Skip to main content

Table 1 Motifs overrepresented in CNSs over non-CNSs

From: Short sequence motifs, overrepresented in mammalian conserved non-coding sequences

Odd Chromosomes Even Chromosomes
Motif Number of occurrences Overrepre-sentation Motif Number of occurrences Overrepresen-tation
SYTAATTA 10620 3.45 TTAATTAV 12637 3.72
CTRATTAS 6152 3.14 TAATTRCW 12019 3.43
WGYAATTA 12596 3.09 GYAATTAS 6142 3.39
TTAATTAV 13141 3.08 TTTAATBA 15060 3.14
STAATTGV 8267 2.89 ATTAATBA 10910 3.07
VWGCTAAT 10503 2.84 TAATTWGM 10885 3.04
TTTAATBA 15800 2.77 GMWTAATT 9941 2.97
GMWTAATT 10290 2.72 CWTAATKA 10028 2.94
TAATTATV 10100 2.72 ATTAAWTT 11570 2.85
STTAATKG 5905 2.71 TTAATBAT 10115 2.79
ATTVAATT 12177 2.68 CWKTAATT 13079 2.75
ATTAATBA 11006 2.61 VWGCTAAT 9823 2.71
CWKTAATT 13577 2.59 CMATWAAT 10129 2.65
ATAATTAV 10536 2.58 ATTTVATT 15715 2.64
SMAATTAA 12754 2.57 CAATTRCH 8188 2.61
SBTAATGA 8828 2.56 MCWAATTA 9605 2.61
VATTWGCA 14265 2.53 ATTWWGCA 9959 2.61
TWAATCAR 10639 2.52 GKTAATTW 9019 2.59
AATTAVTT 12668 2.51 AATTAMCW 10053 2.58
GTAATTMM 7484 2.49 MATTDGCA 13694 2.58