Skip to main content

Table 2 Start and stop codons used in mitochondrial protein-coding genes

From: Comparing the mitochondrial genomes of Wolbachia-dependent and independent filarial nematode species

 

Wolbachia-dependent species

Wolbachia-independent species

 

B. malayi

D. immitis

O. volvulus

W. bancrofti

A. viteae

L. loa

O. flexuosa

C. quiscali

S. digitata

ND2

TTA/T

ATT/TAG

ATT/TAG

TTA/T

TTT/TAG

ATT/TAA

ATT/TAG

ATT/TAG

TTT/TAG

ND4

TTG/TAA

TTG/TAG

TTG/TAA

TTG/TAA

ATG/TAA

TTG/TAG

TTG/TAG

TTG/TAA

ATG/TAA

COX1

ATT/TAG

ATT/TAG

ATT/TAG

ATT/TAA

GTT/T

GTT/T

ATT/TAA

TTG/TAA

ATT/TAG

ND6

TAT/TAA

TAT/TAG

ATT/TAG

TGT/TAA

TAT/TAG

TAT/TAG

ATT/TAA

TTG/TAG

TTG/TAA

CYTB

ATT/T

GTT/T

ATT/TAA

ATT/T

TCT/T

ATT/T

ATT/TAA

ATT/T

GTT/T

COX3

ATT/TAA

ATT/TAA

ATT/TAA

ATT/TAA

ATT/TAA

ATT/TAA

ATT/TAG

ATT/TAA

ATA/T

NDL4

GTA/TAA

GTA/TAA

TTG/TAA

GTA/TAA

GTA/T

GTA/T

TTA/T

GTT/TAA

TTG/T

ND1

TTG/T

TTG/T

TTG/T

TTG/TAA

TTG/T

TTG/T

TTG/T

TTG/T

TTG/TAA

ATP6

ATT/TAG

TTG/TAA

ATT/TAG

ATT/TAG

ATT/TAA

ATT/TAA

ATT/TAA

ATT/TAG

TTT/TAG

COX2

ATT/TAA

ATT/T

ATT/TA

ATT/TAA

ATT/TAA

ATT/TAA

ATT/TAA

ATT/TAA

ATT/TAG

ND3

CTT/TAG

CTT/T

CTT/TAG

CTT/T

CTT/T

CTT/T

CCT/T

CTT/TAG

TTT/T

ND5

TTT/TAG

TTG/TAG

TTG/TAG

TTT/TAG

TTT/TAG

TTT/TAG

TTA/TAA

TTT/T

TTT/TAG

  1. Information was taken from previous studies for B. malayi[24], D. immitis[23], O. volvulus[22], and S. digitata[25]. Information regarding the Wolbachia status of species from various subfamilies is reported in [2].