Table 1 Summary of the mapping information for each sample
Sample name | Total reads | Total mapped | Multiple mapped | Uniquely mapped |
|---|---|---|---|---|
L1 | 51313614 | 37633474 (73.34 %) | 1891840 (3.69 %) | 35741634 (69.65 %) |
L2 | 38408586 | 28132542 (73.25 %) | 1626290 (4.24 %) | 26506252 69.01 %) |
L3 | 38156116 | 23779230 (62.32 %) | 1254082 (3.29 %) | 22525148 (59.03 %) |
L4 | 28642682 | 18996768 (66.32 %) | 873594 (3.05 %) | 18123174 (63.27 %) |
L5 | 29417132 | 18996768 (64.58 %) | 2319892 (7.89 %) | 16676876 (56.69 %) |
L6 | 34296982 | 24799284 (72.31 %) | 1048878 3.06%) | 23750406 (69.25 %) |
L7 | 28755318 | 16604970 (57.75 %) | 896548 (3.12 %) | 15708422 (54.63 %) |
L8 | 31712370 | 21846718 (68.89 %) | 980318 (3.09 %) | 20866400 (65.80 %) |
L9 | 28387782 | 17806510 (62.73 %) | 917208 (3.24 %) | 16889302 (59.49 %) |
L10 | 32217694 | 20532020 (63.73 %) | 896152 (2.78 %) | 19635868 (60.95 %) |
H1 | 27038432 | 19212408 (71.06 %) | 944260 (3.50 %) | 18268148 (67.56 %) |
H2 | 32458530 | 23913728 (73.67 %) | 999786 (3.08 %) | 22913942 (70.59 %) |
H3 | 31355676 | 23459842 (74.82 %) | 933980 (2.98 %) | 22525862 (71.84 %) |
H4 | 32236792 | 22698066 (70.41 %) | 949798 (2.95 %) | 21748268 (67.46 %) |
H5 | 31144146 | 20791688 (66.76 %) | 1004534 (3.23 %) | 19787154 63.53 %) |
H6 | 32072196 | 22910946 (71.44 %) | 1293062 (4.04 %) | 21617884 (67.40 %) |
H7 | 38188984 | 25973682 (68.01 %) | 1154850 (3.02 %) | 24818832 64.99 %) |
H8 | 32100360 | 23224306 (72.35 %) | 945914 (2.95 %) | 22278392 (69.40 %) |
H9 | 30227962 | 20288464 (67.12 %) | 997090 (3.30 %) | 19291374 (63.82 %) |
H10 | 29321524 | 19085218 (65.09 %) | 1073550 (3.66 %) | 18011668 (61.43 %) |
H11 | 32631714 | 21820588 (66.87 %) | 1021428 (3.13 %) | 20799160 (63.74 %) |
H12 | 26763546 | 14871754 (55.57 %) | 748546 (2.80 %) | 14123208 (52.77 %) |
H13 | 28755192 | 16809674 (58.46 %) | 870238 (3.03 %) | 15939436 (55.43 %) |