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Table 1 Comparison of RCL sequences for bovSERPINA3s

From: An original SERPINA3 gene cluster: Elucidation of genomic organization and gene expression in the Bos taurus 21q24 region

bovSERPINA3-1 361 G T E G A A A T G I S M E R T I L R - - I I V R 382
bovSERPINA3-2 361 · · · · V · · · · · G I · · · F · · - - · · · · 382
bovSERPINA3-3 361 · · · · · · · · · · G I · · · F · · - - · · · · 382
bovSERPINA3-4 361 · · · · · · · · · · G I · · · F · · - - · · · · 382
bovSERPINA3-5 361 · · · · · · · · · · G I · · · F · · - - · · · · 382
bovSERPINA3-6 364 · · · · · · · · · · G I · · · F · · - - · · · · 385
bovSERPINA3-7 365 · · · · · · V · A V V · A T S S · L H T L T · S 388
Endopin 2B 365 · · · · · · V · A V V · A T S S · L H T L T · S 388
bovSERPINA3-8 366 · · · · · · · · · V K V G I T S I N N H · P L S 389
Endopin 2C 362 · · · · · · V · A V I · F T S L P L H A L N I S 385
  1. The potential RCL within the C-terminus loop is responsible for the specificity of inhibition. It was identified for the eight putative bovSERPINA3s by analogy with other serpins. Boxed residues in bold characters appeared to be more specific of inhibitory serpins [48]. The boxed arginine residue (R) for bovSERPINA3-1 to bovSERPINA3-6 could be the P1 residue for trypsin cleavage [33, 35]. The boxed threonine residue (T) for endopin2B could be the primarily P1 residue for elastase cleavage [49]. Numberings at the two extremities refer to positions in each full sequence. Dots indicate identical residues compared to those of bovSERPINA3-1 and dashes show gaps in the alignment.