Fragment No | Gene or region | Primer name | Sequence (5’-3’) | Length (bp) |
---|---|---|---|---|
F1 | 16S | Eno 16SF | GTTTKTGACCTCGATGTTGN | 171 |
 |  | Eno 16SR | CYTTTWGTTCCTTTCGTACT |  |
F2 (LR) | 16S-cox1 | MX F1 | AACGTCTGTTCGACGTAAGA | 3395 |
 |  | MX R1 | CTACATCCATACCTACGGTG |  |
F3 | cox1 | Eno COX1F | GATTHTTNGGTCAYCCTGAAGT | 614 |
 |  | Eno COX1R | ATACCGWCGNGGTATACCAT |  |
F4 (LR) | cox1-tRNA-Thr | MX F2 | GATTGCCATGAATGATAGGA | 7150 |
 |  | MX R2 | CAAAATCTATATTCTACTTAAAC |  |
F5 (LR) | nadL-16S | MX F3 | CAAAACCAATAATTCTGTGTG | 3469 |
 |  | MX R3 | TCTTACGTCGAACAGACGTT |  |