Comparative mitochondrial genomics and phylogenetic relationships of the Crossoptilon species (Phasianidae, Galliformes)

Li, Xuejuan; Huang, Yuan; Lei, Fumin

doi:10.1186/s12864-015-1234-9

Table 1 Localisations and features of genes in the mitogenomes of three Crossoptilon species

From: Comparative mitochondrial genomics and phylogenetic relationships of the Crossoptilon species (Phasianidae, Galliformes)

Gene	Coding strand	*C. harmani*			*C. mantchuricum*			*C. crossoptilon*
Gene	Coding strand	From	To	Initiator/terminator	From	To	Initiator/terminator	From	To	Initiator/terminator
CR		1	1146		1	1146		1	1146
trnF	J	1147	1214		1147	1214		1147	1214
rrnS	J	1214	2178		1214	2179		1214	2178
trnV	J	2179	2251		2180	2252		2179	2251
rrnL	J	2252	3861		2253	3869		2252	3859
trnL(UUR)	J	3862	3935		3870	3943		3860	3933
nad1	J	3947	4921	ATG/TAA	3955	4929	ATG/TAA	3945	4919	ATG/TAA
trnI	J	4922	4993		4930	5001		4920	4991
trnQ	N	5000	5070		5008	5078		4998	5068
trnM	J	5070	5138		5078	5146		5068	5136
nad2	J	5139	6177	ATG/T	5147	6185	ATG/T	5137	6175	ATG/T
trnW	J	6178	6255		6186	6263		6176	6253
trnA	N	6262	6330		6270	6338		6260	6328
trnN	N	6334	6406		6342	6414		6332	6404
trnC	N	6409	6474		6417	6482		6407	6472
trnY	N	6474	6544		6482	6552		6472	6542
cox1	J	6546	8096	GTG/AGG	6554	8104	GTG/AGG	6544	8094	GTG/AGG
trnS(UCN)	N	8088	8162		8096	8170		8086	8160
trnD	J	8165	8233		8173	8241		8163	8231
cox2	J	8235	8918	ATG/TAA	8243	8926	ATG/TAA	8233	8916	ATG/TAA
trnK	J	8920	8990		8928	8997		8918	8988
atp8	J	8992	9156	ATG/TAA	8999	9163	ATG/TAA	8990	9154	ATG/TAA
atp6	J	9147	9830	ATG/TAA	9154	9837	ATG/TAA	9145	9828	ATG/TAA
cox3	J	9830	10613	ATG/T	9837	10620	ATG/T	9828	10611	ATG/T
trnG	J	10614	10682		10621	10689		10612	10680
nad3	J	10683	11034	ATG/TAA	10690	11041	ATG/TAA	10681	11032	ATG/TAA
trnR	J	11036	11104		11043	11111		11034	11102
nad4L	J	11105	11401	ATG/TAA	11112	11408	ATG/TAA	11103	11399	ATG/TAA
nad4	J	11395	12772	ATG/T	11402	12779	ATG/T	11393	12770	ATG/T
trnH	J	12773	12841		12780	12848		12771	12839
trnS(AGY)	J	12842	12907		12849	12914		12840	12905
trnL(CUN)	J	12908	12978		12915	12985		12906	12976
nad5	J	12979	14796	ATG/TAA	12986	14803	GTG/TAA	12977	14794	ATG/TAA
cytb	J	14803	15945	ATG/TAG	14810	15952	ATG/TAG	14801	15943	ATG/TAG
trnT	J	15947	16015		15954	16022		15945	16013
trnP	N	16018	16086		16025	16093		16016	16084
nad6	N	16092	16613	ATG/AGG	16100	16621	ATG/TAG	16090	16611	ATG/AGG
trnE	N	16615	16682		16623	16690		16613	16680

Back to article page

ISSN: 1471-2164

Contact us

Submission enquiries: bmcgenomics@biomedcentral.com
General enquiries: ORSupport@springernature.com

BMC Genomics

Contact us