Table 2 Comparison of putative dif sites in H. akashiwo chloroplast genomes with those of selected bacteria and viruses
| Â | XerC | Binding | Xer D |
|---|---|---|---|
#H. akashiwo 1 | ACTGAGCTAAT | AGCCCAACA | TTATGTTAAAT |
&H. akashiwo 2 | ATAGGCCTTCG | TCCCCT | TTATGTTAAAT |
&H. akashiwo 3 | ATTGAGGATCA | TTTTTG | TTATGTTAAAG |
%H. akashiwo 4 | AAAAACCAAAA | AATAAT | TTATGTTAAAG |
*E. coli | GGTGCGCATAA | TGTATA | TTATGTTAAAT |
*S. typhimurium | GGTGCGCATAA | TGTATA | TTATGTTAAAT |
*S. typhi | GGAGCGCATAA | TGTATA | TTATGTTAAAT |
*V. cholerae chr 1 | AGTGCGCATTA | TGTATG | TTATGTTAAAT |
*V. cholerae chr 11 | AATGCGCATTA | CGTGCG | TTATGTTAAAT |
*H. influenzae | ATTTCGCATAA | TATAAA | TTATGTTAAAT |
*B. subtilis | ACTTCCTAGAA | TATATA | TTATGTAAACT |
*ColE1 cer | GGTGCGTACAA | TTAAGGGA | TTATGGTAAAT |
*pSC101 psi | GGTGCGCGCAA | GATCC | TTATGTTAAAC |