A robust and transformation-free joint model with matching and regularization for metagenomic trajectory and disease onset

Table 1 The type I error and power based on 10000 simulated replicates for a taxon at different levels of mean relative abundance (\(\varvec{y}\))

\(-\log _{10}(\varvec{y})\)		(0, 1]	(1, 2]	(2, 3]	(3, 4]	(4, 5]	(5, 6]
Type I error
	JMR-NC	0.01	0.003	0.008	0.0004	0	0
	JR-NC	0.061	0.03	0.001	0.002	0.0003	0.0005
\(N=100\)	LMM-N	0.045	0.031	0.026	0.033	0.068	0.052
\((S=50)\)	LMM-S	0.041	0.036	0.023	0.036	0.066	0.049
	ZIBR-N	0.057	0.066	0.080	0.053	0.164	0.369
	ZIBR-S	0.049	0.079	0.076	0.063	0.163	0.366
	JMR-NC	0.018	0.004	0.022	0.051	0.001	0.0003
	JR-NC	0.162	0.091	0.049	0.066	0.035	0.002
\(N=200\)	LMM-N	0.043	0.039	0.068	0.057	0.079	0.058
\((S=100)\)	LMM-S	0.046	0.051	0.066	0.060	0.079	0.056
	ZIBR-N	0.056	0.067	0.099	0.078	0.170	0.324
	ZIBR-S	0.059	0.088	0.099	0.088	0.174	0.324
Power
	JMR-NC	0.399	0.5	0.372	0.833	0.798	0.136
	JR-NC	0.32	0.65	0.051	0.057	0.548	0.040
\(N=100\)	LMM-N	0.040	0.084	0.474	0.107	0.552	0.512
\((S=50)\)	LMM-S	0.043	0.090	0.468	0.108	0.347	0.468
	ZIBR-N	0.06	0.088	0.412	0.123	0.743	0.666
	ZIBR-S	0.057	0.095	0.405	0.123	0.686	0.664
	JMR-NC	0.452	0.723	0.619	0.944	0.917	0.388
	JR-NC	0.677	0.699	0.194	0.836	0.737	0.324
\(N=200\)	LMM-N	0.06	0.115	0.429	0.478	0.287	0.253
\((S=100)\)	LMM-S	0.068	0.134	0.423	0.321	0.273	0.206
	ZIBR-N	0.057	0.332	0.433	0.667	0.280	0.379
	ZIBR-S	0.063	0.344	0.430	0.648	0.265	0.377

ISSN: 1471-2164