Length of repeated unit | Taxa | |||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
O. latipes | D. rerio | O. niloticus | T. rubripes | E. lucius | L. oculatus | O. mykiss | C. carpio | I. punctatus | C. semilaevis | A. mexicanus | N. furzeri | P. reticulata | O. kisutch | |
4-nt | AAAT(4298) | AAAT(46819) | AAAT(7252) | ATCC(2657) | ACAG(4505) | AAAC(394) | ACAG(12845) | AAAT(26188) | AAAT(36182) | ATCC(7288) | ATAG(25367) | ATCC(7081) | ATCC(7303) | ACAG(30164) |
ATCC(4197) | ATAG(27227) | AAAC(4710) | ACAG(1263) | AGGG(2259) | ATCC(338) | AAAT(9010) | ATAG(11853) | AAAC(11498) | ATAG(4977) | AAAT(13454) | AAAT(5962) | AAAT(6468) | AGGG(9858) | |
ATAG(1888) | ATCC(23910) | ATCC(4352) | ATAG(812) | AATC(2201) | AAAT(282) | AGGG(6350) | Â | ATCC(10151) | AAAT(3814) | Â | ACGC(4103) | ATGG(1988) | AAAT(9303 | |
 | AATG(22059) |  | AAAT(747) | ACGC(1493) | AATC(253) | ACGC(5380) |  |  |  |  | ATAG(3514) |  |  | |
 |  |  |  |  | ACAG(228) |  |  |  |  |  |  |  |  | |
5-nt | AATTC(892) | AATAT(12313) | AATAG(2669) | AGAGG(1286) | ATACC(157) | AATTC(168) | AAATC(5447) | AAAAT(3745) | AAAAC(1282) | AGAGG(592) | AATGT(2997) | AATTC(1286) | AAAAT(580) | AAATC(7042) |
AAATC(552) | AAAAT(4838) | AATTC(2375) | Â | AGAGG(59) | AAAAC(104) | AGAGG(1922) | AATAT(3347) | AATTC(1214) | AATCT(465) | AATAT(1814) | ATACC(775) | AAAAC(457) | AGAGG(4021) | |
AATAG(494) | AAAAT(868) | Â | ATACG(49) | AATAC(80) | Â | AAATT(1092) | AATAT(1079) | AAAAT(383) | AAAAT(1119) | AATAG(684) | AATAG(326) | Â | ||
AAAAT(273) | Â | Â | AACGG(44) | AATAT(70) | Â | Â | AAAAT(965) | AATAT(346) | AAGAG(918) | AAAAT(327) | AATAT(244) | Â | ||
 |  |  |  | ACCCC(36) | AAATC(66) |  |  |  | AAAAC(326) | AATAG(535) |  | AAAAG(158) |  | |
 |  |  |  | AGGGG(35) | AAAAT(61) |  |  |  | ACTGG(270) | ATATC(496) |  |  |  | |
 |  |  |  | AAAAC(34) | ATGAC(60) |  |  |  | ATGTC(250) |  |  |  |  | |
 |  |  |  | ATCGC(29) | AAATT(41) |  |  |  |  |  |  |  |  | |
 |  |  |  | AACTG(28) | AAGCG(35) |  |  |  |  |  |  |  |  | |
 |  |  |  | AAGGC(28) | ACTGG(34) |  |  |  |  |  |  |  |  | |
 |  |  |  |  | CCCGG(34) |  |  |  |  |  |  |  |  | |
6-nt | AATCAG(75) | AAATGT(244) | AATCAG(107) | AACCCT(67) | ACACGC(94) | AACTTG(150) | ACAGAG(730) | AAAAAT(282) | ATACTG(99) | ACCAGG(156) | AATCCC(216) | ACACGC(236) | AACCAG(236) | ACAGAG(1106) |
ATATAG(28) | ACACGC(234) | ATATAC(87) | AGAGGG(42) | AACCCT(78) | AACAGG(51) | ACACGG(468) | AAATGT(187) | AAATGT(96) | ACACAG(134) | AAACTG(93) | AATCAG(102) | ACACGC(53) | AGAGGG(472) | |
AAATTC(18) | AAATAC(211) | ATATAG(52) | AATCCC(37) | ACACAG(45) | ACACTC(39) | AGAGGG(367) | AATCAG(174) | ATATAC(94) | AACCAG(101) | AAATGT(84) | AAGACG(71) | AAAAAT(26) | ACACGC(383) | |
AACCCT(16) | ATATAC(113) | AAAAAC(43) | ACAGAG(32) | AATCCC(41) | ACACGC(34) | AACCCT(321) | AAAGTG(124) | ATAGTC(65) | ATATAC(94) | AAAAAT(61) | AAATAC(52) | Â | ATACAC(279) | |
AATCCC(12) | AAAAAT(89) | AAAAAT(30) | ACCCCC(24) | ATATAC(40) | AATAAG(31) | ACACAG(272) | AATCCC(92) | ATATAG(62) | AAGAGG(90) | AAATAT(53) | AAACAT(50) | Â | AAAGAG(250) | |
AAAAAT(10) | AATAAG(26) | AATCAG(21) | AGCGGG(39) | AATCTG(30) | Â | Â | AAATAT(60) | ACCTGG(77) | ATATAC(53) | ATACAG(34) | Â | ACACAG(223) | ||
ATAGAG(10) | AAATTC(23) | ACACGC(21) | Â | AAATAT(29) | Â | Â | AACCCT(57) | ACAGAG(69) | AATCGT(52) | AATCCC(32) | Â | Â | ||
AAATAC(9) | Â | Â | AATCTG(20) | Â | ACACAG(28) | Â | Â | AAAAAT(52) | AAATAT(68) | AATGCT(51) | Â | Â | Â | |
AAAAAG(8) | Â | Â | AATTCT(18) | Â | AATCCC(25) | Â | Â | AAAAAC(43) | AGAGGG(54) | ATATAG(45) | Â | Â | Â | |
AAAATT(7) | Â | Â | ACTGGG(18) | Â | AATAAC(21) | Â | Â | ATACAC(33) | AACCCT(49) | AAAGTC(44) | Â | Â | Â | |
 |  |  | AAGAGG(17) |  | AACGGG(20) |  |  | AATCCC(32) | ACTCCC(48) | ACACTC(40) |  |  |  | |
 |  |  | ACACTC(17) |  | AACCCT(19) |  |  | AATAGT(27) | ACCTCC(45) | AAAGAG(38) |  |  |  | |
 |  |  | ACACAG(16) |  |  |  |  |  | AAAAAT(43) | ATGTCC(37) |  |  |  | |
 |  |  |  |  |  |  |  |  | AATCCC(43) | AAATCC(36) |  |  |  | |
 |  |  |  |  |  |  |  |  | ACTGGG(43) | AACCCT(34) |  |  |  | |
 |  |  |  |  |  |  |  |  | ATCAGC(39) |  |  |  |  | |
 |  |  |  |  |  |  |  |  | AAGATG(38) |  |  |  |  | |
 |  |  |  |  |  |  |  |  | AGTCGG(37) |  |  |  |  | |
 |  |  |  |  |  |  |  |  | ATGACC(37) |  |  |  |  |