Table 2 Preprocessing statistics
From: Enhanced whole exome sequencing by higher DNA insert lengths
Trimming R1 | Trimming R2 | Mapped | Joined | |||
|---|---|---|---|---|---|---|
Sample | reads | bases | reads | bases | reads | reads |
HG3CD5n_cl1 | 19,9 % | 9,0 | 22,4 % | 22,2 | 93,7 % | 80,5 % |
HG3CD5p_cl7 | 20,0 % | 8,8 | 22,4 % | 22,1 | 93,6 % | 82,4 % |
U2932R1 | 20,1 % | 8,9 | 22,1 % | 21,8 | 93,5 % | 81,9 % |
U2932R2 | 20,0 % | 8,9 | 22,6 % | 22,8 | 93,7 % | 80,1 % |
WAC3CD5n | 22,6 % | 8,9 | 20,0 % | 22,4 | 93,5 % | 80,6 % |
WAC3CD5p | 20,0 % | 9,0 | 22,4 % | 21,8 | 93,7 % | 81,6 % |
HG3CD5n_cl41 | 14,6 % | 12,8 | 12,7 % | 43,1 | 90,5 % | 38,0 % |
HG3CD5n_cl48 | 14,5 % | 12,6 | 12,5 % | 42,7 | 90,3 % | 47,1 % |
HG3CD5n_mix | 14,3 % | 12,5 | 12,1 % | 41,9 | 90,6 % | 50,8 % |
HG3CD5p_mix | 13,7 % | 12,3 | 11,9 % | 42,4 | 91,0 % | 46,8 % |
NCNC | 14,6 % | 12,7 | 12,4 % | 43,7 | 89,2 % | 43,8 % |
WAOSEL | 13,3 % | 15,9 | 10,3 % | 42,4 | 88,0 % | 44,4 % |