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Table 1 Comparison of proteins deduced from the genes of X. oryzae phages Xop411, Xp10, and OP1.

From: Comparison of Genomes of Three Xanthomonas oryzae Bacteriophages

Xop411 Xp10 OP1 Xop411 with Xp10 Xop411 with OP1 Xp10 with OP1
Gene Length (aa) Gene Length (aa) Gene Length (aa) id (%)/aligned aa id (%)/aligned aa id (%)/aligned aa
p01 72 p01 72 ORF1 72 98/72 88/72 88/72
p02 101 p02 101 ORF2 101 90/101 81/80 75/79
   p03 154    61/134 (p17)a   65/134 (ORF31)b
       64/130 (p31.1)a   55/134 (ORF58)b
       61/134 (p42.1)a   
       63/142 (p55.1)a   
   p04 64    100/64 (p06)a   69/56 (ORF4)b
   p05 67 ORF3 65 - - 65/49 (ORF3)b
         51/35 (ORF58)b
p06 569 p06 561 ORF4 561 93/561 84/561 83/561
p07 432 p07 432 ORF5 432 99/432 98/432 98/432
p08 245 p08 245 ORF6 245 76/245 97/245 77/245
p09 390 p09 390 ORF7 390 98/390 97/390 98/390
p10 115 p10 115 ORF8 115 95/115 92/115 90/115
p11 124 p11 124 ORF9 125 96/124 96/123 98/123
p12 119 p12 119 ORF10 157 98/119 90/118 88/118
p13 118 p13 118 ORF11 118 96/118 91/118 94/118
p14 210 p14 210 ORF12 210 94/210 96/210 97/210
p15 100 p15 100 ORF13 100 95/100 88/100 89/100
p16 100 p16 100 ORF14 68 97/100 83/68 85/68
     ORF15 76   - -
     ORF16 510   - -
p17 169 p17 172    66/171 (p17)c 62/163 (ORF31)b 64/164 (ORF31)b
       65/164 (p50)c 51/168 (ORF58)b 57/169 (ORF58)b
       61/166 (p58)c   
       61/134 (p03)c   
p18 998 p18 998 ORF17 999 94/998 90/999 91/999
p19 118 p19 118 ORF18 117 98/118 96/117 94/117
p20 152 p20 152 ORF19 152 98/152 97/152 99/152
p21 130 p21 146 ORF20 146 99/130 95/130 95/146
p22 1573 p22 1574 ORF21 1571 97/1574 96/1573 96/1574
p23 96 p23 96 ORF22 100 66/96 97/96 67/96
p24 231 p24 230 ORF23 231 61/231 93/231 63/231
p25 123 p25 122 ORF24 123 97/109 96/109 95/109
p26 453 p26 498 ORF25 431 79/499 88/453 72/499
p27 69 p27 74 ORF26 69 100/62 97/69 96/62
p27.1 98 p28 223 ORF26.1d 98 93/43 96/98 96/31
p28 178 p28 223 ORF27 166 92/177 94/167 93/166
p29 111 p29 99 ORF28 111 81/77 90/111 81/79
p30 58 p30 63 ORF29 58 67/53 81/58 59/42
p31 293 p31 332 ORF30 288 71/289 77/289 80/289
p31.1 160    ORF31 167 71/157 (p50)c 68/158 (ORF31)b 69/163 (p50)c
       67/157 (p58)c 56/157 (ORF58)b 69/166 (p58)c
       65/155 (p17)c   64/164 (p17)c
       63/124 (p03)c   65/134 (p03)c
     ORF32 91   - -
p32 746 p32 746 ORF33 774 91/746 89/746 87/746
p33 255 p33 255 ORF34 188 94/255 74/189 75/189
p34 86 p34 172 ORF35 86 98/72 97/72 96/82
p35 245 p35 245 ORF36 279 100/245 97/270 97/245
p36 134 p36 135 ORF37 135 99/116 97/116 96/116
p37 309 p37 309 ORF38 309 97/309 94/309 94/309
p38 266 p38 201 ORF39 288 98/188 93/265 91/188
p39 793 p39 794 ORF40 793 98/794 95/792 95/792
   p40 139    100/112 (p41)a   97/113 (ORF41)b
p41 374 p41 261 ORF41 438 98/260 94/372 92/260
       100/112 (p40)c   97/113 (p40)c
p42 280 p42 280 ORF42 282 82/280 85/280 85/280
p42.1 167      68/165 (p17)c 65/163 (ORF31)b  
       65/164 (p58)c 58/164 (ORF58)b  
       66/163 (p50)c   
       61/134 (p03)c   
p43 53 p43 50 ORF43 81 81/49 - -
p44 222 p44 222 ORF44 255 89/222 78/222 81/222
p45 105 p45 104 ORF45 105 76/102 83/105 79/102
p46 73 p46 73 ORF46 73 71/73 72/73 84/73
   p47 67 ORF47 90 - - 67/67
p48 134 p48 138 ORF48 108 71/134 53/107 70/108
p49 179 p49 151 ORF49 161 80/150 59/159 63/151
   p50 174 ORF50 52 65/164 (p17)a - -
       70/162 (p31.1)a   69/163 (ORF31)b
       66/163 (p42.1)a   53/163 (ORF58)b
       66/168 (p55.1)a   
p51 141 p51 144 ORF51 142 80/140 86/141 74/140
p52 50 p52 50 ORF52 72 86/50 - -
p53 63 p53 78 ORF53 62 67/64 (p53)c 74/58 (ORF53)b 75/44 (p53)c
       43/55 (p17)c 42/42 (ORF31)b 50/36 (p58)c
       53/26 (p58)c 50/22 (ORF50)b 52/36 (p50)c
       44/43 (p50)c   45/37 (p17)c
p54 111 p54 111 ORF54 120 87/111 80/110 70/110
p55 56 p55 55 ORF55 35 67/55 62/37 88/35
p55.1 189      66/168 (p50)c 64/162 (ORF31)b  
       66/163 (p58)c 55/163 (ORF58)b  
       65/169 (p17)c   
       63/142 (p03)c   
p56 65 p56 75 ORF56 79 67/64 51/64 56/73
p57 114 p57 64 ORF57 132 - 65/102 -
p57.1 277      38/104 (p17)c 35/138 (ORF31)b  
       39/104 (p03)c 32/103 (ORF58)b  
       31/173 (p50)c   
       37/103 (p58)c   
p58 174 p58 167 ORF58 172 37/114 (p17)c 34/116 (ORF31)b 57/169 (p17)c
       35/122 (p50)c 35/110 (ORF58)b 56/167 (p58)c
       36/98 (p58)c   53/163 (p50)c
       35/98 (p03)c   55/134 (p03)c
   p59 124    - - -
p60 119 p60 119 ORF59 131 71/114 69/119 73/119
  1. a, b,and cindicate sequence comparison with a protein from Xop411, OP1, and Xp10 itself, respectively. d, predicted ORF in this study. Symbol -, no similarity was found.