet VL - 88 UR - https://doi.org/10.1016/j.ajhg.2010.11.011 DO - 10.1016/j.ajhg.2010.11.011 ID - Yang2011 ER - TY - JOUR AU - Yang, J. AU - Benyamin, B. AU - McEvoy, B. P. AU - Gordon, S. AU - Henders, A. K. AU - Nyholt, D. R. AU - Madden, P. A. AU - Heath, A. C. AU - Martin, N. G. AU - Montgomery, G. W. PY - 2010 DA - 2010// TI - Common SNPs explain a large proportion of the heritability for human height JO - Nat Genet VL - 42 UR - https://doi.org/10.1038/ng.608 DO - 10.1038/ng.608 ID - Yang2010 ER - TY - JOUR AU - Reich, D. AU - Price, A. L. AU - Patterson, N. PY - 2008 DA - 2008// TI - Principal component analysis of genetic data JO - Nat Genet VL - 40 UR - https://doi.org/10.1038/ng0508-491 DO - 10.1038/ng0508-491 ID - Reich2008 ER - TY - JOUR AU - Zheng, X. AU - Levine, D. AU - Shen, J. AU - Gogarten, S. M. AU - Laurie, C. AU - Weir, B. S. PY - 2012 DA - 2012// TI - A high-performance computing toolset for relatedness and principal component analysis of SNP data JO - Bioinformatics VL - 28 UR - https://doi.org/10.1093/bioinformatics/bts606 DO - 10.1093/bioinformatics/bts606 ID - Zheng2012 ER - TY - JOUR AU - Gormez, Z. AU - Bakir-Gungor, B. AU - Sagiroglu, M. S. PY - 2014 DA - 2014// TI - HomSI: a homozygous stretch identifier from next-generation sequencing data JO - Bioinformatics VL - 30 UR - https://doi.org/10.1093/bioinformatics/btt686 DO - 10.1093/bioinformatics/btt686 ID - Gormez2014 ER - TY - JOUR AU - Bayrakli, F. AU - Poyrazoglu, H. G. AU - Yuksel, S. AU - Yakicier, C. AU - Erguner, B. AU - Sagiroglu, M. S. AU - Yuceturk, B. AU - Ozer, B. AU - Doganay, S. AU - Tanrikulu, B. PY - 2015 DA - 2015// TI - Hereditary spastic paraplegia with recessive trait caused by mutation in KLC4 gene JO - J Hum Genet VL - 60 UR - https://doi.org/10.1038/jhg.2015.109 DO - 10.1038/jhg.2015.109 ID - Bayrakli2015 ER - TY - JOUR AU - Kancheva, D. AU - Atkinson, D. AU - Rijk, P. AU - Zimon, M. AU - Chamova, T. AU - Mitev, V. AU - Yaramis, A. AU - Maria Fabrizi, G. AU - Topaloglu, H. AU - Tournev, I. PY - 2016 DA - 2016// TI - Novel mutations in genes causing hereditary spastic paraplegia and Charcot-Marie-tooth neuropathy identified by an optimized protocol for homozygosity mapping based on whole-exome sequencing JO - Genet Med VL - 18 UR - https://doi.org/10.1038/gim.2015.139 DO - 10.1038/gim.2015.139 ID - Kancheva2016 ER - TY - JOUR AU - Tuncer, F. N. AU - Gormez, Z. AU - Calik, M. AU - Altiokka Uzun, G. AU - Sagiroglu, M. S. AU - Yuceturk, B. AU - Yuksel, B. AU - Baykan, B. AU - Bebek, N. AU - Iscan, A. PY - 2015 DA - 2015// TI - A clinical variant in SCN1A inherited from a mosaic father cosegregates with a novel variant to cause Dravet syndrome in a consanguineous family JO - Epilepsy Res VL - 113 UR - https://doi.org/10.1016/j.eplepsyres.2015.02.020 DO - 10.1016/j.eplepsyres.2015.02.020 ID - Tuncer2015 ER - TY - JOUR AU - Brown, E. A. AU - Pilkington, J. G. AU - Nussey, D. H. AU - Watt, K. A. AU - Hayward, A. D. AU - Tucker, R. AU - Graham, A. L. AU - Paterson, S. AU - Beraldi, D. AU - Pemberton, J. M. PY - 2013 DA - 2013// TI - Detecting genes for variation in parasite burden and immunological traits in a wild population: testing the candidate gene approach JO - Mol Ecol VL - 22 UR - https://doi.org/10.1111/j.1365-294X.2012.05757.x DO - 10.1111/j.1365-294X.2012.05757.x ID - Brown2013 ER - TY - JOUR AU - Kim, E. S. AU - Elbeltagy, A. R. AU - Aboul-Naga, A. M. AU - Rischkowsky, B. AU - Sayre, B. AU - Mwacharo, J. M. AU - Rothschild, M. F. PY - 2016 DA - 2016// TI - Multiple genomic signatures of selection in goats and sheep indigenous to a hot arid environment JO - Heredity VL - 116 UR - https://doi.org/10.1038/hdy.2015.94 DO - 10.1038/hdy.2015.94 ID - Kim2016 ER - TY - JOUR AU - Cunningham, F. AU - Amode, M. R. AU - Barrell, D. AU - Beal, K. AU - Billis, K. AU - Brent, S. AU - Carvalho-Silva, D. AU - Clapham, P. AU - Coates, G. AU - Fitzgerald, S. PY - 2015 DA - 2015// TI - Ensembl 2015 JO - Nucleic Acids Res VL - 43 UR - https://doi.org/10.1093/nar/gku1010 DO - 10.1093/nar/gku1010 ID - Cunningham2015 ER - TY - JOUR AU - Yates, A. AU - Akanni, W. AU - Amode, M. R. AU - Barrell, D. AU - Billis, K. AU - Carvalho-Silva, D. AU - Cummins, C. AU - Clapham, P. AU - Fitzgerald, S. AU - Gil, L. PY - 2016 DA - 2016// TI - Ensembl 2016 JO - Nucleic Acids Res VL - 44 UR - https://doi.org/10.1093/nar/gkv1157 DO - 10.1093/nar/gkv1157 ID - Yates2016 ER - TY - JOUR AU - Herrero, J. AU - Muffato, M. AU - Beal, K. AU - Fitzgerald, S. AU - Gordon, L. AU - Pignatelli, M. AU - Vilella, A. J. AU - Searle, S. M. J. AU - Amode, R. AU - Brent, S. PY - 2016 DA - 2016// TI - Ensembl comparative genomics resources JO - Database VL - 2016 UR - https://doi.org/10.1093/database/bav096 DO - 10.1093/database/bav096 ID - Herrero2016 ER - TY - JOUR AU - Hu, Z. L. AU - Park, C. A. AU - Reecy, J. M. PY - 2016 DA - 2016// TI - Developmental progress and current status of the animal QTLdb JO - Nucleic Acids Res VL - 44 UR - https://doi.org/10.1093/nar/gkv1233 DO - 10.1093/nar/gkv1233 ID - Hu2016 ER - TY - JOUR AU - Periasamy, K. AU - Pichler, R. AU - Poli, M. AU - Cristel, S. AU - Cetrá, B. AU - Medus, D. AU - Basar, M. AU - KT, A. AU - Ramasamy, S. AU - Ellahi, M. B. PY - 2014 DA - 2014// TI - Candidate Gene Approach for Parasite Resistance in Sheep – Variation in Immune Pathway Genes and Association with Fecal Egg Count JO - PLoS One VL - 9 UR - https://doi.org/10.1371/journal.pone.0088337 DO - 10.1371/journal.pone.0088337 ID - Periasamy2014 ER - TY - JOUR AU - McRae, K. M. AU - McEwan, J. C. AU - Dodds, K. G. AU - Gemmell, N. J. PY - 2014 DA - 2014// TI - Signatures of selection in sheep bred for resistance or susceptibility to gastrointestinal nematodes JO - BMC Genomics VL - 15 UR - https://doi.org/10.1186/1471-2164-15-637 DO - 10.1186/1471-2164-15-637 ID - McRae2014 ER - TY - JOUR AU - Benavides, M. V. AU - Sonstegard, T. S. AU - Kemp, S. AU - Mugambi, J. M. AU - Gibson, J. P. AU - Baker, R. L. AU - Hanotte, O. AU - Marshall, K. AU - Tassell, C. PY - 2015 DA - 2015// TI - Identification of novel loci associated with gastrointestinal parasite resistance in a red Maasai x Dorper backcross population JO - PLoS One VL - 10 UR - https://doi.org/10.1371/journal.pone.0122797 DO - 10.1371/journal.pone.0122797 ID - Benavides2015 ER - TY - JOUR AU - Yang, Y. AU - Zhou, Q. -. J. AU - Chen, X. -. Q. AU - Yan, B. -. L. AU - Guo, X. -. L. AU - Zhang, H. -. L. AU - Du, A. -. F. PY - 2015 DA - 2015// TI - Profiling of differentially expressed genes in sheep T lymphocytes response to an artificial primary Haemonchus contortus infection JO - Parasit Vectors VL - 8 UR - https://doi.org/10.1186/s13071-015-0844-z DO - 10.1186/s13071-015-0844-z ID - Yang2015 ER - TY - JOUR AU - Guo, Z. AU - González, J. F. AU - Hernandez, J. N. AU - McNeilly, T. N. AU - Corripio-Miyar, Y. AU - Frew, D. AU - Morrison, T. AU - Yu, P. AU - Li, R. W. PY - 2016 DA - 2016// TI - Possible mechanisms of host resistance to Haemonchus contortus infection in sheep breeds native to the Canary Islands JO - Sci Rep VL - 6 UR - https://doi.org/10.1038/srep26200 DO - 10.1038/srep26200 ID - Guo2016 ER - TY - JOUR AU - Hanotte, O. AU - Ronin, Y. AU - Agaba, M. AU - Nilsson, P. AU - Gelhaus, A. AU - Horstmann, R. AU - Sugimoto, Y. AU - Kemp, S. AU - Gibson, J. AU - Korol, A. PY - 2003 DA - 2003// TI - Mapping of quantitative trait loci controlling trypanotolerance in a cross of tolerant west African N’Dama and susceptible east African Boran cattle JO - Proc Natl Acad Sci U S A VL - 100 UR - https://doi.org/10.1073/pnas.1232392100 DO - 10.1073/pnas.1232392100 ID - Hanotte2003 ER - TY - JOUR AU - Dayo, G. K. AU - Gautier, M. AU - Berthier, D. AU - Poivey, J. P. AU - Sidibe, I. AU - Bengaly, Z. AU - Eggen, A. AU - Boichard, D. AU - Thevenon, S. PY - 2012 DA - 2012// TI - Association studies in QTL regions linked to bovine trypanotolerance in a west African crossbred population JO - Anim Genet VL - 43 UR - https://doi.org/10.1111/j.1365-2052.2011.02227.x DO - 10.1111/j.1365-2052.2011.02227.x ID - Dayo2012 ER - TY - JOUR AU - Noyes, H. AU - Brass, A. AU - Obara, I. AU - Anderson, S. AU - Archibald, A. L. AU - Bradley, D. G. AU - Fisher, P. AU - Freeman, A. AU - Gibson, J. AU - Gicheru, M. PY - 2011 DA - 2011// TI - Genetic and expression analysis of cattle identifies candidate genes in pathways responding to Trypanosoma congolense infection JO - Proc Natl Acad Sci U S A VL - 108 UR - https://doi.org/10.1073/pnas.1013486108 DO - 10.1073/pnas.1013486108 ID - Noyes2011 ER - TY - JOUR AU - Maillard, J. C. AU - Berthier, D. AU - Thevenon, S. AU - Piquemal, D. AU - Chantal, I. AU - Marti, J. PY - 2005 DA - 2005// TI - Efficiency and limits of the serial analysis of gene expression (SAGE) method: discussions based on first results in bovine trypanotolerance JO - Vet Immunol Immunopathol VL - 108 UR - https://doi.org/10.1016/j.vetimm.2005.08.005 DO - 10.1016/j.vetimm.2005.08.005 ID - Maillard2005 ER - TY - JOUR AU - Berthier, D. AU - Quere, R. AU - Thevenon, S. AU - Belemsaga, D. AU - Piquemal, D. AU - Marti, J. AU - Maillard, J. C. PY - 2003 DA - 2003// TI - Serial analysis of gene expression (SAGE) in bovine trypanotolerance: preliminary results JO - Genet Sel Evol VL - 35 UR - https://doi.org/10.1186/1297-9686-35-S1-S35 DO - 10.1186/1297-9686-35-S1-S35 ID - Berthier2003 ER - TY - JOUR AU - Quinlan, A. R. AU - Hall, I. M. PY - 2010 DA - 2010// TI - BEDTools: a flexible suite of utilities for comparing genomic features JO - Bioinformatics VL - 26 UR - https://doi.org/10.1093/bioinformatics/btq033 DO - 10.1093/bioinformatics/btq033 ID - Quinlan2010 ER - TY - JOUR AU - Dayo, G. K. AU - Thevenon, S. AU - Berthier, D. AU - Moazami-Goudarzi, K. AU - Denis, C. AU - Cuny, G. AU - Eggen, A. AU - Gautier, M. PY - 2009 DA - 2009// TI - Detection of selection signatures within candidate regions underlying trypanotolerance in outbred cattle populations JO - Mol Ecol VL - 18 UR - https://doi.org/10.1111/j.1365-294X.2009.04141.x DO - 10.1111/j.1365-294X.2009.04141.x ID - Dayo2009 ER - TY - JOUR AU - O’Gorman, G. M. AU - Park, S. D. AU - Hill, E. W. AU - Meade, K. G. AU - Coussens, P. M. AU - Agaba, M. AU - Naessens, J. AU - Kemp, S. J. AU - MacHugh, D. E. PY - 2009 DA - 2009// TI - Transcriptional profiling of cattle infected with Trypanosoma congolense highlights gene expression signatures underlying trypanotolerance and trypanosusceptibility JO - BMC Genomics VL - 10 UR - https://doi.org/10.1186/1471-2164-10-207 DO - 10.1186/1471-2164-10-207 ID - O’Gorman2009 ER - TY - JOUR AU - Choi, J. W. AU - Choi, B. H. AU - Lee, S. H. AU - Lee, S. S. AU - Kim, H. C. AU - Yu, D. AU - Chung, W. H. AU - Lee, K. T. AU - Chai, H. H. AU - Cho, Y. M. PY - 2015 DA - 2015// TI - Whole-genome Resequencing analysis of Hanwoo and Yanbian cattle to identify genome-wide SNPs and signatures of selection JO - Mol Cell VL - 38 UR - https://doi.org/10.14348/molcells.2015.0019 DO - 10.14348/molcells.2015.0019 ID - Choi2015 ER - TY - JOUR AU - Gudbjartsson, D. F. AU - Sulem, P. AU - Helgason, H. AU - Gylfason, A. AU - Gudjonsson, S. A. AU - Zink, F. AU - Oddson, A. AU - Magnusson, G. AU - Halldorsson, B. V. AU - Hjartarson, E. PY - 2015 DA - 2015// TI - Sequence variants from whole genome sequencing a large group of Icelanders JO - Scientific Data VL - 2 UR - https://doi.org/10.1038/sdata.2015.11 DO - 10.1038/sdata.2015.11 ID - Gudbjartsson2015 ER - TY - JOUR AU - Guo, Y. AU - Long, J. AU - He, J. AU - Li, C. -. I. AU - Cai, Q. AU - Shu, X. -. O. AU - Zheng, W. AU - Li, C. PY - 2012 DA - 2012// TI - Exome sequencing generates high quality data in non-target regions JO - BMC Genomics VL - 13 UR - https://doi.org/10.1186/1471-2164-13-1 DO - 10.1186/1471-2164-13-1 ID - Guo2012 ER - TY - JOUR AU - Choi, J. -. W. AU - Liao, X. AU - Stothard, P. AU - Chung, W. -. H. AU - Jeon, H. -. J. AU - Miller, S. P. AU - Choi, S. -. Y. AU - Lee, J. -. K. AU - Yang, B. AU - Lee, K. -. T. PY - 2014 DA - 2014// TI - Whole-genome analyses of Korean native and Holstein cattle breeds by massively parallel sequencing JO - PLoS One VL - 9 UR - https://doi.org/10.1371/journal.pone.0101127 DO - 10.1371/journal.pone.0101127 ID - Choi2014 ER - TY - JOUR AU - Boitard, S. AU - Boussaha, M. AU - Capitan, A. AU - Rocha, D. AU - Servin, B. PY - 2016 DA - 2016// TI - Uncovering adaptation from sequence data: lessons from genome Resequencing of four cattle breeds JO - Genetics VL - 203 UR - https://doi.org/10.1534/genetics.115.181594 DO - 10.1534/genetics.115.181594 ID - Boitard2016 ER - TY - JOUR AU - Yaro, M. AU - Munyard, K. A. AU - Stear, M. J. AU - Groth, D. M. PY - 2017 DA - 2017// TI - Molecular identification of livestock breeds: a tool for modern conservation biology JO - Biol Rev Camb Philos Soc VL - 92 UR - https://doi.org/10.1111/brv.12265 DO - 10.1111/brv.12265 ID - Yaro2017 ER - TY - JOUR AU - Zhan, X. AU - Dixon, A. AU - Batbayar, N. AU - Bragin, E. AU - Ayas, Z. AU - Deutschova, L. AU - Chavko, J. AU - Domashevsky, S. AU - Dorosencu, A. AU - Bagyura, J. PY - 2015 DA - 2015// TI - Exonic versus intronic SNPs: contrasting roles in revealing the population genetic differentiation of a widespread bird species JO - Heredity VL - 114 UR - https://doi.org/10.1038/hdy.2014.59 DO - 10.1038/hdy.2014.59 ID - Zhan2015 ER - TY - JOUR AU - Gu, W. AU - Gurguis, C. I. AU - Zhou, J. J. AU - Zhu, Y. AU - Ko, E. -. A. AU - Ko, J. -. H. AU - Wang, T. AU - Zhou, T. PY - 2015 DA - 2015// TI - Functional and structural consequence of rare Exonic single nucleotide polymorphisms: one story Two Tales JO - Genome Biol Evol VL - 7 UR - https://doi.org/10.1093/gbe/evv191 DO - 10.1093/gbe/evv191 ID - Gu2015 ER - TY - JOUR AU - Mwacharo, J. M. AU - Elbeltagy, A. R. AU - Kim, E. S. AU - Haile, A. AU - Rischkowsky, B. AU - Rothschild, M. F. PY - 2016 DA - 2016// TI - S0124 Indigenous stocks as treasure troves for sustainable livestock production in the 21st century: Insights from small ruminant genomics JO - J Anim Sci VL - 94 UR - https://doi.org/10.2527/jas2016.94supplement412a DO - 10.2527/jas2016.94supplement412a ID - Mwacharo2016 ER - TY - JOUR AU - Mwai, O. AU - Hanotte, O. AU - Kwon, Y. J. AU - Cho, S. PY - 2015 DA - 2015// TI - African indigenous cattle: unique genetic resources in a rapidly changing world JO - Asian Australas J Anim Sci VL - 28 UR - https://doi.org/10.5713/ajas.15.0002R DO - 10.5713/ajas.15.0002R ID - Mwai2015 ER - TY - JOUR AU - Lee, K. T. AU - Chung, W. H. AU - Lee, S. Y. AU - Choi, J. W. AU - Kim, J. AU - Lim, D. AU - Lee, S. AU - Jang, G. W. AU - Kim, B. AU - Choy, Y. H. PY - 2013 DA - 2013// TI - Whole-genome resequencing of Hanwoo (Korean cattle) and insight into regions of homozygosity JO - BMC Genomics VL - 14 UR - https://doi.org/10.1186/1471-2164-14-519 DO - 10.1186/1471-2164-14-519 ID - Lee2013 ER - TY - JOUR AU - Gautier, M. AU - Foucaud, J. AU - Gharbi, K. AU - Cezard, T. AU - Galan, M. AU - Loiseau, A. AU - Thomson, M. AU - Pudlo, P. AU - Kerdelhue, C. AU - Estoup, A. PY - 2013 DA - 2013// TI - Estimation of population allele frequencies from next-generation sequencing data: pool-versus individual-based genotyping JO - Mol Ecol VL - 22 UR - https://doi.org/10.1111/mec.12360 DO - 10.1111/mec.12360 ID - Gautier2013 ER - TY - JOUR AU - Qanbari, S. AU - Pausch, H. AU - Jansen, S. AU - Somel, M. AU - Strom, T. M. AU - Fries, R. AU - Nielsen, R. AU - Simianer, H. PY - 2014 DA - 2014// TI - Classic selective sweeps revealed by massive sequencing in cattle JO - PLoS Genet VL - 10 UR - https://doi.org/10.1371/journal.pgen.1004148 DO - 10.1371/journal.pgen.1004148 ID - Qanbari2014 ER - TY - JOUR AU - Johansson, B. M. AU - Wiles, M. V. PY - 1995 DA - 1995// TI - Evidence for involvement of activin a and bone morphogenetic protein 4 in mammalian mesoderm and hematopoietic development JO - Mol Cell Biol VL - 15 UR - https://doi.org/10.1128/MCB.15.1.141 DO - 10.1128/MCB.15.1.141 ID - Johansson1995 ER - TY - JOUR AU - Eppig, J. T. AU - Blake, J. A. AU - Bult, C. J. AU - Kadin, J. A. AU - Richardson, J. E. PY - 2015 DA - 2015// TI - The mouse genome database (MGD): facilitating mouse as a model for human biology and disease JO - Nucleic Acids Res VL - 43 UR - https://doi.org/10.1093/nar/gku967 DO - 10.1093/nar/gku967 ID - Eppig2015 ER - TY - JOUR AU - Smith, C. M. AU - Finger, J. H. AU - Hayamizu, T. F. AU - McCright, I. J. AU - Xu, J. AU - Berghout, J. AU - Campbell, J. AU - Corbani, L. E. AU - Forthofer, K. L. AU - Frost, P. J. PY - 2014 DA - 2014// TI - The mouse gene expression database (GXD): 2014 update JO - Nucleic Acids Res VL - 42 UR - https://doi.org/10.1093/nar/gkt954 DO - 10.1093/nar/gkt954 ID - Smith2014 ER - TY - JOUR AU - Bult, C. J. AU - Krupke, D. M. AU - Begley, D. A. AU - Richardson, J. E. AU - Neuhauser, S. B. AU - Sundberg, J. P. AU - Eppig, J. T. PY - 2015 DA - 2015// TI - Mouse tumor biology (MTB): a database of mouse models for human cancer JO - Nucleic Acids Res VL - 43 UR - https://doi.org/10.1093/nar/gku987 DO - 10.1093/nar/gku987 ID - Bult2015 ER - TY - JOUR AU - Trail, J. C. AU - d'Ieteren, G. D. AU - Maille, J. C. AU - Yangari, G. PY - 1991 DA - 1991// TI - Genetic aspects of control of anaemia development in trypanotolerant N'Dama cattle JO - Acta Trop VL - 48 UR - https://doi.org/10.1016/0001-706X(91)90016-D DO - 10.1016/0001-706X(91)90016-D ID - Trail1991 ER - TY - JOUR AU - Maynard Smith, J. AU - Haigh, J. PY - 1974 DA - 1974// TI - The hitch-hiking effect of a favourable gene JO - Genet Res VL - 23 UR - https://doi.org/10.1017/S0016672300014634 DO - 10.1017/S0016672300014634 ID - Maynard Smith1974 ER - TY - JOUR AU - Kijas, J. W. AU - Lenstra, J. A. AU - Hayes, B. AU - Boitard, S. AU - Porto Neto, L. R. AU - San Cristobal, M. AU - Servin, B. AU - McCulloch, R. AU - Whan, V. AU - Gietzen, K. PY - 2012 DA - 2012// TI - Genome-wide analysis of the world's sheep breeds reveals high levels of historic mixture and strong recent selection JO - PLoS Biol VL - 10 UR - https://doi.org/10.1371/journal.pbio.1001258 DO - 10.1371/journal.pbio.1001258 ID - Kijas2012 ER - TY - JOUR AU - Roffler, G. H. AU - Amish, S. J. AU - Smith, S. AU - Cosart, T. AU - Kardos, M. AU - Schwartz, M. K. AU - Luikart, G. PY - 2016 DA - 2016// TI - SNP discovery in candidate adaptive genes using exon capture in a free-ranging alpine ungulate JO - Mol Ecol Resour VL - 16 UR - https://doi.org/10.1111/1755-0998.12560 DO - 10.1111/1755-0998.12560 ID - Roffler2016 ER - TY - JOUR AU - Alvarez, I. AU - Traore, A. AU - Kabore, A. AU - Zare, Y. AU - Fernandez, I. AU - Tamboura, H. H. AU - Goyache, F. PY - 2012 DA - 2012// TI - Microsatelitte analysis of the Rousse (red Sokoto) goat of Burkina Faso JO - Small Rumin Res VL - 105 UR - https://doi.org/10.1016/j.smallrumres.2012.01.012 DO - 10.1016/j.smallrumres.2012.01.012 ID - Alvarez2012 ER - TY - JOUR AU - Alvarez, I. AU - Traoré, A. AU - Tamboura, H. H. AU - Kabore, A. AU - Royo, L. J. AU - Fernández, I. AU - Ouédraogo-Sanou, G. AU - Sawadogo, L. AU - Goyache, F. PY - 2009 DA - 2009// TI - Microsatellite analysis characterizes Burkina Faso as a genetic contact zone between Sahelian and Djallonké sheep JO - Anim Biotechnol VL - 20 UR - https://doi.org/10.1080/10495390902786926 DO - 10.1080/10495390902786926 ID - Alvarez2009 ER -