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Table 2 The sheep and human germline TRAV repertoires

From: Sheep (Ovis aries) T cell receptor alpha (TRA) and delta (TRD) genes and genomic organization of the TRA/TRD locus

Subgroups

Sheep genes

Human genes

 

F

ORF

P

F

ORF

P

TRAV1

1

  

2

  

TRAV2

 

1

 

1

  

TRAV3

1

  

(1*)

 

(1*)

TRAV4

1

  

1

  

TRAV5

1

  

1

  

TRAV6

  

1

6

  

TRAV7

   

1

  

TRAV8

  

1

5

1

1

TRAV9

3

 

1

2

  

TRAV10

1

  

1

  

TRAV11

   

1

  

TRAV12

1

  

3

  

TRAV13

1

  

2

  

TRAV14/DV4

1

1

 

1

  

TRAV15

     

1

TRAV16

1

  

1

  

TRAV17

1

  

1

  

TRAV18

2

  

1

  

TRAV19

   

1

  

TRAV20

   

1

  

TRAV21

1

  

1

  

TRAV22

4

1

1

1

  

TRAV23/DV6

  

2

1

  

TRAV24

   

1

  

TRAV25

1

 

1

1

  

TRAV26

2

  

2

  

TRAV27

1

  

1

  

TRAV28

2

  

1

  

TRAV29/DV5

2

  

(1*)

 

(1*)

TRAV30

   

1

  

TRAV31

     

1

TRAV32

     

1

TRAV33

     

1

TRAV34

  

1

1

  

TRAV35

  

1

1

  

TRAV36/DV7

1

  

1

  

TRAV37

  

1

  

1

TRAV38/DV8

1

  

2

  

TRAV39

 

1

 

1

  

TRAV40

   

1

  

TRAV41

1

  

1

  

TRAV42

1

1

2

   

TRAV43

3

 

2

   

TRAV44

4

2

1

   

TRAV45

4

 

1

   

TOTAL

43

7

16

43(+2*) 1

8(+2*)

 
  1. *Functional or Pseudogene
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BMC Genomics

ISSN: 1471-2164

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