Skip to main content

Table 2 Confusion matrix. Fraction of samples of each phenotype class classified in any other class (row-wise mode). Non zero values are highlighted in bold (see Methods).

From: Microarray-based identification of antigenic variants of foot-and-mouth disease virus: a bioinformatics quality assessment

Genot.

RGD

RED

REG

S144

V144

S139N

S139T

RRD

RGN

RGV

H146P

RGG

L147P

S139G

H146R

S139I

RGE1

RGD

1.000

0.000

0.000

0.000

0.000

0.000

0.000

0.000

0.000

0.000

0.000

0.000

0.000

0.000

0.000

0.000

0.000

RED

0.000

1.000

0.000

0.000

0.000

0.000

0.000

0.000

0.000

0.000

0.000

0.000

0.000

0.000

0.000

0.000

0.000

REG

0.000

0.000

1.000

0.000

0.000

0.000

0.000

0.000

0.000

0.000

0.000

0.000

0.000

0.000

0.000

0.000

0.000

S144

0.000

0.000

0.000

1.000

0.000

0.000

0.000

0.000

0.000

0.000

0.000

0.000

0.000

0.000

0.000

0.000

0.000

V144

0.000

0.032

0.000

0.000

0.968

0.000

0.000

0.000

0.000

0.000

0.000

0.000

0.000

0.000

0.000

0.000

0.000

S139N

0.002

0.000

0.000

0.000

0.000

0.993

0.004

0.000

0.000

0.000

0.000

0.000

0.000

0.000

0.000

0.001

0.000

S139T

0.000

0.000

0.000

0.000

0.000

0.016

0.983

0.000

0.001

0.000

0.000

0.000

0.000

0.000

0.000

0.000

0.000

RRD

0.000

0.000

0.000

0.000

0.000

0.000

0.000

1.000

0.000

0.000

0.000

0.000

0.000

0.000

0.000

0.000

0.000

RGN

0.000

0.000

0.000

0.000

0.000

0.000

0.000

0.000

1.000

0.000

0.000

0.000

0.000

0.000

0.000

0.000

0.000

RGV

0.069

0.000

0.000

0.000

0.000

0.000

0.000

0.000

0.000

0.925

0.000

0.006

0.000

0.000

0.000

0.000

0.000

H146P

0.000

0.000

0.000

0.000

0.000

0.000

0.000

0.000

0.000

0.000

1.000

0.000

0.000

0.000

0.000

0.000

0.000

RGG

0.000

0.000

0.000

0.000

0.000

0.000

0.000

0.000

0.000

0.000

0.000

1.000

0.000

0.000

0.000

0.000

0.000

L147P

0.000

0.000

0.000

0.000

0.000

0.000

0.000

0.000

0.000

0.000

0.000

0.000

1.000

0.000

0.000

0.000

0.000

S139G

0.000

0.000

0.000

0.000

0.000

0.000

0.000

0.000

0.000

0.000

0.000

0.000

0.000

1.000

0.000

0.000

0.000

H146R

0.000

0.000

0.000

0.000

0.000

0.000

0.000

0.000

0.000

0.000

0.002

0.002

0.000

0.000

0.996

0.000

0.000

S139I

0.005

0.000

0.000

0.000

0.000

0.005

0.003

0.000

0.000

0.000

0.000

0.000

0.000

0.000

0.000

0.987

0.000

RGE1

0.001

0.000

0.000

0.000

0.000

0.000

0.068

0.002

0.002

0.000

0.000

0.000

0.000

0.000

0.000

0.000

0.927