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Table 3 Distribution of pathogenicity-related genes over the different expression clusters

From: High-throughput time series expression profiling of Plasmopara halstedii infecting Helianthus annuus reveals conserved sequence motifs upstream of co-expressed genes

 

Pathogenicity related genes

 

RxLRs

CRN (Crinkler gene family)

Secreted proteases

Protease inhibitors

ATP-binding cassette (ABC) transporters

Number of genes

175

27

103

13

2

Cluster ID (Number of genes)

1(7), 2(7), 3(9), 5(2), 6(1), 7(1), 8(12), 9(2), 11(14), 12(10), 13(9), 14 (15), 15(1), 17(1), 18(4), 20(2), 21(4), 22(1), 23(2), 24(4), 25(2), 27(1), 28(3), 36(4), 38(2), 41(12), 46(3),47(1), 56(2), 59(2), 60(1), 62(2), 63(1), 65 (1), 66 (2), 68 (1), 75(1), 76(2), 81(4), 84(3), 87(1), 90(5), 91(1), 92(2), 99(1), 100(2), 102(1), 114(1), 130(3)

2(2), 5(1), 7(1), 11(6), 16(1), 19(1), 23(1), 24(1), 25(1), 26(1), 34(1), 54(1), 60(1), 61(1), 65(1), 67(1), 69(1), 71(1), 91(1), 102(1), 105(1)

2(5), 3(5), 7(1), 8(6), 11(9), 12(13),16(1), 18(5), 20(1), 21(1), 23(3), 24(4), 25(2), 26(1), 27(1), 28(2), 33(1), 36(2), 42(1), 46(1), 49(1), 51(1), 54(1), 55(1), 56(1), 59(3), 61(1), 62(1), 65(1), 67(3), 68(3), 69(4), 81(1), 88(1), 99(3), 105(2), 111(1), 112(1), 113(1), 126(1)

2(1), 4(1), 6(1), 8(2), 11(1), 14(1), 16(2), 29(1), 35(1), 41(1), 59(1)

12(1), 59(1)