Skip to main content

Table 1 Summary of the mapping information for each sample

From: Whole blood transcriptional profiling comparison between different milk yield of Chinese Holstein cows using RNA-seq data

Sample name Total reads Total mapped Multiple mapped Uniquely mapped
L1 51313614 37633474 (73.34 %) 1891840 (3.69 %) 35741634 (69.65 %)
L2 38408586 28132542 (73.25 %) 1626290 (4.24 %) 26506252 69.01 %)
L3 38156116 23779230 (62.32 %) 1254082 (3.29 %) 22525148 (59.03 %)
L4 28642682 18996768 (66.32 %) 873594 (3.05 %) 18123174 (63.27 %)
L5 29417132 18996768 (64.58 %) 2319892 (7.89 %) 16676876 (56.69 %)
L6 34296982 24799284 (72.31 %) 1048878 3.06%) 23750406 (69.25 %)
L7 28755318 16604970 (57.75 %) 896548 (3.12 %) 15708422 (54.63 %)
L8 31712370 21846718 (68.89 %) 980318 (3.09 %) 20866400 (65.80 %)
L9 28387782 17806510 (62.73 %) 917208 (3.24 %) 16889302 (59.49 %)
L10 32217694 20532020 (63.73 %) 896152 (2.78 %) 19635868 (60.95 %)
H1 27038432 19212408 (71.06 %) 944260 (3.50 %) 18268148 (67.56 %)
H2 32458530 23913728 (73.67 %) 999786 (3.08 %) 22913942 (70.59 %)
H3 31355676 23459842 (74.82 %) 933980 (2.98 %) 22525862 (71.84 %)
H4 32236792 22698066 (70.41 %) 949798 (2.95 %) 21748268 (67.46 %)
H5 31144146 20791688 (66.76 %) 1004534 (3.23 %) 19787154 63.53 %)
H6 32072196 22910946 (71.44 %) 1293062 (4.04 %) 21617884 (67.40 %)
H7 38188984 25973682 (68.01 %) 1154850 (3.02 %) 24818832 64.99 %)
H8 32100360 23224306 (72.35 %) 945914 (2.95 %) 22278392 (69.40 %)
H9 30227962 20288464 (67.12 %) 997090 (3.30 %) 19291374 (63.82 %)
H10 29321524 19085218 (65.09 %) 1073550 (3.66 %) 18011668 (61.43 %)
H11 32631714 21820588 (66.87 %) 1021428 (3.13 %) 20799160 (63.74 %)
H12 26763546 14871754 (55.57 %) 748546 (2.80 %) 14123208 (52.77 %)
H13 28755192 16809674 (58.46 %) 870238 (3.03 %) 15939436 (55.43 %)