From: Generation of a BAC-based physical map of the melon genome
Markers | |||||||||||||||||||||
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Linkage Group: | I | II | III | IV | V | VI | VII | VIII | IX | X | XI | XII | mapping | TOTAL | |||||||
two LG | |||||||||||||||||||||
RFLP | |||||||||||||||||||||
Total Analyzed | 8 | 14 | 10 | 10 | 7 | 10 | 6 | 11 | 8 | 8 | 10 | 5 | 10 | 117 | |||||||
Non-Anchored a | 1 | 2 | 2 | 3 | 1 | 1 | 1 | 2 | 2 | 0 | 2 | 0 | 17 | ||||||||
Anchored to BACs | 7 | 12 | 8 | 7 | 6 | 9 | 5 | 9 | 6 | 8 | 8 | 5 | 10 | 100 | |||||||
Contigs | 7 | 11 | 7 | 6 | 6 | 8 | 5 | 7 | 5 | 7 | 7 | 5 | 10 | 91 | |||||||
Singletons | 0 | 1 | 1 | 1 | 0 | 1 | 0 | 2 | 1 | 1 | 1 | 0 | 0 | 9 | |||||||
Number of positive BAC clones | 45 | 68 | 38 | 28 | 47 | 52 | 32 | 43 | 37 | 33 | 37 | 22 | 56 | 538 | |||||||
Anchored to Physical Map (FPC): | |||||||||||||||||||||
To Contigs | 6 | 10 | 7 | 7 | 6 | 9 | 5 | 7 | 5 | 5 | 7 | 4 | 10 | 88 | |||||||
Only to Singletons | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 2 | 1 | 1 | 0 | 7 | |||||||
SNP | |||||||||||||||||||||
Total Analyzed | 9 | 5 | 7 | 9 | 5 | 11 | 12 | 9 | 10 | 6 | 9 | 4 | 96 | ||||||||
Non-Anchored a | 1 | 0 | 0 | 1 | 3 | 4 | 2 | 2 | 1 | 1 | 3 | 2 | 20 | ||||||||
Anchored to BACs | 8 | 5 | 7 | 8 | 2 | 7 | 10 | 7 | 9 | 5 | 6 | 2 | 76 | ||||||||
Contigs | 7 | 5 | 5 | 6 | 1 | 3 | 9 | 6 | 7 | 5 | 5 | 2 | 61 | ||||||||
Singletons | 1 | 0 | 2 | 2 | 1 | 4 | 1 | 1 | 2 | 0 | 1 | 0 | 15 | ||||||||
Number of positive BAC clones | 34 | 23 | 24 | 29 | 5 | 19 | 46 | 24 | 33 | 23 | 30 | 14 | 304 | ||||||||
Anchored to Physical Map (FPC): | |||||||||||||||||||||
To Contigs | 8 | 5 | 6 | 7 | 1 | 4 | 10 | 6 | 9 | 4 | 6 | 2 | 68 | ||||||||
To Singletons | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 1 | 0 | 1 | 0 | 1 | 0 | 0 | 4 | ||||||||
SSR | |||||||||||||||||||||
Total Analyzed | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 2 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 2 | ||||||||
Anchored to BACs | 2 | 2 | |||||||||||||||||||
Contigs | 1 | 1 | |||||||||||||||||||
Singletons | 1 | 1 | |||||||||||||||||||
Number of positive BAC clones | 3 | 3 | |||||||||||||||||||
Anchored to Physical Map (FPC): | |||||||||||||||||||||
To Contigs | 1 | 1 | |||||||||||||||||||
To Singletons | 1 | 1 | |||||||||||||||||||
TOTAL: | 215 | 37 | 178 | 153 | 25 | 845 | 157 | 12 |