AUC0.05 | Data set 1: (Qin 2010) | Data set 2: (Yatsunenko 2012) | ||||
---|---|---|---|---|---|---|
Group Size | 3 + 3 | 6 + 6 | 10 + 10 | 3 + 3 | 6 + 6 | 10 + 10 |
edgeR | 0.64 | 0.77 | 0.85 | 0.55 | 0.80 | 0.92 |
DESeq2 | 0.70 | 0.80 | 0.86 | 0.53 | 0.78 | 0.90 |
OGLM | 0.64 | 0.83 | 0.90 | 0.44 | 0.73 | 0.88 |
MetagenomeSeq | 0.29 | 0.68 | 0.87 | 0.41 | 0.70 | 0.86 |
Metastats | 0.19 | 0.74 | 0.79 | 0.18 | 0.66 | 0.84 |
Voom | 0.63 | 0.74 | 0.78 | 0.48 | 0.70 | 0.83 |
Sqrt t-test | 0.62 | 0.78 | 0.85 | 0.43 | 0.70 | 0.86 |
Log t-test | 0.63 | 0.76 | 0.79 | 0.44 | 0.69 | 0.84 |
t-test | 0.56 | 0.77 | 0.85 | 0.38 | 0.67 | 0.84 |
Welch t-test | 0.47 | 0.74 | 0.83 | 0.32 | 0.62 | 0.82 |
WMW | ----- | 0.75 | 0.83 | ----- | 0.66 | 0.84 |
Binomial | 0.40 | 0.46 | 0.48 | 0.33 | 0.51 | 0.67 |
GLM | 0.32 | 0.35 | 0.36 | 0.34 | 0.52 | 0.68 |
Fisher’s exact test | 0.32 | 0.35 | 0.36 | 0.33 | 0.51 | 0.67 |