Skip to main content

Advertisement

Table 2 Gene list of the plastid genome in trebouxiophycean algal species

From: Plastid and mitochondrion genomic sequences from Arctic Chlorella sp. ArM0029B

  ArM0029B NC64 C. vulgaris Coccomyxa Trebouxiophyceae sp.
      MX-AZ01_NC_018569
accD o o o o o
atpA o o o o o
atpB o o o o o
atpE o o o o o
atpF o o o o o
atpH o o o o o
atpI o o o o o
ccsA o o o o o
cemA o o o o o
chlB o o o o o
chlI o o o o o
chlL o o o* o o
chlN o o o o o
clpP o o o o o
cysA o o o o o
cysT o o o o o
ftsH o o o o o*
infA o o o o o
minD o o o o o
petA o o o o o
petB o o o o o
petD o o o o o
petG o o o o o
petL o o o o o
psaA o o o o o
psaB o o o o o
psaC o o o o o
psaI o o o o o
psaJ o o o o o
psaM o o o o o
psbA o o* o o o*
psbB o o o o* o
psbC o o* o o o
psbD o o o o o
psbE o o o o o
psbF o o o o o
psbH o o o o o
psbI o o o o o
psbJ o o o o o
psbK o o o o o
psbL o o o o o
psbM o o o o o
psbN o o o o o
psbT o o o o o
psbZ o o o o o
rbcL o o o o o
rpl12 o o o o o
rpl14 o o o o o
rpl16 o o o o o
rpl19 o o o o o
rpl2 o o o o o
rpl20 o o o o o
rpl23 o o o o o
rpl32 o o o o o
rpl36 o o o o o
rpl5 o o o o o
rpoA o o o o o
rpoB o o o o o
rpoC1 o o o o o
rpoC2 o o o o o
rps11 o o o o o
rps12 o o o o o
rps14 o o o o o
rps18 o o o o o
rps19 o o o o o
rps2 o o o o o
rps3 o o o o o
rps4 o o o o o
rps7 o o o o o
rps8 o o o o o
rps9 o o o o o
tilS o o o o+ o+
tufA o o o o o
ycf1 o o o o o
ycf12 o o o o o
ycf20 o o o o o
ycf3 o o o o o
ycf4 o o o o o
ycf47 o o o o o
minE - - o - -
trnA (UGC) o o o o o
TrnC (GCA) o o o o o
trnD (GUC) o o o o o
trnE (UUC) o o o o o
trnF (GAA) o o o o o
trnG (UCC) o o o o o
trnG (GCC) oo oo oo o o
trnH (GUG) o o o o o
trnI (GAU) o o o o o
trnI (CAU) o o o o o
trnK (UUU) o o o o o
trnL (CAA) o o o o o
trnL (GAG) o o o o o
trnL (UAA) o* o* o* o o
trnL (UAG) o o o o o
trnM (CAU) oo oo oo oo oo
trnN (GUU) o o o o o
trnP (UGG) o o o o o
trnQ (UUG) o o o o o
trnR (ACG) o o o o o
trnR (UCU) o o o o o
trnR (CCG) o o o o o
trnR (CCU) - - - o o
trnS (GCU) o o o o o
trnS (GGA) o o o o o
trnS (UGA) o o o o o
trnT (UGU) o o o o o
trnT (GGU) o o o o o
trnV (UAC) o o oo o o
trnW (CCA) o o o o o
trnY (GUA) o o o o o
rrnL o o o* o o***
rrnS o o o o o
rrn5 o o o o o
  1. *gene containing one intron; **gene containing two introns; ***gene containing three introns; oo, 2 copies; +, fragmented gene.