Table 3 List of genes that were differentially expressed in biofilms and in vivo
In vivoexperiments [Ref] | 4 h-static biofilm | 6 h-static biofilm | Drip-flow biofilm | |||
|---|---|---|---|---|---|---|
Up | Down | Up | Down | Up | Down | |
Experimental Infections [38] | ||||||
APL_0322 | √ |  |  |  |  |  |
APL_0375 |  |  |  |  |  | √ |
APL_0486 |  | √ |  | √ |  |  |
APL_0575 |  |  | √ |  |  |  |
APL_0668 |  | √ |  |  |  | √ |
APL_0740 |  |  |  | √ | √ |  |
APL_0771 |  | √ |  | √ |  |  |
APL_0971 |  |  |  | √ |  |  |
APL_1169 |  |  |  |  | √ |  |
APL_1285 |  |  |  |  |  | √ |
APL_1379 |  |  |  |  |  | √ |
APL_1385 |  |  | √ |  |  |  |
APL_1597 |  |  |  |  |  | √ |
APL_1674 |  |  |  | √ |  |  |
APL_1721 |  |  |  |  | √ |  |
APL_1759 |  |  |  |  | √ |  |
APL_1769 |  |  |  |  | √ |  |
APL_1781 |  |  |  |  | √ |  |
APL_1782 |  |  |  |  | √ |  |
APL_1785 |  |  |  |  | √ |  |
APL_1793 |  |  | √ |  |  |  |
Natural Infection [20] | ||||||
Up-regulated | Â | Â | Â | Â | Â | Â |
APL_0163 |  |  |  |  |  | √ |
APL_0339 |  |  |  |  |  | √ |
APL_0375 |  |  |  |  |  | √ |
APL_0450 |  |  |  |  |  | √ |
APL_0668 |  | √ |  |  |  | √ |
APL_0815 |  |  |  | √ |  |  |
APL_0920 |  |  | √ |  |  |  |
APL_1494 |  |  |  |  |  | √ |
APL_1665 | √ |  |  |  |  |  |
APL_2011 |  |  |  | √ |  |  |
APL_2025 |  |  | √ |  |  |  |
APL_2026 |  |  | √ |  |  |  |
Down-regulated | Â | Â | Â | Â | Â | Â |
APL_0226 |  |  |  | √ | √ |  |
APL_0333 |  |  |  |  |  | √ |
APL_0615 |  |  |  |  |  | √ |
APL_0630 |  |  |  |  |  | √ |
APL_0644 |  |  |  | √ |  |  |
APL_0682 |  |  |  |  | √ |  |
APL_0771 |  | √ |  | √ |  |  |
APL_0903 |  |  | √ |  |  |  |
APL_0967 |  |  | √ |  |  |  |
APL_0982 |  |  | √ |  | √ |  |
APL_1136 |  |  |  |  |  | √ |
APL_1169 |  |  |  |  | √ |  |
APL_1292 |  |  | √ |  |  |  |
APL_1388 | √ |  | √ |  |  |  |
APL_1450 |  |  |  | √ |  |  |
APL_1474 |  |  |  |  | √ |  |
APL_1558 |  |  |  |  | √ | √ |
APL_1597 | Â | Â | Â | Â | Â | Â |
APL_1759 |  |  |  |  | √ |  |
APL_1782 |  |  |  |  | √ |  |
APL_1962 |  |  |  |  | √ |  |