Skip to main content

Table 2 Specific genes expressed in the male sexual organs

From: Housekeeping and tissue-specific genes in mouse tissues

                 Tissues from GEO and accession number    
Tag Testis Prostate Ovary Mammary gland Uterus Vagina Skin Liver Adipose tissue Lung Bone Skeletal muscle Cerebral cortex Hypothalamus Pituitary gland Mouse embryonic fibroblasts GSM7759 Heart normal GSM106587 Thymus normal GSM106587 Bladder normal GSM106599 Kidney normal GSM56242 Spleen normal GSM106591 Pancreas normal GSM 106592 Intestine UniGene and EST expression (%) Description [UniGene cluster, GenBank Accession No] General function
   Testis                          
TCGATGTCTGA 1221 0a 4a 0a 0a 0a 0a 1a 1a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0 protamine 2 [Mm.325769, NM_008933] Cell signaling
AGGACATCAGA 601 0a 2a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0 transition protein 1 [Mm.661, NM_009407] Cell signaling
AAACAGAGTCT 391 0a 2a 0a 0a 0a 0a 0a 1a 0a 1a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0 t-complex-associated testis expressed 3 [Mm.272173, NM_011560] Cell signaling
GTGCCAGGAGA 241 1a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a   NM Novel transcript
GGTCTGGCTGG 234 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0 tubulin, alpha 3 [Mm.287784, NM_009446] Cell signaling
GCTCCACTGGT 227 0a 0a 0a 0a 8 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0 diazepam binding inhibitor-like 5 [Mm.347413, BC048474] Cell signaling
ACCGCTGAGGA 222 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0 lactate dehydrogenase 3, C chain, sperm specific [Mm.16563, NM_013580] Energy metabolism
TGCAACTGGCC 201 0a 0a 0a 1a 2a 1a 0a 0a 1a 1a 0a 0a 2a 0a 0a 0a 0a 1a 0a 0a 0a 0 outer dense fiber of sperm tails 2 [Mm.330116, NM_013615] Cell defence
TTCCATCTCTG 190 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 1a 0a 0a 0a 0a 1a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0 ornithine decarboxylase antizym e 3 [Mm.331200, NM_016901] Amoni acid metabolism
TTTAGCCGAGA 180 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0 glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, sperm atogenic [Mm.1729, NM_008085] Energy metabolism
TACACGAGGAT 178 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0 transition protein 2 [Mm.206798, NM_013694] Cell signaling
GCCAGATACCG 139 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0 protamine 1 [Mm.42733, NM_013637] Cell signaling
GATTAAAGCTT 134 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0 transition protein 2 [Mm.206798, NM_013694] Cell signaling
GCGTGCTCAGA 132 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0 RIKEN cDNA 4921511K06 gene [Mm.251303, AK160245] Cytokinesis, cell shape, secretion and capping
TAGCCCCTGCA 125 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0 outer dense fiber of sperm tails 1 [Mm.252830, NM_008757] Cell defence
CCCTTTTTCAA 123 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0 sperm mitochondria-associated cysteine-rich protein [Mm.331192, NM_008574] Sperm motility
CAGGAACACGG 111 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a   NM Novel transcript
GTCGACCGATG 100 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 1a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0 meiosis expressed gene 1 [Mm.2688, CN833209] Potein binding
CAGCTCAAGTG 99 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 1a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0 ATPase, C lass I, type 8B, member 3 [Mm.52511, NM_026094] Energy metabolism, transport
CCAATTGCTAC 95 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0 histone H1-like protein in spermatids 1 [Mm.30482, NM_018792] Cell division
TCGGTGCCTCT 88 0a 2a 0a 0a 0a 1a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0 DnaJ (H sp40) homolog, subfamily B, member 3 [Mm.3075, NM_008299] Cell defence
GTGCTGGCTTG 88 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a   NM Novel transcript
ACACCCACGCG 83 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0 sperm atogenic Zip 1 [Mm.23520, NM_030237] Transcription factor activity
AAAAAGACCAA 81 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0 centrin 1 [Mm.195831, NM_007593] Cell structure
AAGGCCTGCCA 78 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0 chaperonin containing TC P1, subunit 4 [Mm.332809, BU962071] Cell protein synthesis
AACAATGTTGT 72 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 1a 0a 0a 1a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0 fatty acid binding protein 9, testis [Mm.26654, NM_011598] Lipid metabolism
TTCAGCAACGG 72 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 1a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0 t-complex protein 10b [Mm.326683, NM_011553] Cell signaling
TCTCGCAATGG 63 0a 0a 0a 0a 0a 0a 1a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0 tubby-like protein 2 [Mm.280778, NM_008807] Phosphoric diester hydrolase Activity
CTGGATGGTTT 60 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0 actin-like 7b [Mm.251434, NM_025271] Cell structure
ACCTGCAGCCT 58 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0 heat shock protein, alpha-crystallin-related, B9 [Mm.46175, XM_126494] Cell defence
AACAAAAATCC 58 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 3 0a 0a 0a 1a 1a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0 testis specific gene A2 [Mm.12743, NM_025290] Cell signaling
CGCGGAATGCT 56 0a 0a 0a 1a 0a 0a 1a 1a 0a 0a 0a 0a 0a 1a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0 PH D finger protein 7 [Mm.5348, BY099053] Protein synthesis
TCTTGCGGCGG 55 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 1a 0a 0a 0a 1a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0 DnaJ (H sp40) homolog, subfamily B, member 3 [Mm.3075, AK005688] Cell defence
GAGCAGGTCCA 48 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0 kinesin family member 2B [Mm.67677, XM_126653] Cell structure
TCTTCTGCCTC 46 1a 0a 0a 1a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0 serine/threonine kinase 22B (sperm iogenesis associated) [Mm.310201, NM_009436] Metabolism: protein modification
GTGTGCGGACC 44 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 2a 0a 0a 0a 0a 1a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0 sperm associated antigen 4 [Mm.81035, AK028080] Cell defence
AATCCATCCAG 44 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 1a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0 thioredoxin domain containing 2 (sperm atozoa) [Mm.255732, NM_153519] Cell defence
GCTCCTTTAAA 42 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0 cytochrome coxidase, subunit VIIIc [Mm.660, XM_354691] Energy metabolism
ACCTAGGCAGA 42 0 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0 testis specific gene A8 [Mm.143832, AB032764] Rhabdomere development and photoreceptor cell survival
CTAATCAGGAG 41 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0 thioredoxin reductase 1 [Mm.210155, NM_025499] Cell defence
CAAGAGCCTCA 41 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 1a 1a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0 selenoprotein W [Mm.212777, NM_175033] Cell defence
TGCCCCAACAT 41 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0 oxysterol binding protein 2 [Mm.348003, BC058602] Transport
CACGAAGTTCC 39 1a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 1a 0a 0a 0a 0a 1a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0 neighbor of Brca1 gene 1 [Mm.784, AF227188] Zing and ion binding
ATAGGATGCTG 37 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 1a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0 tudor domain containing 6 [Mm.329058, NM_198418] Oogenesis
GCTTGAAGCCT 35 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 1a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0 serine/threonine kinase 22A (sperm iogenesis associated) [Mm.347554, XM_147244] Metabolism: protein modification
GTGCCTACCTA 33 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0 1a 0a 0a 1a 1a 2a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0 Park2 co-regulated [Mm.18889, XM_128418] Sperm differentiation
TGGGTGAAGGG 33 1a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0 tripartite motif protein 17 [Mm.179733, NM_031172] Ubiquitin-protein ligase activity
GAAATCTTATG 33 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0 four and a half LIM domains 5 [Mm.87325, NM_021318] Transcription
GACAAGCAGAC 32 0a 0a 0a 0a 0a 0a 1a 0a 1a 0a 0a 0a 1a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0 translin-associated factor X (Tsnax) interacting protein 1 [Mm.28323, NM_024445] Protein binding
AGGGTGGACAA 30 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0 DnaJ (H sp40) homolog, subfamily B, member 8 [Mm.272871, NM_019964] Cell defence
GGCTCAATTTC 30 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 1a 0a 1a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0 StAR -related lipid transfer (STAR T) domain containing 6 [Mm.83623, BC061022] Cell signaling
TGTTCTTCACT 30 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 1a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0 sperm associated antigen 9 [Mm.260737, AK034670] Cell defence
CCCTGGGAGAC 30 0a 2a 0a 0a 0a 0a 0a 1a 1 0a 1a 1a 2a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0 sterile alpha motif domain containing 4 [Mm.269139, XM_127686] Post-transcriptional regulators
GTCGCTGTCTT 28 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 1a 0a 0a 0a 1a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0 fibronectin type 3 and ankyrin repeat domains 1 [Mm.87448, AK017071] Transcription factor activity and DNA binding
CCTTCTGTCGG 28 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0 t-complex protein 10b [Mm.326683, NM_009340] Cell signaling
GCTACGCTCAC 28 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0 dipeptidase 3 [Mm.173395, NM_027960] Protein synthesis
CAGACCAACGC 28 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 1a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0 testis specific 10 interacting protein [Mm.329659, AK019010] Cell signaling
ATGCCTTTCCA 26 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 1a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0 ankyrin repeat domain 5 [Mm.198389, NM_175667] Cell structure
AACAATATTTA 26 0a 0a 0a 1a 0a 0a 1a 0a 0a 1a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0 ubiquitin-conjugating enzyme E2N [Mm.328239, AK005788] Protein synthesis
GCTGCATAACA 26 0a 0a 0a 0a 0a 0a 3 1a 0a 0a 0a 1a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0 aquaporin 11 [Mm.29756, NM_175105] Transport
   Prostate                     0a      
ACCCAGACACG 0a 193 0a 0a 0a 0a 0a 1a 0a 0a 0a 0a 0a 1a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0 seminal vesicle protein, secretion 2 [Mm.99395, BB872622] Protein secretion
TGACAAAACGT 0a 99 0a 0a 0a 0a 0a 1a 0a 0a 0a 0a 0a 1a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0 beta-microseminoprotein [Mm.2540, NM_020597] Cell signaling
AAGACGGGTAG 0a 91 0a 0a 0a 0a 0a 1a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0 C U B and zona pellucida-like domains 1 [Mm.304207, BE852974] Cell signaling
GCAACTAGCCT 0a 66 0a 0a 0a 0a 0a 1a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0 serine peptidase inhibitor, Kazal type 3 [Mm.272, DV071569] Peptidase activity
GTGAGAAACAC 0a 52 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a   NM Novel transcript
TATTTTGCAAT 0a 49 0a 0a 0a 0a 0a 1a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0 seminal vesicle antigen [Mm.4119, NM_009299] Protein secretion
CCTGGTGAAAG 0a 45 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 1a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0a 0 mucin 10, submandibular gland salivary mucin [Mm.200411, NM_008644] Spermatogenesis
  1. a Significant difference vs. no. of tags show n in bold (p < 0,05)