Skip to main content

Table 1 Marker heterozygosity (Hexp and Hobs) (± SD) and genomic inbreeding (FVR ± SD) for breed and Merino bloodline groups for respective countries

From: The genomic structure of isolation across breed, country and strain for important South African and Australian sheep populations

Population

    

FVR

Breed

Country

N

Hexp (± SD)

Hobs (± SD)

Min

Mean (± SD)

Max

Merino

AUS

918

0.38 ± 0.12

0.36 ± 0.12

-0.15

0.09 ± 0.04

0.25

Dohne Merino

 

30

0.36 ± 0.14

0.36 ± 0.16

0.06

0.11 ± 0.03

0.20

Dorper

 

276

0.35 ± 0.14

0.35 ± 0.14

0.10

0.17 ± 0.04

0.30

SAMM

 

14

0.36 ± 0.14

0.36 ± 0.17

0.02

0.17 ± 0.06

0.28

Border Leicester

 

542

0.33 ± 0.15

0.32 ± 0.15

0.14

0.20 ± 0.03

0.32

Coopworth

 

114

0.35 ± 0.14

0.37 ± 0.15

0.07

0.13 ± 0.04

0.26

Corriedale

 

26

0.37 ± 0.13

0.37 ± 0.15

0.06

0.11 ± 0.03

0.18

Poll Dorset

 

400

0.34 ± 0.15

0.35 ± 0.15

0.10

0.19 ± 0.03

0.31

White Suffolk

 

247

0.37 ± 0.13

0.37 ± 0.14

0.02

0.12 ± 0.04

0.32

Merino

SA

697

0.37 ± 0.13

0.36 ± 0.13

0.00

0.09 ± 0.04

0.26

Dohne Merino

 

60

0.37 ± 0.13

0.37 ± 0.14

0.06

0.09 ± 0.02

0.14

Dorper

 

86

0.35 ± 0.14

0.34 ± 0.14

0.15

0.21 ± 0.03

0.31

SAMM

 

57

0.35 ± 0.14

0.35 ± 0.15

0.13

0.18 ± 0.03

0.29

Dormer

 

42

0.34 ± 0.15

0.34 ± 0.16

0.15

0.21 ± 0.03

0.27

Bloodline

Country

      

Ultrafine

AUS

270

0.37 ± 0.13

0.37 ± 0.13

-0.17

0.08 ± 0.03

0.19

Fine-Medium-1

 

224

0.35 ± 0.14

0.37 ± 0.15

-0.17

0.07 ± 0.04

0.24

Fine-Medium-2

 

133

0.34 ± 0.15

0.37 ± 0.17

-0.01

0.05 ± 0.05

0.22

Strong

 

291

0.35 ± 0.14

0.36 ± 0.15

-0.16

0.07 ± 0.03

0.17

Elsenburg

SA

400

0.36 ± 0.14

0.36 ± 0.14

-0.04

0.03 ± 0.04

0.16

Langgewens

 

14

0.36 ± 0.13

0.39 ± 0.18

-0.03

0.02 ± 0.05

0.15

Grootfontein

 

115

0.37 ± 0.13

0.37 ± 0.14

-0.01

0.06 ± 0.04

0.22

Industry

 

41

0.36 ± 0.14

0.36 ± 0.15

0.00

0.07 ± 0.04

0.16

Cradock

 

127

0.36 ± 0.13

0.37 ± 0.14

0.02

0.06 ± 0.02

0.14