Table 1 Intron/Exon boundaries of human TXNRD1 and mouse Txnrd1 genes
From: Genomic organisation and alternative splicing of mouse and human thioredoxin reductase 1 genes
Exon Number TXNRD1/Txnrd1 | Intron Numbera TXNRD1/Txnrd 1 | Human TXNRD1 Gene | Mouse Txnrd1 Gene | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Â | Â | Â | Â | Exon size (bp) | Intron size (kb) | Sequence at intron/EXON/intron junctionb | Exon size (bp) | Intron size (kb) | Sequence at intron/EXON/intron junctionb |
1a | 1 | - | - | 42 | - | ctgcag TCCTGA--ATTCTTgt aagc | 112 | - | ccggagCCACTA--GTTCAT gtaagc |
1 | - | - | - | 279 | - | ctgcag TCCTGA--CATGTGgt aagt | - | - | Â |
2 | 2 | 1a | 1 | 110 | 1.86 | acacag AGGACG---TTGAAGgt agga | 107 | ND | ccacagAGGGGG------CTGAAGgtagga |
| Â | Â | 1 | - | - | 1.62 | Â | Â | Â | Â |
- | 3a | - | 2a | - | - | Â | 115 | ND | gctaagGTTCAT-------ACTAAGgtaagg |
3b | 3b | 2 | 2b | 341 | 25.56 | ccacag TGCTTT-----GGGCTGgt aagt | 338 | ND | ccacag TGCCCT-----GAGCTGgtaagt |
4 | 3 | 123 | 1.19 | ctttag GCTTAT-------GCTAAGgc aagg | 123 | ND | ctgcag CCGAAC-------GCTAAGgc aaga | ||
5 | 4 | 73 | 1.83 | ttccag GAGGCA-----GATGGGgt aagc | 73 | ND | tcccag GAGGCA-------GATGGGgt gagt | ||
6 | 5 | 120 | 2.46 | ttgtag GTCTTG-----AGACAGgt atga | 120 | 1.62 | ttgcag GTCTCG---------ACACAGgt gtgg | ||
7 | 6 | 153 | 1.76 | atacag TTAAGC-----ATTAAGgt aatt | 143 | 1.4 | acgcag TGAAGC-------ATTGTGgt aatt | ||
8 | 7 | 116 | 0.414 | tgttag GCAACA------CAGCAGgt aaag | 116 | 0.411 | ttgcag GCGACA--------CAGCAGgt gggt | ||
9 | 8 | 226 | 1.51 | ccccag TGATGA----ATTAAAgt aagt | 226 | 1.59 | ctccag TGATGA--------ACGAAAgt aagt | ||
10 | 9 | 93 | 9.29 | ttacag GTTGAA-----AATACGgt aagg | 93 | 0.559 | ttgtag ATTGAA---------AACACAgt aagg | ||
11 | 10 | 77 | 0.917 | tttcag GTGATG------TGAAAAgt aaga | 77 | 0.416 | ttttag GTGTTG----------CGAAAAgt aagg | ||
12 | 11 | 157 | 6.19 | ttgcag GACTGG-----GTCAAGgt gagt | 158 | 0.950 | ttgcag AACCGG-------GTCAAAgt gaga | ||
13 | 12 | 108 | 26.97 | aaacag TGTGAC----ATTGAGgt aagt | 109 | 0.094 | acacag TGTGAC-------ATTGAAgt aagt | ||
14 | 13 | 96 | 9.67 | tcttag GTTTAC-------GACAATgt aagt | 96 | 2.03 | ttccag GTTTAC---------GACGATgt aagt | ||
15 | 14 | 135 | 1.58 | ccttag GAACGT-----GCAGAGgt gggt | 135 | 3.126 | tcttag GAACGT---------GCAGAGgt gagt | ||
16 | 15 | 69 | 9.08 | ctgcag GTATTC-----GGTTAA 3'UT | 138 | ND | ctgcag ATATTC--------GGTGAAgt gcNg | ||