Table 5 Number of miRNAs copies in lung cancer cell lines
From: Novel method to detect microRNAs using chip-based QuantStudio 3D digital PCR
Sample | Assay | cel-mir-39 | CI- cel-mir-39 | Target miRNA | CI- miRNA | Data points above threshold (0.5) |
|---|---|---|---|---|---|---|
H1299 | 16–39 | 981,8 | 962,5 -- 1001,5 | 5025,6 | 4880,6 -- 5175 | 18,079 of 18,671 |
H1299 | 486-39 | 940,9 | 921,7 -- 960,6 | 17,1 | 15,1 -- 19,4 | 17,084 of 19,738 |
H1299 | 660-39 | 1.275,7 | 1252 -- 1299,8 | 112,7 | 107,5 -- 118,2 | 18,148 of 19,385 |
H1299 1:10 | 16–39 | 302,9 | 293,4 -- 312,8 | 439,3 | 427,4 -- 451,5 | 16,281 of 18,954 |
H1299 1:10 | 486-39 | 345,8 | 335,8 – 356,1 | 1,8 | 1,2 -- 2,6 | 17,328 of 18,723 |
H1299 1:10 | 660-39 | 334,3 | 324,4 -- 344,5 | 9,2 | 7,7 -- 10,9 | 16,976 of 18,096 |
A549 | 16–39 | 808,9 | 790,1 -- 828,3 | 2130,9 | 2087,6 -- 2175,1 | 14,270 of 19,057 |
A549 | 486-39 | 1309,6 | 1285,3 -- 1334,3 | 19,9 | 17,8 -- 22,3 | 18,008 of 19,310 |
A549 | 660-39 | 1403,2 | 1372,5 -- 1434,6 | 69 | 64,0 -- 74,0 | 12,610 of 17,988 |
A549 1:10 | 16–39 | 486,6 | 473,6 -- 499,9 | 483,4 | 470,5 -- 496,7 | 15,486 of 16,723 |
A549 1:10 | 486-39 | 401,3 | 379,9 -- 423,8 | 1,57 | 0,7 -- 3,5 | 17,285 of 18,655 |
A549 1:10 | 660-39 | 367,4 | 355,9 -- 379,5 | 5,36 | 4,1 -- 6,8 | 13,841 of 17,322 |
LT73 | 16–39 | 655,2 | 640,7 -- 670,1 | 3266,7 | 3200,2 -- 3334,5 | 18,070 of 19,251 |
LT73 | 486-39 | 921,1 | 902,2 -- 940,4 | 16,5 | 14,6 -- 18,8 | 17,170 of 18,120 |
LT73 | 660-39 | 574,0 | 558,7 -- 589,8 | 4,0 | 3,0 -- 5,3 | 13,606 of 19,582 |
LT73 1:10 | 16–39 | 90,4 | 85,5 -- 95,5 | 409,9 | 398,6 -- 421,5 | 16,673 of 18,990 |
LT73 1:10 | 486-39 | 66,8 | 62,7 -- 71,1 | 1,3 | 0,9 -- 2,1 | 17,359 of 18,326 |
LT73 1:10 | 660-39 | 60,8 | 57,0 -- 64,8 | 0,3 | 0,1 -- 0,8 | 18,164 of 19,404 |