From: Genomic reconstruction of transcriptional regulatory networks in lactic acid bacteria
Genome | TFs | Target genes | Target operons | Regulatory interactions | |
---|---|---|---|---|---|
Streptococcaceae | L. lactis cremoris SK11 | 36 | 255 | 125 | 130 |
L. lactis lactis Il1403 | 34 | 244 | 128 | 138 | |
S. thermophilus CNRZ1066 | 30 | 263 | 125 | 141 | |
S. agalactiae 2603 V/R | 38 | 340 | 159 | 186 | |
S. uberis 0140 J | 42 | 330 | 156 | 183 | |
S. equi MGCS10565 | 42 | 334 | 143 | 167 | |
S. dysgalactiae GGS_124 | 43 | 356 | 160 | 189 | |
S. pyogenes M1 GAS | 40 | 319 | 150 | 180 | |
S. gallolyticus UCN34 | 41 | 328 | 167 | 199 | |
S. mutans UA159 | 41 | 317 | 147 | 173 | |
S. suis 05ZYH33 | 43 | 366 | 145 | 173 | |
S. mitis B6 | 35 | 305 | 148 | 174 | |
S. pneumoniae TIGR4 | 42 | 365 | 167 | 206 | |
S. gordonii CH1 | 41 | 312 | 167 | 194 | |
S. sanguinis SK36 | 43 | 339 | 163 | 191 | |
Total | 591 | 4773 | 2250 | 2624 | |
Non-overlapping 1 | 69 | 779 | 397 | 470 | |
Lactobacillaceae | L. sakei 23 K | 36 | 186 | 92 | 106 |
L. casei ATCC 334 | 41 | 226 | 110 | 120 | |
L. rhamnosus GG | 42 | 237 | 106 | 116 | |
L. delbrueckii ATCC BAA-365 | 18 | 69 | 36 | 37 | |
L. acidophilus NCFM | 27 | 165 | 80 | 90 | |
L. helveticus DPC 4571 | 21 | 91 | 53 | 55 | |
L. johnsonii NCC 533 | 26 | 145 | 78 | 87 | |
P. pentosaceus ATCC 25745 | 38 | 205 | 97 | 111 | |
L. brevis ATCC 367 | 39 | 217 | 112 | 128 | |
L. plantarum WCFS1 | 46 | 299 | 147 | 170 | |
L. fermentum IFO 3956 | 30 | 172 | 85 | 101 | |
L. reuteri JCM 1112 | 32 | 167 | 83 | 96 | |
O. oeni PSU-1 | 25 | 109 | 59 | 70 | |
L. mesenteroides ATCC 8293 | 32 | 202 | 89 | 103 | |
L. salivarius UCC118 | 31 | 198 | 86 | 96 | |
Total | 484 | 2688 | 1313 | 1486 | |
 | Non-overlapping 1 | 79 | 539 | 289 | 328 |