A sequence-based hybrid predictor for identifying conformationally ambivalent regions in proteins

BMC Genomics

Table 1 Performance of Boden' s predictor with different cut-off values of entropy

Entropy Cuf-off	TP	FP	TN	FN	accuracy	sensitivity	specificity	precision	F-score	MCC
0.05	5803	54661	113	0	0.098	1.000	0.002	0.096	0.175	0.014
0.10	5792	54364	410	11	0.102	0.998	0.007	0.096	0.176	0.020
0.15	5703	49720	5054	100	0.178	0.983	0.092	0.103	0.186	0.079
0.20	5572	46635	8139	231	0.226	0.960	0.149	0.107	0.192	0.093
0.25	5328	43024	11750	475	0.282	0.918	0.215	0.110	0.197	0.097
0.30	4903	38576	16198	900	0.348	0.845	0.296	0.113	0.199	0.092
0.35	4468	34265	20509	1335	0.412	0.770	0.374	0.115	0.201	0.088
0.40	4009	30101	24673	1794	0.473	0.691	0.450	0.118	0.201	0.084
0.45	3584	26400	28374	2219	0.528	0.618	0.518	0.120	0.200	0.080
0.50	3142	22971	31803	2661	0.577	0.541	0.581	0.120	0.197	0.073
0.55	2702	19722	35052	3101	0.623	0.466	0.640	0.120	0.191	0.064
0.60	2254	16500	38274	3549	0.669	0.388	0.699	0.120	0.184	0.055
0.65	1730	12617	42157	4073	0.724	0.298	0.770	0.121	0.172	0.047
0.70	1100	8011	46763	4703	0.790	0.190	0.854	0.121	0.148	0.036
0.75	684	5183	49591	5119	0.830	0.118	0.905	0.117	0.117	0.023
0.80	463	3443	51331	5340	0.855	0.080	0.937	0.119	0.095	0.020
0.85	272	2238	52536	5531	0.872	0.047	0.959	0.108	0.065	0.009
0.90	142	1339	53435	5661	0.884	0.024	0.976	0.096	0.039	0.000
0.95	71	664	54110	5732	0.894	0.012	0.988	0.097	0.022	0.000

ISSN: 1471-2164