Table 2 Candidate genes implicated in regulating functional deficit and CNS vascular permeability in fatal BBB disruption

Nt5c1b

12

5.27

10376779-10396979 (+)

Rdh14

12

5.29

10397586-10402368 (+)

1700034J04Rik

12

5.58

11228267-11229010 (-)

4930511A02Rik

12

5.58

11445039-11451618 (+)

Gen1

12

5.58

11247732-11272593 (-)

Kcns3

12

5.58

11097008-11157648 (-)

Msgn1

12

5.58

11215188-11215754 (-)

Rad51ap2

12

5.58

11462885-11469734 (+)

Smc6

12

5.58

11272692-11326591 (+)

Vsnl1

12

5.58

11332053-11443455 (-)

Fam49a

12

5.63

12268945-12383165 (+)

Gm17337

12

6

12794791-12801091 (+)

4930519A11Rik

12

6.11

12909526-12914057 (+)

Mycn

12

6.14

12942902-12948720 (-)

Ddx1

12

6.4

13226113-13255980 (-)

Nbas

12

6.45

13275933-13590616 (+)

Fam84a

12

6.93

14154405-14158844 (-)

Gm16497

12

7.03

14268340-14292490 (+)

Trib2

12

7.3

15798533-15823683 (-)

Gm5432

12

7.28

15823809-15894961 (+)

Lpin1

12

7.9

16542475-16596576 (-)

Ntsr2

12

7.98

16660276-16667042 (+)

Greb1

12

8

16677421-16807692 (-)

2410004P03Rik

12

8.04

17011764-17018360 (-)

E2f6

12

8.04

16817771-16833549 (+)

Kcnf1

12

8.04

17178906-17183694 (-)

Pqlc3

12

8.04

16995454-17007214 (-)

Rock2

12

8.04

16901784-16995080 (+)

Atp6v1c2

12

8.06

17291527-17336165 (-)

Pdia6

12

8.06

17273351-17291576 (+)

Nol10

12

8.07

17355299-17436901 (+)

Mir3066

12

8.08

17362198-17362280 (+)

Gm19657

12

8.09

17436584-17441442 (-)

Odc1

12

8.11

17551679-17558308 (+)

Pde10a

17

4.96

8718237-9179513 (+)

1700010I14Rik

17

5.53

9181198-9201184 (+)

6530411M01Rik

17

5.97

9340584-9360701 (-)

Gm17728

17

7.33

9614925-9615323 (+)

Gm17748

17

7.33

9614805-9622259 (-)

Pabpc6

17

7.47

9859362-9862569 (-)

Qk

17

7.75

10399336-10512226 (-)

A230009B12Rik

17

7.8

10649082-10685921 (+)

Gene

Chr

cM

Genome Coordinates

Gm10513

17

7.8

11918744-11925211 (-)

Gm16168

17

7.8

10689312-10762262 (+)

Gm16169

17

7.8

11000700-11019491 (+)

Pacrg

17

7.8

10595878-11033177 (-)

Park2

17

7.8

11033250-12256227 (+)

Agpat4

17

8.33

12311570-12412511 (+)

Map3k4

17

8.42

12420487-12511526 (-)

4732491K20Rik

17

8.5

12511751-12520116 (+)

Plg

17

8.5

12571475-12612250 (+)

Slc22a3

17

8.52

12612838-12700570 (-)

C030013G03Rik

17

8.56

12659710-12672444 (+)

Slc22a2

17

8.61

12777055-12821331 (+)

Slc22a1

17

8.63

12841740-12868704 (-)

Igf2r

17

8.64

12875272-12962530 (-)

Airn

17

8.66

12934177-13052988 (+)

Gm19270

17

8.66

12926941-12946579 (+)

Gm17592

17

8.69

13030801-13031000 (-)

Mas1

17

8.69

13033945-13061009 (-)

Mrgprh

17

8.7

13068900-13070708 (+)

Pnldc1

17

8.71

13081768-13102866 (-)

Acat3

17

8.72

13116699-13133268 (-)

Mrpl18

17

8.72

13104215-13109211 (-)

Snora20

17

8.72

13115723-13115783 (+)

Tcp1

17

8.72

13108567-13117933 (+)

Acat2

17

8.73

13135756-13153613 (-)

Wtap

17

8.73

13159662-13185412 (-)

Sod2

17

8.75

13200705-13210985 (+)

Gpr31b

17

8.76

13244187-13245146 (-)

Tcp10b

17

8.76

13253970-13275347 (+)

Gm11166

17

8.78

13289526-13291338 (-)

Unc93a

17

8.78

13301483-13324657 (-)

Gm10512

17

8.81

13397908-13399077 (+)

Smok2a

17

8.82

13414054-13420524 (+)

Smok2b

17

8.82

13421718-13430055 (+)

Tcp10c

17

8.86

13547438-13570089 (+)

Rnu6

17

8.88

13624899-13625005 (-)

2700054A10Rik

17

8.9

13675419-13898832 (-)

Tcte2

17

8.9

13675419-13898832 (-)

Gm16050

17

8.91

13695065-13704059 (+)

Gm8603

17

8.91

13709618-13711010 (+)

Smok4a

17

8.91

13714322-13721299 (+)

4930488N24Rik

17

8.95

14238826-14243457 (-)

Dact2

17

8.95

14332238-14340838 (-)

Gm16046

17

8.95

13812667-13820523 (-)

Gm16049

17

8.95

13896413-13897375 (-)

Gm16052

17

8.95

13896377-13896992 (-)

Gm7168

17

8.95

14085380-14087685 (+)

Gm7356

17

8.95

14137246-14138709 (-)

Gm7358

17

8.95

14195012-14196538 (-)

Mllt4

17

8.95

13897546-14043157 (+)