Table 1 RT-PCR validation of selected genes from the microarray

Tmem97

7080099

1.52

(p = 0.021)

2.60

(p < 0.01)

1.59

(p = 0.42)

1.73

(p = 0.072)

Npc1l1

-

1.00

(p = 1.00)

1.27

(p = 0.49)

1.22

(p = 0.16)

0.88

(p = 0.72)

Abcb1a

7250393

0.82

(p = 0.91)

0.83

(p = 0.77)

0.72

(p = 0.09)

0.65

(p < 0.01)

Cyp1a1

7336681

2.98

(p = 0.93)

1.12

(p = 0.64)

2.06

(p < 0.01)

0.78

(p = 0.89)

Cyp3a23/3a1

7100149

1.83

(p = 0.12)

1.30

(p = 1.00)

BDL

BDL

Fdft1

7139070

1.36

(p = 0.11)

2.58

(p = 0.22)

1.02

(p = 0.99)

2.41

(p = 0.018)

Hmgcr

7202670

2.05

(p < 0.01)

1.52

(p = 0.30)

1.14

(p = 0.80)

1.18

(p = 0.48)

Slc39a4

7329323

2.71

(p = 0.59)

2.92

(p < 0.01)

2.20

(p < 0.01)

1.99

(p < 0.01)

Sqle

7317317

1.80

(p < 0.01)

2.66

(p = 0.034)

1.71

(p = 0.50)

1.59

(p = 0.056)

Ugt2b36 (Ugt2b4)

7117373

0.85

(p = 0.047)

0.76

(=0.41)

0.39

(p = 0.21)

0.62

(p = 1.00)

Microarray

Mean Log2

Measurements

RL

RD

RJ

RIL

Tmem97

7080099

1.92

(p < 0.01)

2.03

(p < 0.01)

1.82

(p < 0.01)

2.15

(p < 0.01)

Abcb1a

7250393

0.63

(p < 0.01)

0.66

(p < 0.01)

0.65

(p < 0.01)

0.70

(p = 0.01)

Cyp1a1

7336681

2.29

(p < 0.01)

1.23

(p = 0.35)

1.71

(p = 0.02)

0.67

(p = 0.03)

Cyp3a23/3a1

7100149

1.69

(p < 0.01)

0.98

(p = 0.81)

1.05

(p = 0.50)

1.04

(p = 0.58)

Fdft1

7139070

1.38

(p < 0.01)

1.98

(p < 0.01)

1.42

(p < 0.01)

1.55

(p < 0.01)

Hmgcr

7202670

1.97

(p < 0.01)

1.64

(p < 0.01)

1.17

(p = 0.14)

1.38

(p < 0.01)

Slc39a4

7329323

2.81

(p < 0.01)

1.89

(p < 0.01)

1.65

(p < 0.01)

1.68

(p < 0.01)

Sqle

7317317

1.83

(p < 0.01)

2.27

(p < 0.01)

1.72

(p < 0.01)

1.70

(p < 0.01)

Ugt2b36 (Ugt2b4)

7117373

0.96

(p = 0.86)

0.57

(p < 0.01)

0.37

(p < 0.01)

1.00

(p = 0.97)