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Table 3 Distribution of the mt protein-coding gene and trn gene among trebouxiophycean algae and chlorophycean algae

From: Plastid and mitochondrion genomic sequences from Arctic Chlorella sp. ArM0029B

  Trebouxiophyceae Chlorophyceae
  ArM0029B Prototheca Helicosporidium Coccomyxa MX-AZ01 Scenedesmus Dunaliella Gonium Chlamydomonas
atp1 o o o o o - - - -
atp4 o - o o o - - - -
atp6 o o o o o o - - -
atp8 o o o o o - - - -
atp9 o o o o o o - - -
cob o o o o o o o o o
cox1 o o o o o o o o o
cox2 o o o o o o - - -
cox3 o o o o o o - - -
nad1 o o o o o o o o o
nad2 o o o o o o o o o
nad3 o o o o o o - - -
nad4 o o o o o o o o o
nad4L o o o o o o - - -
nad5 o o o o o o o o o
nad6 o o o o o o o o o
nad7 o o o o o - - - -
nad9 o o o o o - - - -
rpl5 o - o o o - - - -
rpl6 o o o - - - - - -
rpl16 o o o o o - - - -
rps2 o o o o o - - - -
rps3 o o o o o - - - -
rps4 o o o o o - - - -
rps7 o o o o o - - - -
rps10 o o o o o - - - -
rps11 o o o - - - - - -
rps12 o o o o o - - - -
rps13 o o o o o - - - -
rps14 o o o o o - - - -
rps19 o o o o o - - - -
tatC o o o o o - - - -
size 65,049 55,328 49,343 65,497 74,423 42,781 28,331 15,993 15,758
tRNAs Trebouxiophyceae Chlorophyceae
  ArM0029B Prototheca Helicosporidium Coccomyxa MX-AZ01 Scenedesmus Dunaliella Gonium Chlamydomonas
trnA (UGC) o o o o o o _ _ _
trnC (GCA) o o o o o o _ _ _
trnD (GUC) o o o o o o _ _ _
trnE (UUC) o o o o o o _ _ _
trnF (GAA) o o o o o o _ _ _
trnG (GCC) o o _ o o _ _ _ _
trnG (UCC) o o o o _ o _ _ _
trnH (GUG) o o o o* o* o _ _ _
trnI (CAU) o o o o o _ _ _ _
trnI (GAU) o o o o o o _ _ _
trnI (UAU) _ _ _ _ _ o _ _ _
trnK (UUU) o o o o o o _ _ _
trnL (AAG) _ _ _ _ _ o _ _ _
trnL (CAA) o _ _ o o _ _ _ _
trnL (CAG) _ _ _ _ _ o _ _ _
trnL (UAA) o o o o o _ _ _ _
trnL (UAG) o o o o o _ _ _ _
trnM (CAU) oo oo oo oo o oo o oo o
trnN (GUU) o o o o o o _ _ _
trnP (UGG) o o o o _ o _ _ _
trnQ (UUG) o o o o o o o o o
trnR (ACG) o o o o _ o _ _ _
trnR (CCU) _ _ _ _ _ o _ _ _
trnR (UCU) o o o o o o _ _ _
trnS (GCU) o o o o* o* o _ _ _
trnS (GGA) _ _ _ _ _ o _ _ _
trnS (UGA) o o o o* o* _ _ _ _
trnT (UGU) o o o _ _ _ _ _ _
trnV (UAC) o o o o o o _ _ _
trnW (CCA) o o o o* o* o o o o
trnW (CUA) _ _ _ _ _ o _ _ _
trnY (GUA) o o o o o o _ _ _
Total number 27 26 25 26 23 27 3 4 3
  1. *gene containing intron; oo, 2 copies.